MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus oralis Uo5

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015291	TCGTG	2	10	15867	15876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015291	GTTAA	2	10	16588	16597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015291	GGGAG	2	10	17106	17115	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015291	AGGGA	2	10	19316	19325	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015291	TTTAT	2	10	19854	19863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015291	CTTTT	2	10	21821	21830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015291	TTTCT	2	10	26703	26712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015291	TAAAA	2	10	31733	31742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015291	GAAAG	2	10	42595	42604	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015291	GAAGA	2	10	42605	42614	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015291	ATATT	2	10	52715	52724	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015291	ATTTT	2	10	58398	58407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015291	AAAGA	2	10	59416	59425	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015291	AATTT	2	10	72311	72320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015291	TGATA	2	10	88622	88631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015291	TTGAT	2	10	94434	94443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015291	TAAAA	2	10	94456	94465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015291	ATTGA	2	10	95199	95208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015291	GAGCG	2	10	97828	97837	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015291	GAAAG	2	10	99546	99555	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015291	GTAAA	2	10	103376	103385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015291	CTATA	2	10	106857	106866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015291	ATGAT	2	10	138691	138700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015291	ATATA	2	10	141018	141027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015291	TCGTG	2	10	144472	144481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015291	GTTAA	2	10	145193	145202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015291	GGGAG	2	10	145711	145720	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015291	AGGGA	2	10	147921	147930	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015291	AATGG	2	10	158928	158937	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015291	ATATA	2	10	162215	162224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015291	GAGTT	2	10	169399	169408	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015291	AGGAA	2	10	171619	171628	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015291	GAAAA	2	10	175729	175738	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015291	CTAAA	2	10	184276	184285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015291	TCGTG	2	10	186220	186229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015291	GTTAA	2	10	186941	186950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015291	GGGAG	2	10	187459	187468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015291	AGGGA	2	10	189669	189678	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015291	GAAAA	2	10	201940	201949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015291	AAGTA	2	10	222609	222618	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015291	TAAAA	2	10	222671	222680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015291	CTTTT	2	10	224708	224717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015291	CTTTT	2	10	243808	243817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015291	AGGAA	2	10	265310	265319	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015291	TATAA	2	10	276464	276473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015291	AGGAT	2	10	281334	281343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015291	ATATA	2	10	283918	283927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015291	ATTCT	2	10	307592	307601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015291	TCTTT	2	10	318077	318086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015291	TATCA	2	10	320601	320610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015291	GTTTT	2	10	333488	333497	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015291	CTATT	2	10	343202	343211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015291	TAATT	2	10	351283	351292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015291	TTAAA	2	10	355370	355379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015291	ATCTA	2	10	361889	361898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015291	ATATA	2	10	369516	369525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015291	TGAAA	2	10	378176	378185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015291	TATGA	2	10	378822	378831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015291	TGAAA	2	10	379832	379841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015291	TATAA	2	10	379891	379900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015291	AGTAT	2	10	391151	391160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015291	TTCTA	2	10	398927	398936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015291	TAAAA	2	10	399793	399802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015291	TCGTG	2	10	404077	404086	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015291	GTTAA	2	10	404798	404807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015291	GGGAG	2	10	405316	405325	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015291	AGGGA	2	10	407526	407535	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015291	CTAGT	2	10	455773	455782	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015291	GTTTA	2	10	458176	458185	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015291	AAGAA	2	10	459728	459737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015291	TCTTT	2	10	462646	462655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015291	GTATA	2	10	474543	474552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015291	TGAAC	2	10	476180	476189	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015291	GAAAA	2	10	488337	488346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015291	TTTAT	2	10	506020	506029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015291	CAAAA	2	10	517441	517450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015291	TTTTA	2	10	518607	518616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015291	CAAAA	2	10	518676	518685	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015291	AAACG	2	10	528879	528888	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015291	ATTTT	2	10	528941	528950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015291	TTAAA	2	10	540632	540641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015291	ATAGA	2	10	557439	557448	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015291	AAGTA	2	10	563753	563762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015291	TGATA	2	10	569273	569282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015291	ATAAA	2	10	574370	574379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015291	TTTAT	2	10	584808	584817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015291	ATTTT	2	10	595401	595410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015291	ATTAA	2	10	611591	611600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015291	TGTTA	2	10	618153	618162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015291	AGATA	2	10	630032	630041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015291	AGAAA	2	10	637999	638008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015291	TCAAT	2	10	640552	640561	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015291	AAGAA	2	10	644394	644403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015291	ATCAA	2	10	648661	648670	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015291	ATTTG	2	10	656293	656302	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015291	TGAAA	2	10	694453	694462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015291	TTATA	2	10	704502	704511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015291	ATAAA	2	10	704544	704553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015291	TAGCT	2	10	752821	752830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015291	AGGGA	2	10	753435	753444	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015291	GGAAG	2	10	759727	759736	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015291	TAGCT	2	10	764817	764826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015291	ATAAA	2	10	768058	768067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015291	GGAAA	2	10	776871	776880	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015291	AAATA	2	10	785692	785701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015291	TAGAA	2	10	797988	797997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015291	TATTT	2	10	799650	799659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015291	TAAAA	2	10	809544	809553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015291	TTGAC	2	10	812859	812868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015291	TTTAT	2	10	814343	814352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015291	ATAGA	2	10	826026	826035	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015291	TTCTT	2	10	846621	846630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015291	GATAT	2	10	846638	846647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015291	AAAGA	2	10	856589	856598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015291	AATTT	2	10	876258	876267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015291	AGGTT	2	10	880191	880200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015291	TACTG	2	10	883996	884005	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015291	TTTTA	2	10	888585	888594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015291	ATTTT	2	10	894802	894811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015291	TCAAG	2	10	898446	898455	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015291	GTTTT	2	10	913190	913199	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015291	GAAAG	2	10	941576	941585	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015291	TTTAA	2	10	947043	947052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015291	GTAAG	2	10	962571	962580	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015291	GATTA	2	10	968955	968964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015291	TATTT	2	10	1001104	1001113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015291	AATGC	2	10	1013842	1013851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015291	ATTCT	2	10	1014532	1014541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015291	GTTTT	2	10	1016894	1016903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015291	AAGAA	2	10	1023979	1023988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015291	AGGAA	2	10	1029163	1029172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015291	AAAAT	2	10	1042068	1042077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015291	ATAAA	2	10	1071463	1071472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015291	AAACT	2	10	1074235	1074244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015291	TTATA	2	10	1077859	1077868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015291	ATAGA	2	10	1078855	1078864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015291	TATAT	2	10	1087059	1087068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015291	TAAAA	2	10	1099023	1099032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015291	TTCTT	2	10	1099757	1099766	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015291	AAGAT	2	10	1110968	1110977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015291	ATAAA	2	10	1111018	1111027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015291	CTTTC	2	10	1140987	1140996	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015291	TTCAA	2	10	1159626	1159635	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015291	TCCTT	2	10	1167526	1167535	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015291	AGGTC	2	10	1167559	1167568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015291	AAAGA	2	10	1182026	1182035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015291	GTTAG	2	10	1182057	1182066	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.