MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	ATTTT	2	10	2074	2083	20 %	80 %	0 %	0 %	325983716
2	NC_015223	TGAAT	2	10	2873	2882	40 %	40 %	20 %	0 %	325983716
3	NC_015223	GCTGA	2	10	3474	3483	20 %	20 %	40 %	20 %	325983716
4	NC_015223	ATTTA	2	10	4484	4493	40 %	60 %	0 %	0 %	325983716
5	NC_015223	TACTG	2	10	4748	4757	20 %	40 %	20 %	20 %	325983716
6	NC_015223	GTACC	2	10	5653	5662	20 %	20 %	20 %	40 %	325983716
7	NC_015223	GCAAG	2	10	10670	10679	40 %	0 %	40 %	20 %	325983722
8	NC_015223	AAGAT	2	10	10708	10717	60 %	20 %	20 %	0 %	325983722
9	NC_015223	TTAAA	2	10	12448	12457	60 %	40 %	0 %	0 %	325983724
10	NC_015223	TCGAT	2	10	12951	12960	20 %	40 %	20 %	20 %	325983725
11	NC_015223	GCGCT	2	10	15289	15298	0 %	20 %	40 %	40 %	325983726
12	NC_015223	GATTC	2	10	18605	18614	20 %	40 %	20 %	20 %	325983727
13	NC_015223	ATGTT	2	10	18922	18931	20 %	60 %	20 %	0 %	325983727
14	NC_015223	CAAAC	2	10	19725	19734	60 %	0 %	0 %	40 %	325983728
15	NC_015223	CGATG	2	10	22282	22291	20 %	20 %	40 %	20 %	325983730
16	NC_015223	AAAAT	2	10	23526	23535	80 %	20 %	0 %	0 %	325983732
17	NC_015223	GAATG	2	10	24898	24907	40 %	20 %	40 %	0 %	325983734
18	NC_015223	CTTGC	2	10	29120	29129	0 %	40 %	20 %	40 %	325983735
19	NC_015223	AATCA	2	10	29552	29561	60 %	20 %	0 %	20 %	325983736
20	NC_015223	TTCAA	2	10	31170	31179	40 %	40 %	0 %	20 %	325983738
21	NC_015223	TTCTT	2	10	33537	33546	0 %	80 %	0 %	20 %	325983741
22	NC_015223	CCCTG	2	10	34578	34587	0 %	20 %	20 %	60 %	325983742
23	NC_015223	CACGG	2	10	36660	36669	20 %	0 %	40 %	40 %	325983744
24	NC_015223	TCCAG	2	10	36912	36921	20 %	20 %	20 %	40 %	325983744
25	NC_015223	GTGTG	2	10	39362	39371	0 %	40 %	60 %	0 %	325983747
26	NC_015223	GATTG	2	10	39711	39720	20 %	40 %	40 %	0 %	325983747
27	NC_015223	TCAGT	2	10	40306	40315	20 %	40 %	20 %	20 %	325983748
28	NC_015223	AATTA	2	10	40406	40415	60 %	40 %	0 %	0 %	325983748
29	NC_015223	AAAGA	2	10	41643	41652	80 %	0 %	20 %	0 %	325983749
30	NC_015223	GTTTT	2	10	43605	43614	0 %	80 %	20 %	0 %	325983752
31	NC_015223	TCTGC	2	10	51887	51896	0 %	40 %	20 %	40 %	325983758
32	NC_015223	CTCCA	2	10	52162	52171	20 %	20 %	0 %	60 %	325983758
33	NC_015223	CGATT	2	10	52934	52943	20 %	40 %	20 %	20 %	325983759
34	NC_015223	TTCAG	2	10	53232	53241	20 %	40 %	20 %	20 %	325983759
35	NC_015223	GCAGG	2	10	53655	53664	20 %	0 %	60 %	20 %	325983760
36	NC_015223	CAAGA	2	10	55137	55146	60 %	0 %	20 %	20 %	325983763
37	NC_015223	TCTGA	2	10	55308	55317	20 %	40 %	20 %	20 %	325983763
38	NC_015223	ATTTT	2	10	56939	56948	20 %	80 %	0 %	0 %	325983764
39	NC_015223	ATCTG	2	10	58068	58077	20 %	40 %	20 %	20 %	325983764
40	NC_015223	TTCTG	2	10	58578	58587	0 %	60 %	20 %	20 %	325983765
41	NC_015223	ATCAA	2	10	60265	60274	60 %	20 %	0 %	20 %	325983767
42	NC_015223	GTTGA	2	10	63555	63564	20 %	40 %	40 %	0 %	325983771
43	NC_015223	GGTTG	2	10	64796	64805	0 %	40 %	60 %	0 %	325983771
44	NC_015223	ATTGT	2	10	66150	66159	20 %	60 %	20 %	0 %	325983774
45	NC_015223	GCAAT	2	10	67400	67409	40 %	20 %	20 %	20 %	325983774
46	NC_015223	AATTA	2	10	69411	69420	60 %	40 %	0 %	0 %	325983774
47	NC_015223	CTTTA	2	10	70862	70871	20 %	60 %	0 %	20 %	325983776
48	NC_015223	TCAGT	2	10	71127	71136	20 %	40 %	20 %	20 %	325983776
49	NC_015223	TGAGA	2	10	71688	71697	40 %	20 %	40 %	0 %	325983777
50	NC_015223	GGAAT	2	10	75198	75207	40 %	20 %	40 %	0 %	325983780
51	NC_015223	CGAAG	2	10	77914	77923	40 %	0 %	40 %	20 %	325983782
52	NC_015223	GTTTT	2	10	79158	79167	0 %	80 %	20 %	0 %	325983783
53	NC_015223	GCTTT	2	10	79485	79494	0 %	60 %	20 %	20 %	325983783
54	NC_015223	ATTGA	2	10	79842	79851	40 %	40 %	20 %	0 %	325983783
55	NC_015223	TAGAT	2	10	85958	85967	40 %	40 %	20 %	0 %	325983790
56	NC_015223	GCAGC	2	10	86191	86200	20 %	0 %	40 %	40 %	325983790
57	NC_015223	GCTGT	2	10	88066	88075	0 %	40 %	40 %	20 %	325983794
58	NC_015223	CACAC	2	10	91654	91663	40 %	0 %	0 %	60 %	325983798

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.