MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	T	6	6	410	415	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
2	NC_015319	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
3	NC_015319	T	7	7	626	632	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
4	NC_015319	T	6	6	660	665	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
5	NC_015319	T	6	6	945	950	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
6	NC_015319	T	6	6	1045	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
7	NC_015319	T	6	6	1317	1322	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
8	NC_015319	A	8	8	1516	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
9	NC_015319	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
10	NC_015319	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
11	NC_015319	A	6	6	2221	2226	100 %	0 %	0 %	0 %	327399882
12	NC_015319	T	7	7	2315	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	327399882
13	NC_015319	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	327399883
14	NC_015319	A	6	6	2880	2885	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
15	NC_015319	A	7	7	3497	3503	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
16	NC_015319	A	7	7	4159	4165	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
17	NC_015319	A	6	6	4187	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
18	NC_015319	A	7	7	4638	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
19	NC_015319	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
20	NC_015319	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	327399887
21	NC_015319	T	6	6	5440	5445	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
22	NC_015319	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
23	NC_015319	A	7	7	5697	5703	100 %	0 %	0 %	0 %	327399889
24	NC_015319	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	327399890
25	NC_015319	T	7	7	6254	6260	0 %	100 %	0 %	0 %	327399891
26	NC_015319	A	6	6	6285	6290	100 %	0 %	0 %	0 %	327399891
27	NC_015319	T	7	7	6640	6646	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
28	NC_015319	T	7	7	6725	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
29	NC_015319	T	6	6	6787	6792	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
30	NC_015319	T	6	6	6942	6947	0 %	100 %	0 %	0 %	327399892
31	NC_015319	A	7	7	8672	8678	100 %	0 %	0 %	0 %	327399894
32	NC_015319	A	6	6	8704	8709	100 %	0 %	0 %	0 %	327399894
33	NC_015319	A	8	8	10945	10952	100 %	0 %	0 %	0 %	327399897
34	NC_015319	A	6	6	10986	10991	100 %	0 %	0 %	0 %	327399897
35	NC_015319	T	6	6	11893	11898	0 %	100 %	0 %	0 %	327399898
36	NC_015319	T	6	6	12614	12619	0 %	100 %	0 %	0 %	327399899
37	NC_015319	T	6	6	16349	16354	0 %	100 %	0 %	0 %	327399902
38	NC_015319	T	7	7	18117	18123	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
39	NC_015319	T	6	6	18161	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
40	NC_015319	T	6	6	18213	18218	0 %	100 %	0 %	0 %	327399904
41	NC_015319	T	6	6	18381	18386	0 %	100 %	0 %	0 %	327399905
42	NC_015319	T	6	6	19856	19861	0 %	100 %	0 %	0 %	327399906
43	NC_015319	T	6	6	20816	20821	0 %	100 %	0 %	0 %	327399907
44	NC_015319	T	7	7	22182	22188	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
45	NC_015319	T	6	6	22215	22220	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
46	NC_015319	T	7	7	22586	22592	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
47	NC_015319	T	7	7	22637	22643	0 %	100 %	0 %	0 %	327399909
48	NC_015319	T	6	6	23537	23542	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
49	NC_015319	T	6	6	23770	23775	0 %	100 %	0 %	0 %	327399910
50	NC_015319	A	6	6	23805	23810	100 %	0 %	0 %	0 %	327399910
51	NC_015319	T	6	6	25535	25540	0 %	100 %	0 %	0 %	327399911
52	NC_015319	T	6	6	26135	26140	0 %	100 %	0 %	0 %	327399911
53	NC_015319	A	7	7	26612	26618	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
54	NC_015319	A	7	7	26637	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
55	NC_015319	A	7	7	26712	26718	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
56	NC_015319	A	7	7	26859	26865	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
57	NC_015319	A	6	6	27536	27541	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
58	NC_015319	A	6	6	27755	27760	100 %	0 %	0 %	0 %	327399913
59	NC_015319	T	6	6	29226	29231	0 %	100 %	0 %	0 %	327399915
60	NC_015319	T	7	7	29539	29545	0 %	100 %	0 %	0 %	327399915
61	NC_015319	T	8	8	29751	29758	0 %	100 %	0 %	0 %	327399916
62	NC_015319	A	7	7	29862	29868	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
63	NC_015319	A	6	6	30202	30207	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
64	NC_015319	A	7	7	30437	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	327399916
65	NC_015319	T	7	7	30475	30481	0 %	100 %	0 %	0 %	327399916
66	NC_015319	T	7	7	30625	30631	0 %	100 %	0 %	0 %	327399917
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68	NC_015319	A	6	6	30865	30870	100 %	0 %	0 %	0 %	327399917
69	NC_015319	A	6	6	30928	30933	100 %	0 %	0 %	0 %	327399917
70	NC_015319	T	8	8	31341	31348	0 %	100 %	0 %	0 %	327399917
71	NC_015319	A	6	6	31756	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
72	NC_015319	T	6	6	31835	31840	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
73	NC_015319	A	7	7	32092	32098	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
74	NC_015319	A	7	7	32132	32138	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
75	NC_015319	A	8	8	32187	32194	100 %	0 %	0 %	0 %	327399918
76	NC_015319	T	7	7	32230	32236	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
77	NC_015319	T	7	7	32242	32248	0 %	100 %	0 %	0 %	327399918
78	NC_015319	T	6	6	32850	32855	0 %	100 %	0 %	0 %	327399919
79	NC_015319	A	6	6	33144	33149	100 %	0 %	0 %	0 %	327399919
80	NC_015319	T	6	6	33180	33185	0 %	100 %	0 %	0 %	327399919

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.