MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 376

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	AGAA	2	8	1408	1415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015318	AAGC	2	8	51016	51023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015318	CAAC	2	8	51028	51035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015318	GCCA	2	8	51038	51045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015318	CCCG	2	8	63027	63034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015318	TACC	2	8	63095	63102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015318	GCTT	2	8	64084	64091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015318	TTTA	2	8	64109	64116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015318	CATT	2	8	64138	64145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015318	TTAA	2	8	64215	64222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015318	TGTC	2	8	64381	64388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015318	CAGA	2	8	64674	64681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015318	TTGT	2	8	65269	65276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015318	CTTG	2	8	65658	65665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015318	GGAA	2	8	67845	67852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015318	TTTA	2	8	83613	83620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015318	CATC	2	8	83634	83641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015318	TTAT	2	8	107509	107516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015318	TGTT	2	8	114090	114097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015318	CCCG	2	8	126958	126965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_015318	ATAC	2	8	131951	131958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015318	ATAA	2	8	131964	131971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015318	GAAA	2	8	147181	147188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015318	TGTT	2	8	147494	147501	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015318	GGGC	2	8	148208	148215	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015318	GGTT	2	8	148676	148683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015318	ATCG	2	8	148791	148798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015318	AAAG	2	8	148919	148926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015318	CCTC	2	8	151763	151770	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_015318	ATTG	2	8	163431	163438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015318	TAAT	2	8	179584	179591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015318	TGTA	2	8	181171	181178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015318	ATTT	2	8	187781	187788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015318	TTGT	2	8	187789	187796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015318	TAAA	2	8	188514	188521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015318	TTTA	2	8	188559	188566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015318	AGCA	2	8	191598	191605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015318	AGAA	2	8	191733	191740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015318	AAAG	2	8	193663	193670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015318	CTTA	2	8	194275	194282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015318	TGCT	2	8	201224	201231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015318	ACGC	2	8	201494	201501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015318	ATTT	2	8	201544	201551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015318	ATTT	2	8	206211	206218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015318	TAAG	2	8	227750	227757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015318	TTTG	2	8	227794	227801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015318	TCTT	2	8	256583	256590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015318	GAAC	2	8	256626	256633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015318	GCGT	2	8	257273	257280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015318	AAAT	2	8	258575	258582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015318	AAAG	2	8	259793	259800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015318	GTCC	2	8	260122	260129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015318	GTAG	2	8	260188	260195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015318	AGCC	2	8	261062	261069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015318	GACG	2	8	261396	261403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015318	ATGA	2	8	261575	261582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015318	CTTA	2	8	262090	262097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015318	AATA	2	8	264109	264116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015318	TAAA	2	8	265456	265463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015318	AAGG	2	8	265514	265521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015318	ACAT	2	8	294085	294092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015318	GCTT	2	8	294633	294640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015318	AGAA	2	8	296588	296595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015318	ACAA	2	8	347924	347931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015318	TTCA	2	8	364612	364619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015318	CCTT	2	8	368027	368034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015318	TCTT	2	8	377539	377546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015318	CACC	2	8	380778	380785	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_015318	TTTA	2	8	380875	380882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015318	TTTA	2	8	381313	381320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015318	TCTT	2	8	381373	381380	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015318	AATT	2	8	381672	381679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015318	ATTT	2	8	388679	388686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015318	CACC	2	8	393282	393289	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_015318	TGGT	2	8	394795	394802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015318	TAAA	2	8	394960	394967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015318	TCAA	2	8	397435	397442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015318	TCTT	2	8	398832	398839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015318	AAGA	2	8	398924	398931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015318	ATCT	2	8	399188	399195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015318	ATAA	2	8	399444	399451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015318	GATA	2	8	399507	399514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015318	CAGA	2	8	400123	400130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015318	CTTT	2	8	400350	400357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015318	TAAA	2	8	401612	401619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015318	ACCT	2	8	405553	405560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015318	TTCT	2	8	405908	405915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015318	CTTT	2	8	408525	408532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015318	AGAA	2	8	410989	410996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015318	AACC	2	8	411104	411111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015318	CAGG	2	8	411241	411248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015318	AAGC	2	8	411335	411342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015318	ATCT	2	8	429882	429889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015318	AATT	2	8	434616	434623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015318	TTAG	2	8	461732	461739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015318	CCAA	2	8	461756	461763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015318	TTAT	2	8	462093	462100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015318	ATTT	2	8	462237	462244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015318	GACT	2	8	465355	465362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015318	AAGT	2	8	465445	465452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015318	TTTG	2	8	465962	465969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015318	TATG	2	8	466068	466075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015318	ATTT	3	12	498548	498559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015318	TTCT	2	8	498744	498751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015318	AAAG	2	8	499189	499196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015318	ATTT	2	8	529449	529456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015318	TAGA	2	8	551244	551251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015318	AGGG	2	8	552666	552673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015318	CTCC	2	8	558390	558397	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015318	ATGG	2	8	558544	558551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015318	GTGA	2	8	558552	558559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015318	TTTA	2	8	559381	559388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015318	TGTT	2	8	573955	573962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015318	TCTA	2	8	573992	573999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015318	TTGC	2	8	574110	574117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015318	ATTA	2	8	574127	574134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015318	TCTG	2	8	574292	574299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015318	TTAA	2	8	574308	574315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015318	TGTT	2	8	574476	574483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015318	GTGA	2	8	575531	575538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015318	ATTA	2	8	590514	590521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015318	TTAA	2	8	600396	600403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015318	CTAC	2	8	601719	601726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015318	CCCA	2	8	601779	601786	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_015318	TAAC	2	8	611884	611891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015318	TATT	2	8	624626	624633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015318	ATTT	2	8	630212	630219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015318	AGAT	2	8	630271	630278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015318	ATTA	2	8	634300	634307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015318	TTAA	2	8	634312	634319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015318	TTTA	2	8	636769	636776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015318	TTAA	2	8	636976	636983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015318	TTAG	2	8	653097	653104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015318	TAGT	2	8	653136	653143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015318	CCAG	2	8	673231	673238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015318	GTTG	2	8	688694	688701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015318	AATA	2	8	692251	692258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015318	CAAA	2	8	692305	692312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015318	CCGC	2	8	694317	694324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_015318	AACT	2	8	696872	696879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015318	CTTT	2	8	705177	705184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015318	TAAA	2	8	720533	720540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015318	TTTG	2	8	729560	729567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015318	TCTT	2	8	733038	733045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015318	AATT	2	8	733153	733160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015318	GTTA	2	8	733231	733238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015318	TTTA	2	8	734291	734298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015318	TTTA	2	8	739424	739431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015318	TCCT	2	8	741858	741865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015318	ATTT	2	8	743557	743564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015318	ATTT	2	8	743611	743618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.