MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	T	7	7	50	56	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015319	T	6	6	87	92	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015319	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015319	A	7	7	205	211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015319	A	6	6	265	270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015319	T	6	6	410	415	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
7	NC_015319	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
8	NC_015319	T	7	7	626	632	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
9	NC_015319	T	6	6	660	665	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
10	NC_015319	T	6	6	945	950	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
11	NC_015319	T	6	6	1045	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
12	NC_015319	T	6	6	1317	1322	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
13	NC_015319	A	8	8	1516	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
14	NC_015319	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
15	NC_015319	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
16	NC_015319	A	6	6	2221	2226	100 %	0 %	0 %	0 %	327399882
17	NC_015319	T	7	7	2315	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	327399882
18	NC_015319	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	327399883
19	NC_015319	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015319	A	6	6	2880	2885	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
21	NC_015319	A	7	7	3497	3503	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
22	NC_015319	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015319	A	7	7	4159	4165	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
24	NC_015319	A	6	6	4187	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
25	NC_015319	A	7	7	4638	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
26	NC_015319	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
27	NC_015319	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	327399887
28	NC_015319	A	7	7	5281	5287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015319	T	7	7	5317	5323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015319	T	6	6	5440	5445	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
31	NC_015319	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
32	NC_015319	A	7	7	5697	5703	100 %	0 %	0 %	0 %	327399889
33	NC_015319	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	327399890
34	NC_015319	T	7	7	6254	6260	0 %	100 %	0 %	0 %	327399891
35	NC_015319	A	6	6	6285	6290	100 %	0 %	0 %	0 %	327399891
36	NC_015319	T	7	7	6640	6646	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
37	NC_015319	T	7	7	6725	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
38	NC_015319	T	6	6	6787	6792	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
39	NC_015319	T	6	6	6942	6947	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
40	NC_015319	A	6	6	7053	7058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015319	A	6	6	7255	7260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015319	A	6	6	7280	7285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015319	A	6	6	7340	7345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015319	A	7	7	8000	8006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015319	A	6	6	8382	8387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015319	A	7	7	8409	8415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015319	A	7	7	8672	8678	100 %	0 %	0 %	0 %	327399894
48	NC_015319	A	6	6	8704	8709	100 %	0 %	0 %	0 %	327399894
49	NC_015319	T	7	7	9290	9296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015319	T	7	7	9416	9422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015319	C	6	6	9470	9475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_015319	T	6	6	9604	9609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015319	T	6	6	9632	9637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015319	A	6	6	9800	9805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015319	T	7	7	10087	10093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015319	T	7	7	10126	10132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015319	T	7	7	10165	10171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015319	T	8	8	10204	10211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015319	A	7	7	10326	10332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015319	A	7	7	10349	10355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015319	A	8	8	10945	10952	100 %	0 %	0 %	0 %	327399897
62	NC_015319	A	6	6	10986	10991	100 %	0 %	0 %	0 %	327399897
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64	NC_015319	T	6	6	12386	12391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_015319	T	6	6	16686	16691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015319	T	6	6	17950	17955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015319	T	7	7	18117	18123	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
70	NC_015319	T	6	6	18161	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
71	NC_015319	T	6	6	18213	18218	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
72	NC_015319	T	7	7	18312	18318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015319	T	6	6	18381	18386	0 %	100 %	0 %	0 %	327399905
74	NC_015319	T	7	7	19529	19535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015319	A	7	7	19582	19588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015319	A	6	6	19732	19737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_015319	A	6	6	20726	20731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015319	T	6	6	20799	20804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015319	T	6	6	20816	20821	0 %	100 %	0 %	0 %	327399907
83	NC_015319	A	7	7	21870	21876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_015319	T	7	7	22586	22592	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
89	NC_015319	T	7	7	22637	22643	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
90	NC_015319	T	6	6	23537	23542	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
91	NC_015319	T	6	6	23770	23775	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
92	NC_015319	A	6	6	23805	23810	100 %	0 %	0 %	0 %	327399910
93	NC_015319	A	6	6	23848	23853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015319	T	6	6	24214	24219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015319	T	6	6	24242	24247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015319	T	6	6	24449	24454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015319	T	7	7	24531	24537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015319	A	6	6	24699	24704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_015319	T	6	6	26135	26140	0 %	100 %	0 %	0 %	327399911
101	NC_015319	A	7	7	26612	26618	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
102	NC_015319	A	7	7	26637	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
103	NC_015319	A	7	7	26712	26718	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
104	NC_015319	A	7	7	26859	26865	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
105	NC_015319	A	6	6	27536	27541	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
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107	NC_015319	A	6	6	27852	27857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015319	T	6	6	28832	28837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015319	A	6	6	28897	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015319	T	6	6	29226	29231	0 %	100 %	0 %	0 %	327399915
111	NC_015319	T	7	7	29539	29545	0 %	100 %	0 %	0 %	327399915
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113	NC_015319	A	7	7	29862	29868	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
114	NC_015319	A	6	6	30202	30207	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
115	NC_015319	A	7	7	30437	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
116	NC_015319	T	7	7	30475	30481	0 %	100 %	0 %	0 %	327399916
117	NC_015319	T	7	7	30625	30631	0 %	100 %	0 %	0 %	327399917
118	NC_015319	T	6	6	30709	30714	0 %	100 %	0 %	0 %	327399917
119	NC_015319	A	6	6	30865	30870	100 %	0 %	0 %	0 %	327399917
120	NC_015319	A	6	6	30928	30933	100 %	0 %	0 %	0 %	327399917
121	NC_015319	T	8	8	31341	31348	0 %	100 %	0 %	0 %	327399917
122	NC_015319	A	6	6	31756	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
123	NC_015319	T	6	6	31835	31840	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
124	NC_015319	A	7	7	32092	32098	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
125	NC_015319	A	7	7	32132	32138	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
126	NC_015319	A	8	8	32187	32194	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
127	NC_015319	T	7	7	32230	32236	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
128	NC_015319	T	7	7	32242	32248	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
129	NC_015319	T	6	6	32850	32855	0 %	100 %	0 %	0 %	327399919
130	NC_015319	A	6	6	33144	33149	100 %	0 %	0 %	0 %	327399919
131	NC_015319	T	6	6	33180	33185	0 %	100 %	0 %	0 %	327399919

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.