MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED03

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015313	GTGC	2	8	2766	2773	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
2	NC_015313	CGGA	2	8	3134	3141	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
3	NC_015313	ACGG	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
4	NC_015313	CGGA	2	8	3303	3310	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
5	NC_015313	GTCG	2	8	3389	3396	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
6	NC_015313	GCGG	2	8	3480	3487	0 %	0 %	75 %	25 %	327309735
7	NC_015313	TCCG	2	8	3566	3573	0 %	25 %	25 %	50 %	327309735
8	NC_015313	GATC	2	8	3788	3795	25 %	25 %	25 %	25 %	327309735
9	NC_015313	TGCT	2	8	4011	4018	0 %	50 %	25 %	25 %	327309735
10	NC_015313	ACTC	2	8	5015	5022	25 %	25 %	0 %	50 %	327309736
11	NC_015313	GTGC	2	8	5063	5070	0 %	25 %	50 %	25 %	327309736
12	NC_015313	CCGG	2	8	5799	5806	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
13	NC_015313	CGAT	2	8	6078	6085	25 %	25 %	25 %	25 %	327309739
14	NC_015313	CGGC	2	8	6516	6523	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
15	NC_015313	TTTC	2	8	8379	8386	0 %	75 %	0 %	25 %	327309743
16	NC_015313	CGCT	2	8	8480	8487	0 %	25 %	25 %	50 %	327309743
17	NC_015313	CGAT	2	8	8573	8580	25 %	25 %	25 %	25 %	327309743
18	NC_015313	CCGC	2	8	9012	9019	0 %	0 %	25 %	75 %	327309744
19	NC_015313	CCGG	2	8	9296	9303	0 %	0 %	50 %	50 %	327309744
20	NC_015313	AAGG	2	8	9580	9587	50 %	0 %	50 %	0 %	327309745
21	NC_015313	CGTG	2	8	10222	10229	0 %	25 %	50 %	25 %	327309745
22	NC_015313	CTCG	2	8	10820	10827	0 %	25 %	25 %	50 %	327309745
23	NC_015313	TGAT	2	8	11358	11365	25 %	50 %	25 %	0 %	327309745
24	NC_015313	CGAC	2	8	12388	12395	25 %	0 %	25 %	50 %	327309746
25	NC_015313	GACC	2	8	13825	13832	25 %	0 %	25 %	50 %	327309748

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.