MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 64615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	CGC	2	6	32	37	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326789140
2	NC_015275	TAT	2	6	69	74	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
3	NC_015275	AGA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
4	NC_015275	TAA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
5	NC_015275	ACT	3	9	283	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789140
6	NC_015275	AGC	2	6	317	322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789140
7	NC_015275	AAT	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
8	NC_015275	GTA	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
9	NC_015275	TGC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789140
10	NC_015275	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789140
11	NC_015275	CTT	2	6	560	565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
12	NC_015275	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
13	NC_015275	TGA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
14	NC_015275	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
15	NC_015275	GAT	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
16	NC_015275	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
17	NC_015275	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
18	NC_015275	TAA	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
19	NC_015275	ATT	3	9	748	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
20	NC_015275	TCC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789140
21	NC_015275	AGA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
22	NC_015275	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
23	NC_015275	TCT	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
24	NC_015275	TAA	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789140
25	NC_015275	ATT	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
26	NC_015275	TAG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789140
27	NC_015275	AGA	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789140
28	NC_015275	TCT	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789140
29	NC_015275	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789140
30	NC_015275	TAC	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789140
31	NC_015275	TAT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789140
32	NC_015275	CAA	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789141
33	NC_015275	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
34	NC_015275	TAG	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
35	NC_015275	TAA	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
36	NC_015275	AAG	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
37	NC_015275	GTT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789141
38	NC_015275	GAT	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
39	NC_015275	TAT	2	6	1907	1912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789141
40	NC_015275	ATA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
41	NC_015275	TAA	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789141
42	NC_015275	GAA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
43	NC_015275	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
44	NC_015275	GTT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789141
45	NC_015275	CTT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789141
46	NC_015275	AAG	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
47	NC_015275	GAT	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
48	NC_015275	TGA	3	9	2609	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789141
49	NC_015275	TAT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789141
50	NC_015275	GAA	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789141
51	NC_015275	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789142
52	NC_015275	TGA	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789142
53	NC_015275	GAA	2	6	3244	3249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789143
54	NC_015275	AAC	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789143
55	NC_015275	TAA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
56	NC_015275	GAA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789143
57	NC_015275	CTG	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789143
58	NC_015275	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789143
59	NC_015275	ATG	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
60	NC_015275	GAT	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
61	NC_015275	ACA	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789143
62	NC_015275	TGA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789143
63	NC_015275	ATA	2	6	3986	3991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
64	NC_015275	TAA	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
65	NC_015275	ATA	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789143
66	NC_015275	GCA	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
67	NC_015275	TAG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
68	NC_015275	TGA	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
69	NC_015275	TTA	2	6	4415	4420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789144
70	NC_015275	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
71	NC_015275	TGG	3	9	4554	4562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
72	NC_015275	AGT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
73	NC_015275	GTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
74	NC_015275	TAA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
75	NC_015275	GAA	2	6	4771	4776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789144
76	NC_015275	AAC	2	6	4802	4807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
77	NC_015275	TAG	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
78	NC_015275	GGT	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
79	NC_015275	ACA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
80	NC_015275	TAA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
81	NC_015275	TAA	2	6	5055	5060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789144
82	NC_015275	GAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
83	NC_015275	CTG	2	6	5204	5209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789144
84	NC_015275	AGC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
85	NC_015275	GCA	2	6	5377	5382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
86	NC_015275	GCA	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
87	NC_015275	TGG	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789144
88	NC_015275	TGA	2	6	5682	5687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
89	NC_015275	ACC	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789144
90	NC_015275	TGA	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
91	NC_015275	GAA	2	6	5911	5916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789144
92	NC_015275	AAC	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789144
93	NC_015275	TGA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
94	NC_015275	GCA	4	12	6043	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789144
95	NC_015275	TGA	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789144
96	NC_015275	ATG	2	6	6179	6184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
97	NC_015275	ATT	2	6	6199	6204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789145
98	NC_015275	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789145
99	NC_015275	TTC	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789145
100	NC_015275	GCT	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789145
101	NC_015275	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
102	NC_015275	ATC	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789145
103	NC_015275	TCA	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789145
104	NC_015275	TTA	2	6	6758	6763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789145
105	NC_015275	AGA	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
106	NC_015275	CTA	2	6	6869	6874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789145
107	NC_015275	TTG	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789145
108	NC_015275	TAA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789145
109	NC_015275	TCA	2	6	7015	7020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789145
110	NC_015275	TGA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
111	NC_015275	AGA	2	6	7126	7131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
112	NC_015275	TAG	2	6	7214	7219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
113	NC_015275	AAG	2	6	7280	7285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
114	NC_015275	AAG	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
115	NC_015275	ATA	2	6	7367	7372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789145
116	NC_015275	TAG	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
117	NC_015275	AAG	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
118	NC_015275	TTG	2	6	7475	7480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789145
119	NC_015275	ATT	2	6	7593	7598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789145
120	NC_015275	TTA	2	6	7604	7609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789145
121	NC_015275	TGA	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
122	NC_015275	TGA	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
123	NC_015275	AAC	2	6	7838	7843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789145
124	NC_015275	TTC	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789145
125	NC_015275	TAA	2	6	7884	7889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789145
126	NC_015275	GAA	2	6	7934	7939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
127	NC_015275	TTA	2	6	7966	7971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789145
128	NC_015275	ATA	2	6	8027	8032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789145
129	NC_015275	GAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789145
130	NC_015275	TAG	2	6	8186	8191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
131	NC_015275	TGA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789145
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