MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	TAATA	2	10	13	22	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015318	ATTTA	2	10	51219	51228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015318	TATTT	2	10	57487	57496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015318	CGGGT	2	10	63111	63120	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015318	AGGTC	2	10	65020	65029	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015318	CAATC	2	10	67596	67605	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015318	TTCTT	2	10	68658	68667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015318	CAACT	2	10	75108	75117	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015318	CTTTT	2	10	75129	75138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015318	TTTTA	3	15	83687	83701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015318	TGTTT	2	10	111849	111858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015318	CTATA	2	10	128395	128404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015318	TTAAA	2	10	135257	135266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015318	AACAA	2	10	163439	163448	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015318	ATTAA	2	10	178366	178375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015318	CAAGG	2	10	179732	179741	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015318	TGTTT	2	10	180494	180503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015318	TTTAA	2	10	184943	184952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015318	TTTAA	2	10	190578	190587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015318	TTTTA	2	10	190647	190656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015318	CCAAA	2	10	191683	191692	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015318	GCTTT	2	10	202582	202591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015318	ATTTA	2	10	206258	206267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015318	TAAAA	2	10	213782	213791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015318	AGATA	2	10	256572	256581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015318	TCGTG	2	10	257780	257789	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015318	GGTTA	2	10	260821	260830	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015318	TGTTT	2	10	265289	265298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015318	GATTT	2	10	265313	265322	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015318	ACTTT	2	10	265476	265485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015318	AAAGA	2	10	321401	321410	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015318	ACACC	2	10	381605	381614	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_015318	TAAAT	2	10	384319	384328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015318	GTAAT	2	10	384422	384431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015318	ATTAG	2	10	394410	394419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015318	TTTAA	2	10	404120	404129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015318	GATTT	2	10	405596	405605	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015318	CGAAG	2	10	408670	408679	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015318	TCGGC	2	10	408688	408697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015318	AAATA	2	10	410754	410763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015318	TTTCA	2	10	411132	411141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015318	TAAAT	2	10	414917	414926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015318	CTTTT	2	10	421455	421464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015318	ATTTA	2	10	428079	428088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015318	TAATG	2	10	428156	428165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015318	CTTTT	2	10	438977	438986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015318	TGTAT	2	10	498496	498505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015318	ATCCA	2	10	498759	498768	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015318	AGTAA	2	10	529276	529285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015318	ATTTT	2	10	529337	529346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015318	ATATA	2	10	547321	547330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015318	GTAAA	2	10	574787	574796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015318	ATTTC	2	10	575239	575248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015318	ATTTT	2	10	575319	575328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015318	TACGC	2	10	576063	576072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015318	CTAAA	2	10	601897	601906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015318	TTAGG	2	10	624213	624222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015318	TCTCC	2	10	635618	635627	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_015318	GGAGA	2	10	655933	655942	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015318	TCGGC	2	10	675691	675700	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015318	GAATA	2	10	685277	685286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015318	ACAAA	2	10	696855	696864	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015318	AAATT	2	10	706294	706303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015318	GATAA	2	10	742405	742414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015318	ATTTA	2	10	784131	784140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015318	TCAAG	2	10	805690	805699	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015318	AAATT	2	10	819364	819373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015318	CCCGC	2	10	826216	826225	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_015318	AAAAT	2	10	833131	833140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015318	AATTA	2	10	848457	848466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015318	ATCAA	2	10	893551	893560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015318	CCAAC	2	10	903841	903850	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015318	TTTGG	2	10	905071	905080	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015318	AAATA	2	10	906989	906998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015318	CAAAA	2	10	932438	932447	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015318	AAAAG	2	10	957676	957685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015318	AAAGT	2	10	957839	957848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015318	TACCC	2	10	978495	978504	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015318	AAATA	2	10	1065937	1065946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015318	ACTTA	2	10	1081556	1081565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015318	TAATT	2	10	1081633	1081642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015318	CCTCC	2	10	1120011	1120020	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
83	NC_015318	AAAAG	2	10	1148132	1148141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015318	AAAGT	2	10	1148295	1148304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015318	TATGA	2	10	1152224	1152233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015318	TATTT	2	10	1234062	1234071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015318	CCAAA	2	10	1234594	1234603	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015318	AAAAG	2	10	1240427	1240436	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015318	AAAGT	2	10	1240591	1240600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015318	TAAAA	2	10	1259666	1259675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015318	AAAGG	2	10	1268395	1268404	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015318	CTAAC	2	10	1271704	1271713	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015318	ATTAA	2	10	1298348	1298357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015318	AACAT	2	10	1299370	1299379	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015318	TTAAT	2	10	1322428	1322437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015318	GTTTG	2	10	1332283	1332292	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015318	TAACC	2	10	1373838	1373847	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015318	CACGA	2	10	1376879	1376888	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015318	TTATC	2	10	1378086	1378095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015318	AAATT	2	10	1382800	1382809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015318	ATTTT	2	10	1415054	1415063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015318	AAATG	2	10	1421647	1421656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015318	TCCAA	2	10	1546942	1546951	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015318	AAAAG	2	10	1562608	1562617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015318	AAAGT	2	10	1562772	1562781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015318	AAATA	2	10	1565221	1565230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015318	CCAAC	2	10	1565864	1565873	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015318	TAAGT	2	10	1570018	1570027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015318	CCAAC	2	10	1578880	1578889	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_015318	ATTTA	2	10	1615350	1615359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015318	TATTT	2	10	1630226	1630235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015318	AAAAG	2	10	1630929	1630938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015318	AAAGT	2	10	1631093	1631102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015318	AGATA	2	10	1633251	1633260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015318	AGGTG	2	10	1634756	1634765	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015318	GTCTG	2	10	1637757	1637766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015318	TACTT	2	10	1639589	1639598	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015318	TCAAA	2	10	1639648	1639657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015318	TATTT	2	10	1639777	1639786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015318	GGTAA	2	10	1641784	1641793	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015318	TTATA	2	10	1651434	1651443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015318	AAATA	2	10	1651538	1651547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015318	AGGTC	2	10	1660826	1660835	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015318	AAAAG	2	10	1662979	1662988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015318	AAAGT	2	10	1663143	1663152	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015318	TTTGG	2	10	1665526	1665535	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015318	AAAAG	2	10	1682618	1682627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015318	AAAGT	2	10	1682782	1682791	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015318	CCAAA	2	10	1685059	1685068	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_015318	TTATC	2	10	1687297	1687306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.