MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 21588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	TAG	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398174
2	NC_015318	ATT	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398174
3	NC_015318	TAA	2	6	249	254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
4	NC_015318	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398174
5	NC_015318	TGC	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398174
6	NC_015318	GAA	2	6	451	456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398174
7	NC_015318	GAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398174
8	NC_015318	GAT	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398174
9	NC_015318	GAA	3	9	620	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398174
10	NC_015318	ACC	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398174
11	NC_015318	TCG	2	6	753	758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398174
12	NC_015318	ATC	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398174
13	NC_015318	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398174
14	NC_015318	ATA	2	6	842	847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
15	NC_015318	TAA	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
16	NC_015318	ATC	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398174
17	NC_015318	CAA	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398174
18	NC_015318	TAA	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398174
19	NC_015318	AAC	3	9	1353	1361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398175
20	NC_015318	TTA	3	9	1448	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015318	AGG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015318	AAG	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
23	NC_015318	TAA	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
24	NC_015318	AGA	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
25	NC_015318	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
26	NC_015318	ATA	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
27	NC_015318	ATA	2	6	1694	1699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
28	NC_015318	GAA	2	6	1739	1744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
29	NC_015318	ATC	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398176
30	NC_015318	GCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398176
31	NC_015318	TAA	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398176
32	NC_015318	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398176
33	NC_015318	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398176
34	NC_015318	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398176
35	NC_015318	ATT	2	6	2556	2561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398176
36	NC_015318	CAT	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398177
37	NC_015318	AAT	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
38	NC_015318	AAT	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
39	NC_015318	GTT	2	6	2881	2886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398177
40	NC_015318	TAG	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398177
41	NC_015318	ATA	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
42	NC_015318	GTT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398177
43	NC_015318	TCA	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398177
44	NC_015318	CTT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398177
45	NC_015318	ATA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
46	NC_015318	GAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398177
47	NC_015318	AAC	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398177
48	NC_015318	ATA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398177
49	NC_015318	CAG	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398178
50	NC_015318	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398178
51	NC_015318	TGA	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
52	NC_015318	GGT	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398178
53	NC_015318	ATA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
54	NC_015318	GTT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
55	NC_015318	CAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398178
56	NC_015318	CTT	2	6	4161	4166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398178
57	NC_015318	AGA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
58	NC_015318	TGA	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
59	NC_015318	TCA	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398178
60	NC_015318	AAT	2	6	4474	4479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
61	NC_015318	TGT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
62	NC_015318	TGA	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
63	NC_015318	TTG	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
64	NC_015318	GAG	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
65	NC_015318	ATA	2	6	4684	4689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
66	NC_015318	AAG	2	6	4749	4754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
67	NC_015318	GTT	2	6	4830	4835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
68	NC_015318	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
69	NC_015318	ATT	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398178
70	NC_015318	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398178
71	NC_015318	GAT	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
72	NC_015318	GAT	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
73	NC_015318	TTG	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398178
74	NC_015318	GGA	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
75	NC_015318	GAT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
76	NC_015318	ATG	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398178
77	NC_015318	TAA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
78	NC_015318	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398178
79	NC_015318	TTA	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398178
80	NC_015318	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327398178
81	NC_015318	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
82	NC_015318	AGC	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398178
83	NC_015318	AAG	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
84	NC_015318	GAG	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398178
85	NC_015318	TAA	2	6	5880	5885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398178
86	NC_015318	GAA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398178
87	NC_015318	GCA	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398179
88	NC_015318	ACT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398179
89	NC_015318	ATG	2	6	6222	6227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398179
90	NC_015318	CTG	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398179
91	NC_015318	ATG	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398179
92	NC_015318	CAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398179
93	NC_015318	AGC	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398179
94	NC_015318	ACA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398179
95	NC_015318	ATG	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398179
96	NC_015318	TTG	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
97	NC_015318	TGT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
98	NC_015318	TAT	2	6	7147	7152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398179
99	NC_015318	ATC	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398179
100	NC_015318	AGG	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398179
101	NC_015318	TTA	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398179
102	NC_015318	TTG	2	6	7434	7439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
103	NC_015318	AGC	2	6	7470	7475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398179
104	NC_015318	ATC	2	6	7478	7483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398179
105	NC_015318	AAG	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398179
106	NC_015318	CAG	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398179
107	NC_015318	AAC	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398179
108	NC_015318	TTG	2	6	8241	8246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
109	NC_015318	GAA	2	6	8251	8256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398179
110	NC_015318	GGC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327398179
111	NC_015318	TTG	2	6	8361	8366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398179
112	NC_015318	GCT	2	6	8522	8527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398180
113	NC_015318	TTG	2	6	8578	8583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398180
114	NC_015318	CTG	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398180
115	NC_015318	GAT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398180
116	NC_015318	CGA	2	6	8639	8644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398180
117	NC_015318	ATG	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398180
118	NC_015318	TGA	2	6	8855	8860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398180
119	NC_015318	TTA	2	6	8861	8866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398180
120	NC_015318	GTG	2	6	8917	8922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398180
121	NC_015318	GAT	2	6	9000	9005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398180
122	NC_015318	AGG	2	6	9064	9069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327398180
123	NC_015318	AAT	2	6	9332	9337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398180
124	NC_015318	TGA	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398181
125	NC_015318	TGG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398181
126	NC_015318	GCG	2	6	9726	9731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327398181
127	NC_015318	TGC	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398181
128	NC_015318	TAA	2	6	9844	9849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398181
129	NC_015318	TAA	2	6	10059	10064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327398181
130	NC_015318	GAT	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398181
131	NC_015318	TGT	3	9	10183	10191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398181
132	NC_015318	TGA	2	6	10201	10206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398181
133	NC_015318	TGA	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398181
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135	NC_015318	GAT	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398181
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255	NC_015318	GTG	2	6	18732	18737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398191
256	NC_015318	GCA	2	6	18747	18752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327398191
257	NC_015318	GTT	2	6	19005	19010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398191
258	NC_015318	GAT	2	6	19080	19085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398191
259	NC_015318	TTG	2	6	19119	19124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398191
260	NC_015318	CTT	2	6	19318	19323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398191
261	NC_015318	TGG	2	6	19406	19411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398191
262	NC_015318	ACA	2	6	19500	19505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398191
263	NC_015318	CCT	2	6	19534	19539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398191
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265	NC_015318	CTT	2	6	19715	19720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398192
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268	NC_015318	ACA	2	6	19900	19905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398192
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270	NC_015318	TCC	2	6	20025	20030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327398192
271	NC_015318	CAT	2	6	20057	20062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398192
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274	NC_015318	AAG	2	6	20113	20118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327398192
275	NC_015318	CTT	2	6	20287	20292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327398192
276	NC_015318	TTG	2	6	20414	20419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398192
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279	NC_015318	TAT	2	6	20545	20550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327398193
280	NC_015318	CAT	2	6	20643	20648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398193
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282	NC_015318	CAA	2	6	20787	20792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398193
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284	NC_015318	TCA	2	6	20868	20873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327398194
285	NC_015318	TGG	2	6	20889	20894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327398194
286	NC_015318	CCA	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327398194
287	NC_015318	GTT	2	6	20925	20930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327398194
288	NC_015318	ATG	2	6	21213	21218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398194
289	NC_015318	TGA	2	6	21283	21288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398194
290	NC_015318	TGC	3	9	21437	21445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327398194
291	NC_015318	ACA	2	6	21462	21467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327398194
292	NC_015318	TAG	2	6	21512	21517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327398194
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