MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 13702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	TAAA	3	12	1	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015275	ACTT	2	8	1114	1121	25 %	50 %	0 %	25 %	326789140
3	NC_015275	TAAA	2	8	1362	1369	75 %	25 %	0 %	0 %	326789140
4	NC_015275	ACTT	2	8	1739	1746	25 %	50 %	0 %	25 %	326789141
5	NC_015275	GGAC	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	326789141
6	NC_015275	ATGT	2	8	2620	2627	25 %	50 %	25 %	0 %	326789141
7	NC_015275	AGTT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	25 %	0 %	326789142
8	NC_015275	TAAC	2	8	3031	3038	50 %	25 %	0 %	25 %	326789142
9	NC_015275	AGAA	2	8	3221	3228	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
10	NC_015275	TAAT	2	8	3335	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
11	NC_015275	GAAA	2	8	3749	3756	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
12	NC_015275	TTCT	2	8	3890	3897	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
13	NC_015275	TTCT	2	8	3968	3975	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
14	NC_015275	GTAT	2	8	4316	4323	25 %	50 %	25 %	0 %	326789144
15	NC_015275	CTAT	2	8	4949	4956	25 %	50 %	0 %	25 %	326789144
16	NC_015275	TTTA	2	8	5843	5850	25 %	75 %	0 %	0 %	326789144
17	NC_015275	AAAG	2	8	7048	7055	75 %	0 %	25 %	0 %	326789145
18	NC_015275	TGCT	2	8	7205	7212	0 %	50 %	25 %	25 %	326789145
19	NC_015275	TAAA	2	8	7313	7320	75 %	25 %	0 %	0 %	326789145
20	NC_015275	TGTA	2	8	8601	8608	25 %	50 %	25 %	0 %	326789145
21	NC_015275	AAAT	2	8	8710	8717	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
22	NC_015275	TTAT	2	8	8731	8738	25 %	75 %	0 %	0 %	326789146
23	NC_015275	TAAA	2	8	8825	8832	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
24	NC_015275	TAAA	2	8	9668	9675	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
25	NC_015275	CGAA	2	8	10513	10520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015275	AACG	2	8	10608	10615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015275	GAAG	2	8	10856	10863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015275	GAGC	2	8	10969	10976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015275	GGGA	2	8	11885	11892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015275	GTTA	2	8	11998	12005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015275	GACT	2	8	12141	12148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015275	AGAA	2	8	12730	12737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015275	TAGG	2	8	14257	14264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015275	GGAC	2	8	15189	15196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015275	TGAG	2	8	16359	16366	25 %	25 %	50 %	0 %	326789147
36	NC_015275	AGAA	2	8	17031	17038	75 %	0 %	25 %	0 %	326789148
37	NC_015275	AATA	2	8	17112	17119	75 %	25 %	0 %	0 %	326789148
38	NC_015275	AGTT	2	8	17128	17135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015275	ATTA	2	8	17552	17559	50 %	50 %	0 %	0 %	326789149
40	NC_015275	GATA	2	8	18359	18366	50 %	25 %	25 %	0 %	326789149
41	NC_015275	GGTA	2	8	18473	18480	25 %	25 %	50 %	0 %	326789149
42	NC_015275	ATTG	2	8	18560	18567	25 %	50 %	25 %	0 %	326789149
43	NC_015275	TAGA	2	8	19434	19441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015275	TAAG	2	8	19609	19616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015275	GTTA	2	8	19744	19751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015275	GAAG	2	8	19880	19887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015275	TCAG	2	8	20035	20042	25 %	25 %	25 %	25 %	326789151
48	NC_015275	AATT	2	8	20283	20290	50 %	50 %	0 %	0 %	326789151
49	NC_015275	TAGC	2	8	20946	20953	25 %	25 %	25 %	25 %	326789152
50	NC_015275	TAAG	2	8	21003	21010	50 %	25 %	25 %	0 %	326789152
51	NC_015275	TTTA	2	8	21126	21133	25 %	75 %	0 %	0 %	326789152
52	NC_015275	TAAA	2	8	21171	21178	75 %	25 %	0 %	0 %	326789152
53	NC_015275	CATG	2	8	22543	22550	25 %	25 %	25 %	25 %	326789154
54	NC_015275	TATT	2	8	23229	23236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015275	AAGA	2	8	23275	23282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015275	TAAA	2	8	23401	23408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015275	ATTA	2	8	23867	23874	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
58	NC_015275	AATT	2	8	23911	23918	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
59	NC_015275	TAGA	2	8	24151	24158	50 %	25 %	25 %	0 %	326789155
60	NC_015275	TTAA	2	8	24207	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
61	NC_015275	CGAA	2	8	24764	24771	50 %	0 %	25 %	25 %	326789156
62	NC_015275	TGGT	2	8	25349	25356	0 %	50 %	50 %	0 %	326789156
63	NC_015275	ATTT	2	8	25508	25515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015275	GACT	2	8	25912	25919	25 %	25 %	25 %	25 %	326789157
65	NC_015275	ATAG	2	8	26507	26514	50 %	25 %	25 %	0 %	326789157
66	NC_015275	AAGT	2	8	26567	26574	50 %	25 %	25 %	0 %	326789157
67	NC_015275	AATT	2	8	26778	26785	50 %	50 %	0 %	0 %	326789158
68	NC_015275	GAAG	2	8	27247	27254	50 %	0 %	50 %	0 %	326789158
69	NC_015275	TAAA	2	8	27433	27440	75 %	25 %	0 %	0 %	326789158
70	NC_015275	AGTC	2	8	27499	27506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015275	TAGA	2	8	28182	28189	50 %	25 %	25 %	0 %	326789160
72	NC_015275	AAAG	2	8	28225	28232	75 %	0 %	25 %	0 %	326789160
73	NC_015275	ATTA	2	8	28557	28564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015275	GTAT	2	8	29305	29312	25 %	50 %	25 %	0 %	326789162
75	NC_015275	TCTG	2	8	29472	29479	0 %	50 %	25 %	25 %	326789162
76	NC_015275	AATT	2	8	29692	29699	50 %	50 %	0 %	0 %	326789162
77	NC_015275	AGGA	2	8	29757	29764	50 %	0 %	50 %	0 %	326789162
78	NC_015275	ATTG	2	8	30249	30256	25 %	50 %	25 %	0 %	326789163
79	NC_015275	AATG	2	8	30468	30475	50 %	25 %	25 %	0 %	326789163
80	NC_015275	ATAA	2	8	30849	30856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015275	TTAA	2	8	30919	30926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015275	GTTG	2	8	31064	31071	0 %	50 %	50 %	0 %	326789164
83	NC_015275	AGGT	2	8	31290	31297	25 %	25 %	50 %	0 %	326789164
84	NC_015275	CAAG	2	8	31602	31609	50 %	0 %	25 %	25 %	326789164
85	NC_015275	AAGT	2	8	31956	31963	50 %	25 %	25 %	0 %	326789164
86	NC_015275	TTAT	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
87	NC_015275	ATTT	2	8	32223	32230	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
88	NC_015275	CAAT	2	8	32247	32254	50 %	25 %	0 %	25 %	326789164
89	NC_015275	CATG	2	8	32973	32980	25 %	25 %	25 %	25 %	326789165
90	NC_015275	ATAC	2	8	33302	33309	50 %	25 %	0 %	25 %	326789165
91	NC_015275	ATTT	2	8	33575	33582	25 %	75 %	0 %	0 %	326789165
92	NC_015275	AATA	3	12	33838	33849	75 %	25 %	0 %	0 %	326789165
93	NC_015275	ACTT	2	8	34305	34312	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
94	NC_015275	AACA	2	8	34432	34439	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
95	NC_015275	TTTG	2	8	34481	34488	0 %	75 %	25 %	0 %	326789166
96	NC_015275	TCTT	2	8	34520	34527	0 %	75 %	0 %	25 %	326789166
97	NC_015275	CTTA	2	8	34736	34743	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
98	NC_015275	ACAA	2	8	34750	34757	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
99	NC_015275	ATGA	2	8	34809	34816	50 %	25 %	25 %	0 %	326789166
100	NC_015275	CTAT	2	8	34867	34874	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
101	NC_015275	TTTA	2	8	35159	35166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015275	ATCT	2	8	35237	35244	25 %	50 %	0 %	25 %	326789167
103	NC_015275	AGGA	2	8	36236	36243	50 %	0 %	50 %	0 %	326789167
104	NC_015275	AAAT	2	8	36765	36772	75 %	25 %	0 %	0 %	326789168
105	NC_015275	AGCA	2	8	36785	36792	50 %	0 %	25 %	25 %	326789168
106	NC_015275	AAGC	2	8	36814	36821	50 %	0 %	25 %	25 %	326789168
107	NC_015275	TAAG	2	8	37016	37023	50 %	25 %	25 %	0 %	326789168
108	NC_015275	AACA	2	8	37148	37155	75 %	0 %	0 %	25 %	326789168
109	NC_015275	TACT	2	8	37328	37335	25 %	50 %	0 %	25 %	326789168
110	NC_015275	TATT	2	8	37499	37506	25 %	75 %	0 %	0 %	326789168
111	NC_015275	AGTA	2	8	38013	38020	50 %	25 %	25 %	0 %	326789169
112	NC_015275	ATTC	2	8	38151	38158	25 %	50 %	0 %	25 %	326789169
113	NC_015275	CAGC	2	8	38163	38170	25 %	0 %	25 %	50 %	326789169
114	NC_015275	AAGG	2	8	38185	38192	50 %	0 %	50 %	0 %	326789169
115	NC_015275	ACAA	2	8	38486	38493	75 %	0 %	0 %	25 %	326789169
116	NC_015275	TTTA	2	8	39688	39695	25 %	75 %	0 %	0 %	326789170
117	NC_015275	TCAC	2	8	39840	39847	25 %	25 %	0 %	50 %	326789170
118	NC_015275	ACTT	2	8	39946	39953	25 %	50 %	0 %	25 %	326789170
119	NC_015275	AACT	2	8	40080	40087	50 %	25 %	0 %	25 %	326789170
120	NC_015275	AATT	2	8	40152	40159	50 %	50 %	0 %	0 %	326789170
121	NC_015275	AATT	2	8	41557	41564	50 %	50 %	0 %	0 %	326789172
122	NC_015275	TATT	2	8	41798	41805	25 %	75 %	0 %	0 %	326789172
123	NC_015275	CTAT	2	8	42332	42339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015275	ATTA	2	8	42374	42381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015275	AATA	2	8	42470	42477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015275	TTAA	2	8	42478	42485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015275	AGAA	2	8	43543	43550	75 %	0 %	25 %	0 %	326789174
128	NC_015275	GAAA	2	8	43758	43765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015275	GTAA	2	8	44040	44047	50 %	25 %	25 %	0 %	326789175
130	NC_015275	GATA	2	8	44536	44543	50 %	25 %	25 %	0 %	326789176
131	NC_015275	ATCT	2	8	45286	45293	25 %	50 %	0 %	25 %	326789176
132	NC_015275	GATA	2	8	45926	45933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015275	AAAC	2	8	46096	46103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015275	CGAA	2	8	46299	46306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015275	AACG	2	8	46393	46400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015275	GAAG	2	8	46641	46648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015275	GAGC	2	8	46754	46761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015275	GGGA	2	8	47671	47678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015275	GTTT	2	8	47808	47815	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015275	TGGT	2	8	48058	48065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015275	TAAA	2	8	48255	48262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015275	AATA	2	8	48740	48747	75 %	25 %	0 %	0 %	326789177
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