MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	GATATC	2	12	65611	65622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015318	CAAATC	2	12	68525	68536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015318	GTTAAT	2	12	137806	137817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015318	ATCAAA	2	12	155988	155999	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015318	TTTTCT	2	12	191067	191078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015318	AAAAGA	2	12	191706	191717	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015318	ACAAAG	2	12	193397	193408	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015318	AAGAAA	2	12	193677	193688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015318	AAAACA	2	12	193921	193932	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015318	TTTATT	2	12	262115	262126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015318	GAAAAA	2	12	375172	375183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015318	TGTCTT	2	12	393295	393306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015318	TGCAAG	2	12	404448	404459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015318	TTATGA	2	12	404799	404810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015318	AAATAA	2	12	410903	410914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015318	CTCTAT	2	12	573923	573934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015318	CAAATT	2	12	576516	576527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015318	TTTATT	2	12	624111	624122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015318	GTTTTT	2	12	626697	626708	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015318	AATTAT	2	12	726825	726836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015318	ATTTAA	2	12	732447	732458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015318	TGTTTT	2	12	904218	904229	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015318	TTTGGT	2	12	904293	904304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015318	TTTTTC	2	12	904460	904471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015318	CTTTGT	2	12	904742	904753	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015318	CTTTTT	3	18	905041	905058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015318	CTTGCA	2	12	961334	961345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015318	CTCCTT	2	12	984387	984398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015318	AAAAAT	2	12	1038945	1038956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015318	TAAAAA	2	12	1102286	1102297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015318	AAAAGA	2	12	1234617	1234628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015318	ACAAAG	2	12	1234921	1234932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015318	AAGAAA	2	12	1235201	1235212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015318	AAAACA	2	12	1235445	1235456	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015318	TTTATT	2	12	1256903	1256914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015318	CTCATT	2	12	1333684	1333695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015318	AGGATG	2	12	1336151	1336162	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015318	TTAAAA	2	12	1369350	1369361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015318	AAAATT	2	12	1378221	1378232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015318	GGTAAT	2	12	1396793	1396804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015318	TTGCAA	2	12	1545636	1545647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015318	TGTTTT	2	12	1579257	1579268	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015318	TTATGA	2	12	1579859	1579870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015318	TATCTA	2	12	1639251	1639262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015318	GATATC	2	12	1661417	1661428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015318	TTTTTC	2	12	1662468	1662479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015318	CTTTGT	2	12	1665197	1665208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015318	CTTTTT	3	18	1665496	1665513	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015318	AAAAGA	2	12	1685082	1685093	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015318	ACAAAG	2	12	1685386	1685397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015318	AAGAAA	2	12	1685666	1685677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015318	AAAACA	2	12	1685910	1685921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015318	CACTTA	2	12	1687750	1687761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.