MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a chromosome

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015278	TAA	2	6	1926346	1926351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015278	AGG	2	6	1926399	1926404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015278	CAT	2	6	1931370	1931375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015278	TCA	2	6	1932444	1932449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_015278	GTA	2	6	1932481	1932486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015278	AGT	2	6	1932494	1932499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015278	AGA	2	6	1932502	1932507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015278	ATG	2	6	1933136	1933141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015278	GAA	2	6	1933295	1933300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015278	CGG	2	6	1933462	1933467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_015278	AAC	2	6	1933497	1933502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_015278	ACA	2	6	1933507	1933512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_015278	TAC	2	6	1933522	1933527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015278	GAT	2	6	1933534	1933539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015278	ATT	2	6	1933603	1933608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015278	AGA	2	6	1933696	1933701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015278	CTA	2	6	1933837	1933842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015278	AAG	2	6	1933847	1933852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015278	CTA	2	6	1933854	1933859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_015278	GAA	2	6	1933882	1933887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015278	TCA	2	6	1933979	1933984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_015278	CTT	2	6	1933987	1933992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015278	CGC	2	6	1933994	1933999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_015278	CAA	2	6	1934111	1934116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_015278	ACA	2	6	1934177	1934182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015278	TCC	2	6	1935996	1936001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_015278	TCC	2	6	1937547	1937552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_015278	TTA	2	6	1937724	1937729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015278	TTC	2	6	1937766	1937771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015278	TAA	2	6	1939366	1939371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015278	TAG	2	6	1940843	1940848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015278	TTA	2	6	1941370	1941375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015278	AAG	2	6	1941398	1941403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015278	CTT	2	6	1941423	1941428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_015278	TTA	2	6	1942631	1942636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015278	ATA	2	6	1944939	1944944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_015278	TAT	2	6	1945058	1945063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015278	GTC	2	6	1945101	1945106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5041	NC_015278	TCC	2	6	1945761	1945766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_015278	CTT	2	6	1946374	1946379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_015278	TAA	2	6	1946524	1946529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015278	TCC	2	6	1947525	1947530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015278	TAC	2	6	1947539	1947544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5048	NC_015278	AAT	2	6	1947812	1947817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5052	NC_015278	TAA	2	6	1948263	1948268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015278	ACC	2	6	1948295	1948300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5056	NC_015278	AAT	2	6	1948412	1948417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5058	NC_015278	CAA	2	6	1951686	1951691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015278	TTA	2	6	1952878	1952883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015278	AAC	2	6	1952894	1952899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_015278	TCC	2	6	1953260	1953265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_015278	TAG	2	6	1953310	1953315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015278	TTA	2	6	1953319	1953324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015278	CTT	2	6	1953349	1953354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015278	CTT	2	6	1953364	1953369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015278	TTA	2	6	1953394	1953399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_015278	TTA	2	6	1957304	1957309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015278	TAA	2	6	1962454	1962459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_015278	TAA	2	6	1963561	1963566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_015278	TAT	2	6	1973307	1973312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015278	ATT	2	6	1973364	1973369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015278	TAA	2	6	1973416	1973421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_015278	TAA	2	6	1982882	1982887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015278	AAG	2	6	1982905	1982910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015278	TCC	2	6	1983601	1983606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_015278	ATT	2	6	1983644	1983649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_015278	AAG	2	6	1984438	1984443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015278	GCT	2	6	1986315	1986320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5097	NC_015278	TCT	2	6	1986537	1986542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015278	TAA	2	6	1986553	1986558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015278	CAT	2	6	1986568	1986573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_015278	CTT	2	6	1986826	1986831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_015278	CTT	2	6	1986970	1986975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_015278	TCC	2	6	1987107	1987112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_015278	GCG	2	6	1987177	1987182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015278	GAA	2	6	1987207	1987212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015278	TCA	3	9	1987349	1987357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015278	GAT	2	6	1987420	1987425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015278	CTT	2	6	1987431	1987436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_015278	TCA	2	6	1987475	1987480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_015278	ACA	2	6	1987507	1987512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015278	CCA	2	6	1987556	1987561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_015278	TCT	2	6	1987604	1987609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015278	AGG	2	6	1987770	1987775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015278	CCT	2	6	1987821	1987826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_015278	GTA	2	6	1987963	1987968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_015278	GGT	2	6	1988256	1988261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015278	CGG	2	6	1988503	1988508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_015278	CAT	2	6	1988598	1988603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015278	CTT	2	6	1988717	1988722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_015278	TTA	2	6	1989006	1989011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_015278	ATT	2	6	1993934	1993939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015278	AGA	2	6	1993953	1993958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.