MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 11088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	ACTT	2	8	1114	1121	25 %	50 %	0 %	25 %	326789140
2	NC_015275	TAAA	2	8	1362	1369	75 %	25 %	0 %	0 %	326789140
3	NC_015275	ACTT	2	8	1739	1746	25 %	50 %	0 %	25 %	326789141
4	NC_015275	GGAC	2	8	2202	2209	25 %	0 %	50 %	25 %	326789141
5	NC_015275	ATGT	2	8	2620	2627	25 %	50 %	25 %	0 %	326789141
6	NC_015275	AGTT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	25 %	0 %	326789142
7	NC_015275	TAAC	2	8	3031	3038	50 %	25 %	0 %	25 %	326789142
8	NC_015275	AGAA	2	8	3221	3228	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
9	NC_015275	TAAT	2	8	3335	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	326789143
10	NC_015275	GAAA	2	8	3749	3756	75 %	0 %	25 %	0 %	326789143
11	NC_015275	TTCT	2	8	3890	3897	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
12	NC_015275	TTCT	2	8	3968	3975	0 %	75 %	0 %	25 %	326789143
13	NC_015275	GTAT	2	8	4316	4323	25 %	50 %	25 %	0 %	326789144
14	NC_015275	CTAT	2	8	4949	4956	25 %	50 %	0 %	25 %	326789144
15	NC_015275	TTTA	2	8	5843	5850	25 %	75 %	0 %	0 %	326789144
16	NC_015275	AAAG	2	8	7048	7055	75 %	0 %	25 %	0 %	326789145
17	NC_015275	TGCT	2	8	7205	7212	0 %	50 %	25 %	25 %	326789145
18	NC_015275	TAAA	2	8	7313	7320	75 %	25 %	0 %	0 %	326789145
19	NC_015275	TGTA	2	8	8601	8608	25 %	50 %	25 %	0 %	326789145
20	NC_015275	AAAT	2	8	8710	8717	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
21	NC_015275	TTAT	2	8	8731	8738	25 %	75 %	0 %	0 %	326789146
22	NC_015275	TAAA	2	8	8825	8832	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
23	NC_015275	TAAA	2	8	9668	9675	75 %	25 %	0 %	0 %	326789146
24	NC_015275	TGAG	2	8	16359	16366	25 %	25 %	50 %	0 %	326789147
25	NC_015275	AGAA	2	8	17031	17038	75 %	0 %	25 %	0 %	326789148
26	NC_015275	AATA	2	8	17112	17119	75 %	25 %	0 %	0 %	326789148
27	NC_015275	ATTA	2	8	17552	17559	50 %	50 %	0 %	0 %	326789149
28	NC_015275	GATA	2	8	18359	18366	50 %	25 %	25 %	0 %	326789149
29	NC_015275	GGTA	2	8	18473	18480	25 %	25 %	50 %	0 %	326789149
30	NC_015275	ATTG	2	8	18560	18567	25 %	50 %	25 %	0 %	326789149
31	NC_015275	TCAG	2	8	20035	20042	25 %	25 %	25 %	25 %	326789151
32	NC_015275	AATT	2	8	20283	20290	50 %	50 %	0 %	0 %	326789151
33	NC_015275	TAGC	2	8	20946	20953	25 %	25 %	25 %	25 %	326789152
34	NC_015275	TAAG	2	8	21003	21010	50 %	25 %	25 %	0 %	326789152
35	NC_015275	TTTA	2	8	21126	21133	25 %	75 %	0 %	0 %	326789152
36	NC_015275	TAAA	2	8	21171	21178	75 %	25 %	0 %	0 %	326789152
37	NC_015275	CATG	2	8	22543	22550	25 %	25 %	25 %	25 %	326789154
38	NC_015275	ATTA	2	8	23867	23874	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
39	NC_015275	AATT	2	8	23911	23918	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
40	NC_015275	TAGA	2	8	24151	24158	50 %	25 %	25 %	0 %	326789155
41	NC_015275	TTAA	2	8	24207	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	326789155
42	NC_015275	CGAA	2	8	24764	24771	50 %	0 %	25 %	25 %	326789156
43	NC_015275	TGGT	2	8	25349	25356	0 %	50 %	50 %	0 %	326789156
44	NC_015275	GACT	2	8	25912	25919	25 %	25 %	25 %	25 %	326789157
45	NC_015275	ATAG	2	8	26507	26514	50 %	25 %	25 %	0 %	326789157
46	NC_015275	AAGT	2	8	26567	26574	50 %	25 %	25 %	0 %	326789157
47	NC_015275	AATT	2	8	26778	26785	50 %	50 %	0 %	0 %	326789158
48	NC_015275	GAAG	2	8	27247	27254	50 %	0 %	50 %	0 %	326789158
49	NC_015275	TAAA	2	8	27433	27440	75 %	25 %	0 %	0 %	326789158
50	NC_015275	TAGA	2	8	28182	28189	50 %	25 %	25 %	0 %	326789160
51	NC_015275	AAAG	2	8	28225	28232	75 %	0 %	25 %	0 %	326789160
52	NC_015275	GTAT	2	8	29305	29312	25 %	50 %	25 %	0 %	326789162
53	NC_015275	TCTG	2	8	29472	29479	0 %	50 %	25 %	25 %	326789162
54	NC_015275	AATT	2	8	29692	29699	50 %	50 %	0 %	0 %	326789162
55	NC_015275	AGGA	2	8	29757	29764	50 %	0 %	50 %	0 %	326789162
56	NC_015275	ATTG	2	8	30249	30256	25 %	50 %	25 %	0 %	326789163
57	NC_015275	AATG	2	8	30468	30475	50 %	25 %	25 %	0 %	326789163
58	NC_015275	GTTG	2	8	31064	31071	0 %	50 %	50 %	0 %	326789164
59	NC_015275	AGGT	2	8	31290	31297	25 %	25 %	50 %	0 %	326789164
60	NC_015275	CAAG	2	8	31602	31609	50 %	0 %	25 %	25 %	326789164
61	NC_015275	AAGT	2	8	31956	31963	50 %	25 %	25 %	0 %	326789164
62	NC_015275	TTAT	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
63	NC_015275	ATTT	2	8	32223	32230	25 %	75 %	0 %	0 %	326789164
64	NC_015275	CAAT	2	8	32247	32254	50 %	25 %	0 %	25 %	326789164
65	NC_015275	CATG	2	8	32973	32980	25 %	25 %	25 %	25 %	326789165
66	NC_015275	ATAC	2	8	33302	33309	50 %	25 %	0 %	25 %	326789165
67	NC_015275	ATTT	2	8	33575	33582	25 %	75 %	0 %	0 %	326789165
68	NC_015275	AATA	3	12	33838	33849	75 %	25 %	0 %	0 %	326789165
69	NC_015275	ACTT	2	8	34305	34312	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
70	NC_015275	AACA	2	8	34432	34439	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
71	NC_015275	TTTG	2	8	34481	34488	0 %	75 %	25 %	0 %	326789166
72	NC_015275	TCTT	2	8	34520	34527	0 %	75 %	0 %	25 %	326789166
73	NC_015275	CTTA	2	8	34736	34743	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
74	NC_015275	ACAA	2	8	34750	34757	75 %	0 %	0 %	25 %	326789166
75	NC_015275	ATGA	2	8	34809	34816	50 %	25 %	25 %	0 %	326789166
76	NC_015275	CTAT	2	8	34867	34874	25 %	50 %	0 %	25 %	326789166
77	NC_015275	ATCT	2	8	35237	35244	25 %	50 %	0 %	25 %	326789167
78	NC_015275	AGGA	2	8	36236	36243	50 %	0 %	50 %	0 %	326789167
79	NC_015275	AAAT	2	8	36765	36772	75 %	25 %	0 %	0 %	326789168
80	NC_015275	AGCA	2	8	36785	36792	50 %	0 %	25 %	25 %	326789168
81	NC_015275	AAGC	2	8	36814	36821	50 %	0 %	25 %	25 %	326789168
82	NC_015275	TAAG	2	8	37016	37023	50 %	25 %	25 %	0 %	326789168
83	NC_015275	AACA	2	8	37148	37155	75 %	0 %	0 %	25 %	326789168
84	NC_015275	TACT	2	8	37328	37335	25 %	50 %	0 %	25 %	326789168
85	NC_015275	TATT	2	8	37499	37506	25 %	75 %	0 %	0 %	326789168
86	NC_015275	AGTA	2	8	38013	38020	50 %	25 %	25 %	0 %	326789169
87	NC_015275	ATTC	2	8	38151	38158	25 %	50 %	0 %	25 %	326789169
88	NC_015275	CAGC	2	8	38163	38170	25 %	0 %	25 %	50 %	326789169
89	NC_015275	AAGG	2	8	38185	38192	50 %	0 %	50 %	0 %	326789169
90	NC_015275	ACAA	2	8	38486	38493	75 %	0 %	0 %	25 %	326789169
91	NC_015275	TTTA	2	8	39688	39695	25 %	75 %	0 %	0 %	326789170
92	NC_015275	TCAC	2	8	39840	39847	25 %	25 %	0 %	50 %	326789170
93	NC_015275	ACTT	2	8	39946	39953	25 %	50 %	0 %	25 %	326789170
94	NC_015275	AACT	2	8	40080	40087	50 %	25 %	0 %	25 %	326789170
95	NC_015275	AATT	2	8	40152	40159	50 %	50 %	0 %	0 %	326789170
96	NC_015275	AATT	2	8	41557	41564	50 %	50 %	0 %	0 %	326789172
97	NC_015275	TATT	2	8	41798	41805	25 %	75 %	0 %	0 %	326789172
98	NC_015275	AGAA	2	8	43543	43550	75 %	0 %	25 %	0 %	326789174
99	NC_015275	GTAA	2	8	44040	44047	50 %	25 %	25 %	0 %	326789175
100	NC_015275	GATA	2	8	44536	44543	50 %	25 %	25 %	0 %	326789176
101	NC_015275	ATCT	2	8	45286	45293	25 %	50 %	0 %	25 %	326789176
102	NC_015275	AATA	2	8	48740	48747	75 %	25 %	0 %	0 %	326789177
103	NC_015275	AAGG	2	8	48843	48850	50 %	0 %	50 %	0 %	326789177
104	NC_015275	TTGT	2	8	49351	49358	0 %	75 %	25 %	0 %	326789177
105	NC_015275	ATAG	2	8	49428	49435	50 %	25 %	25 %	0 %	326789177
106	NC_015275	AGCA	2	8	50547	50554	50 %	0 %	25 %	25 %	326789178
107	NC_015275	GCTT	2	8	51701	51708	0 %	50 %	25 %	25 %	326789179
108	NC_015275	AGAA	2	8	51750	51757	75 %	0 %	25 %	0 %	326789179
109	NC_015275	AAAG	2	8	51854	51861	75 %	0 %	25 %	0 %	326789179
110	NC_015275	TAAA	2	8	52504	52511	75 %	25 %	0 %	0 %	326789180
111	NC_015275	ATTT	2	8	53134	53141	25 %	75 %	0 %	0 %	326789180
112	NC_015275	TTAT	2	8	53666	53673	25 %	75 %	0 %	0 %	326789180
113	NC_015275	CGTT	2	8	53701	53708	0 %	50 %	25 %	25 %	326789180
114	NC_015275	ATAG	2	8	53737	53744	50 %	25 %	25 %	0 %	326789180
115	NC_015275	GGTT	2	8	53985	53992	0 %	50 %	50 %	0 %	326789181
116	NC_015275	TAAT	2	8	54496	54503	50 %	50 %	0 %	0 %	326789181
117	NC_015275	ATCA	2	8	54634	54641	50 %	25 %	0 %	25 %	326789181
118	NC_015275	TTGG	2	8	54769	54776	0 %	50 %	50 %	0 %	326789181
119	NC_015275	AAGG	2	8	54870	54877	50 %	0 %	50 %	0 %	326789181
120	NC_015275	GATA	2	8	56542	56549	50 %	25 %	25 %	0 %	326789182
121	NC_015275	CAAG	2	8	56612	56619	50 %	0 %	25 %	25 %	326789182
122	NC_015275	CAAG	2	8	57006	57013	50 %	0 %	25 %	25 %	326789182
123	NC_015275	ATGA	2	8	57053	57060	50 %	25 %	25 %	0 %	326789182
124	NC_015275	AGTA	2	8	57211	57218	50 %	25 %	25 %	0 %	326789182
125	NC_015275	TTAC	2	8	57580	57587	25 %	50 %	0 %	25 %	326789182
126	NC_015275	TGAT	2	8	57654	57661	25 %	50 %	25 %	0 %	326789182
127	NC_015275	TGGA	2	8	57846	57853	25 %	25 %	50 %	0 %	326789182
128	NC_015275	AAGC	2	8	58445	58452	50 %	0 %	25 %	25 %	326789183
129	NC_015275	TGTA	2	8	58615	58622	25 %	50 %	25 %	0 %	326789183
130	NC_015275	TAAT	2	8	58678	58685	50 %	50 %	0 %	0 %	326789183
131	NC_015275	CTTA	2	8	60260	60267	25 %	50 %	0 %	25 %	326789184
132	NC_015275	TCTT	2	8	60336	60343	0 %	75 %	0 %	25 %	326789184
133	NC_015275	TAAG	2	8	60500	60507	50 %	25 %	25 %	0 %	326789185
134	NC_015275	TTTA	2	8	61461	61468	25 %	75 %	0 %	0 %	326789186
135	NC_015275	CTTT	2	8	61519	61526	0 %	75 %	0 %	25 %	326789186
136	NC_015275	TTTA	2	8	62195	62202	25 %	75 %	0 %	0 %	326789186
137	NC_015275	AAAT	2	8	62232	62239	75 %	25 %	0 %	0 %	326789186
138	NC_015275	AGAC	2	8	63838	63845	50 %	0 %	25 %	25 %	326789187
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