MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinomonas mediterranea MMB-1 chromosome

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015276	TCTGTA	2	12	38856	38867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015276	TTTCTT	2	12	50471	50482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015276	CAAATT	2	12	70981	70992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015276	TATGTT	2	12	72874	72885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015276	CACAAA	2	12	77752	77763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015276	AAATAA	2	12	216279	216290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015276	GCTTTC	2	12	265121	265132	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015276	ATATAA	2	12	278564	278575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015276	CCTTAT	2	12	308080	308091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015276	TGAAAT	2	12	310860	310871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015276	TTTCTG	2	12	312171	312182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015276	CCAGTT	2	12	382707	382718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015276	TTTTGT	2	12	390817	390828	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015276	AATATA	2	12	394883	394894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015276	TATGAC	2	12	414342	414353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015276	GCATTA	2	12	463749	463760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015276	AGTAAT	2	12	483469	483480	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015276	GATCTA	2	12	486284	486295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015276	ACTTTT	2	12	497252	497263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015276	AAAATG	2	12	580332	580343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015276	ATCGAA	2	12	599017	599028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015276	TTCGAA	2	12	600115	600126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015276	GTACAT	2	12	633833	633844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015276	GCTAAG	2	12	694448	694459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015276	AGCAAA	2	12	696145	696156	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015276	TTGAAG	2	12	696856	696867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015276	GTTTTT	2	12	698270	698281	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015276	AACCCC	2	12	710828	710839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015276	TAATGA	2	12	732965	732976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015276	GTTATT	2	12	732982	732993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015276	ATTTTT	2	12	789383	789394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015276	CCTTAT	2	12	810577	810588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015276	TGAAAT	2	12	813358	813369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015276	TTTCTG	2	12	814669	814680	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015276	ATGATC	2	12	882386	882397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015276	CAGCGA	2	12	891160	891171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015276	ACTAGA	2	12	891775	891786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015276	GATCAT	2	12	896822	896833	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015276	TTTATT	2	12	911961	911972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015276	CGTGAC	2	12	933731	933742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015276	TTCCTT	2	12	937776	937787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015276	TATTGA	2	12	1011722	1011733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015276	ATAAAT	2	12	1047286	1047297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015276	AAGTTT	2	12	1096329	1096340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015276	TTTTCA	2	12	1108957	1108968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015276	TTTCTC	2	12	1109200	1109211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015276	GTTTTG	2	12	1121908	1121919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015276	ATTTTT	2	12	1133048	1133059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015276	TTTATG	2	12	1169571	1169582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015276	TTTATA	2	12	1182725	1182736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015276	TAATTA	2	12	1199536	1199547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015276	CAAATA	2	12	1244258	1244269	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015276	CTCTTT	2	12	1270730	1270741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015276	ATCGCA	2	12	1306561	1306572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015276	ATGTTG	3	18	1306860	1306877	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015276	GCGAGA	2	12	1345090	1345101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015276	TTTTGG	2	12	1364659	1364670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015276	GAAATG	2	12	1366865	1366876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015276	CTTTTT	2	12	1373870	1373881	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015276	TTTTGT	2	12	1404974	1404985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015276	AGTTAT	2	12	1405180	1405191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015276	ATAGTG	2	12	1457763	1457774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015276	GAAAGC	2	12	1504678	1504689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015276	TGATAA	2	12	1514804	1514815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015276	GTTTAG	2	12	1576102	1576113	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015276	GAAATT	2	12	1600565	1600576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015276	CCCCCA	2	12	1619511	1619522	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
68	NC_015276	TCATTC	2	12	1673517	1673528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015276	TAAATA	2	12	1683588	1683599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015276	TTTAGC	2	12	1709549	1709560	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015276	ATTTTC	2	12	1751361	1751372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015276	TTTTTA	2	12	1755500	1755511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015276	AACAAA	2	12	1764150	1764161	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015276	CTATGT	2	12	1767941	1767952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015276	CTTATT	2	12	1783265	1783276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015276	TGTATT	2	12	1823435	1823446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015276	ATTTTT	2	12	1834279	1834290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015276	AAAAAT	2	12	1839373	1839384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015276	ACGAAC	2	12	1847647	1847658	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015276	ATTTGT	2	12	1889609	1889620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015276	AAATTT	2	12	1911494	1911505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015276	TTTCTA	2	12	1912486	1912497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015276	ATTGAG	2	12	2013076	2013087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015276	TTTAAA	2	12	2038012	2038023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015276	ATCCAA	2	12	2043784	2043795	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015276	CCCCCA	2	12	2052290	2052301	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_015276	GCAAAC	2	12	2078003	2078014	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015276	GCGTCA	2	12	2083987	2083998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015276	ATGAAA	2	12	2107251	2107262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015276	ACGAAC	2	12	2133032	2133043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015276	ACGAAC	2	12	2135311	2135322	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015276	TTAGAG	2	12	2140705	2140716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015276	ATAGGA	2	12	2152480	2152491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015276	TTTAAA	2	12	2207557	2207568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015276	TCAAAA	2	12	2241473	2241484	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015276	TATAGA	2	12	2305419	2305430	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015276	GCTGCG	2	12	2305577	2305588	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015276	TGGCAA	2	12	2314396	2314407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015276	GCAGTT	2	12	2321046	2321057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015276	ATAACT	2	12	2326012	2326023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_015276	TTAAAT	2	12	2326151	2326162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015276	GATCTT	2	12	2332946	2332957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015276	ACCAAT	2	12	2382704	2382715	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015276	TAAAGG	2	12	2385973	2385984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015276	TCAAAT	2	12	2389277	2389288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015276	AATAAA	2	12	2406503	2406514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015276	TTTCCA	2	12	2407640	2407651	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015276	ATAAAA	2	12	2420935	2420946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015276	ATAAAA	2	12	2430172	2430183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015276	CCAGAA	2	12	2539857	2539868	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015276	ATTCTC	2	12	2540698	2540709	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015276	AATAAA	2	12	2549867	2549878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015276	ATGATC	2	12	2595878	2595889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015276	AGGCCT	2	12	2607666	2607677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015276	CTCCTA	2	12	2608380	2608391	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015276	ATGATC	2	12	2629213	2629224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015276	ACAAAA	2	12	2635836	2635847	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015276	AAATAA	2	12	2650860	2650871	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015276	GTACTA	2	12	2660497	2660508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015276	GATAGA	2	12	2678899	2678910	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015276	CAAACT	2	12	2735537	2735548	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015276	TAAATA	2	12	2819051	2819062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015276	ACCCAA	2	12	2854856	2854867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015276	AAAACA	2	12	2883851	2883862	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015276	AACCCA	2	12	2899850	2899861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015276	TTTTCT	2	12	2944278	2944289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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128	NC_015276	ATCATT	2	12	3014482	3014493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015276	TTATCA	2	12	3014509	3014520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_015276	TCGCTT	2	12	3028313	3028324	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015276	AAAATA	2	12	3048491	3048502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015276	GAAATT	2	12	3049615	3049626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_015276	ATAAAA	2	12	3275276	3275287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.