MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	CTTCAA	2	12	2062	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983716
2	NC_015223	ACCTGA	2	12	5625	5636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325983716
3	NC_015223	GATCAT	2	12	7902	7913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325983719
4	NC_015223	TGGTTG	2	12	8424	8435	0 %	50 %	50 %	0 %	325983719
5	NC_015223	GCCGGT	2	12	14920	14931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325983726
6	NC_015223	GTGAAC	2	12	16829	16840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325983726
7	NC_015223	GCGATA	2	12	19096	19107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325983727
8	NC_015223	ATCCCA	2	12	20845	20856	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325983728
9	NC_015223	CATCAC	2	12	26053	26064	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325983734
10	NC_015223	CATGGA	2	12	26331	26342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325983734
11	NC_015223	TTATCA	2	12	29170	29181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325983735
12	NC_015223	TGCCAA	2	12	30323	30334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325983737
13	NC_015223	GCCATC	2	12	31184	31195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325983738
14	NC_015223	TCACAT	2	12	33047	33058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325983740
15	NC_015223	ATCGCA	2	12	34474	34485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325983742
16	NC_015223	ATTTTC	2	12	35614	35625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325983743
17	NC_015223	AGCGGC	2	12	40233	40244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325983748
18	NC_015223	GATCAA	2	12	43830	43841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325983752
19	NC_015223	TTCTTT	2	12	43867	43878	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325983752
20	NC_015223	GATTTT	2	12	51669	51680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325983758
21	NC_015223	TTGCCG	2	12	64201	64212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325983771
22	NC_015223	GCAAAA	2	12	72746	72757	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325983778
23	NC_015223	GAATAA	2	12	75262	75273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325983780
24	NC_015223	TACGGA	2	12	78864	78875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325983782
25	NC_015223	AAAATC	2	12	88589	88600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325983795
26	NC_015223	CTATTG	2	12	91691	91702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325983798
27	NC_015223	CCCATA	2	12	91964	91975	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325983799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.