MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus oralis Uo5

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015291	TAAGGA	2	12	16340	16351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015291	GAAGTG	2	12	19427	19438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015291	ACTAAT	2	12	19457	19468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015291	ATTTTA	2	12	19825	19836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015291	TTAAAA	2	12	20100	20111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015291	AGGAAA	2	12	21915	21926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015291	ATAAAA	2	12	54260	54271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015291	ATGGGA	2	12	64249	64260	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015291	TCCCAT	2	12	64266	64277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015291	AATAGA	2	12	66612	66623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015291	ATTACC	2	12	70218	70229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015291	TTTCCA	2	12	72352	72363	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015291	AACTGA	2	12	76230	76241	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015291	AGTTTT	2	12	76263	76274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015291	TTGCTT	2	12	109577	109588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015291	TAAGGA	2	12	144945	144956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015291	GAAGTG	2	12	148032	148043	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015291	ACTAAT	2	12	148062	148073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015291	TTCGGG	2	12	148951	148962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015291	GACAGA	2	12	184963	184974	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015291	TAAGGA	2	12	186693	186704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015291	GAAGTG	2	12	189780	189791	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015291	ACTAAT	2	12	189810	189821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015291	GCTAGG	2	12	301513	301524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015291	GCCCAA	2	12	317297	317308	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015291	AAGATT	2	12	339986	339997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015291	TAGGTA	2	12	396672	396683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015291	TAAGGA	2	12	404550	404561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015291	GAAGTG	2	12	407637	407648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015291	ACTAAT	2	12	407667	407678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015291	TTTCTA	2	12	457926	457937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015291	TTTTTA	2	12	504590	504601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015291	ATATAA	2	12	505827	505838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015291	AAAGAA	2	12	506003	506014	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015291	ATCACC	2	12	529006	529017	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015291	AAATAT	2	12	611453	611464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015291	CTTGAA	2	12	694249	694260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015291	ATAAGA	2	12	720673	720684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015291	AGAATA	2	12	747204	747215	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015291	TTCGGG	2	12	799492	799503	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015291	AAAAAG	2	12	813300	813311	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015291	TTTTAT	2	12	913214	913225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015291	AAAATT	2	12	931568	931579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015291	AAAATT	2	12	951287	951298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015291	TCCAAA	2	12	986623	986634	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015291	AGATTC	2	12	1013036	1013047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015291	TTGAAT	2	12	1037409	1037420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015291	TTTTGT	2	12	1054653	1054664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015291	AGAAAT	2	12	1056960	1056971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015291	AAATTT	2	12	1208492	1208503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015291	TAAAAA	2	12	1232987	1232998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015291	GATTAA	2	12	1351214	1351225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015291	CAATTA	2	12	1364445	1364456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015291	TCTACT	2	12	1371340	1371351	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015291	GAAAAA	2	12	1376450	1376461	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015291	AAAAGA	2	12	1378781	1378792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015291	AACTCT	2	12	1417302	1417313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015291	GAAAAA	2	12	1444185	1444196	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015291	AAAAGA	2	12	1478508	1478519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015291	ATTTCT	2	12	1544237	1544248	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015291	AACTGC	2	12	1587632	1587643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015291	TTGTAA	2	12	1651366	1651377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015291	AAAAGA	2	12	1667224	1667235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015291	TTTTAG	2	12	1703068	1703079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015291	AAAATG	2	12	1718878	1718889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015291	TAAAAA	2	12	1745486	1745497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015291	ATTTTT	2	12	1785108	1785119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015291	TCGTTT	2	12	1811791	1811802	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015291	TATCTA	2	12	1818730	1818741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015291	TAAATT	2	12	1863316	1863327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015291	TATTTT	2	12	1896423	1896434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015291	GAAAAA	2	12	1913319	1913330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015291	TTTCAT	2	12	1919453	1919464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.