MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	ATTT	2	8	1318	1325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015223	GCAA	2	8	6496	6503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015223	GAAA	2	8	7865	7872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015223	TCAT	2	8	10862	10869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015223	TCTT	2	8	10919	10926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015223	GTTT	2	8	12655	12662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015223	GGTA	2	8	13816	13823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015223	TTTG	2	8	13927	13934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015223	CCAA	2	8	14183	14190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015223	CACC	2	8	14285	14292	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015223	TAGC	2	8	17982	17989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015223	ACAA	2	8	21026	21033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015223	AAAT	2	8	21727	21734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015223	TTTG	2	8	22833	22840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015223	AATT	2	8	22923	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015223	ATTT	2	8	23421	23428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015223	GATG	2	8	27646	27653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015223	CAAG	2	8	28416	28423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015223	TGCC	2	8	28574	28581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015223	ATGG	2	8	29247	29254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015223	ATAA	3	12	39990	40001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015223	ATTA	2	8	40028	40035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015223	GTTT	2	8	40464	40471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015223	AAAT	2	8	40549	40556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015223	TCAG	2	8	42367	42374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015223	TTTA	2	8	42678	42685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015223	ATGA	2	8	45548	45555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015223	CTAG	2	8	47743	47750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015223	ATAG	2	8	47829	47836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015223	TTAG	2	8	47949	47956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015223	CTAT	2	8	48087	48094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015223	ATTC	2	8	48308	48315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015223	GCGG	2	8	48336	48343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015223	TGCC	2	8	48561	48568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015223	GTCT	2	8	48687	48694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015223	CTAT	2	8	48878	48885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015223	CCTG	2	8	49064	49071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015223	AATA	2	8	49117	49124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015223	ACCT	2	8	49840	49847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015223	ATTT	2	8	50824	50831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015223	TTAA	2	8	50933	50940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015223	ATTA	2	8	50977	50984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015223	ATTT	2	8	51037	51044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015223	ATTT	2	8	51570	51577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015223	ATTA	2	8	54360	54367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015223	TATT	2	8	54371	54378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015223	TATT	2	8	54382	54389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015223	CAAA	2	8	54541	54548	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015223	ACCA	2	8	65029	65036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015223	ATTG	2	8	65917	65924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015223	TTGA	2	8	70610	70617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015223	ACTT	2	8	71246	71253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015223	AGGC	2	8	71342	71349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015223	AAAG	2	8	72051	72058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015223	TTCT	2	8	72395	72402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015223	AGCA	2	8	72438	72445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015223	AAAT	2	8	82961	82968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015223	CTAA	2	8	83000	83007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015223	ATTG	2	8	84946	84953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015223	TAAA	2	8	87415	87422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015223	CCTT	2	8	87862	87869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015223	ACTA	2	8	87935	87942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015223	TATC	2	8	87955	87962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015223	CCTG	2	8	88374	88381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015223	GTTA	2	8	88541	88548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015223	AATA	2	8	88952	88959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015223	ATAA	2	8	88990	88997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015223	GTTA	2	8	89006	89013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015223	ATTT	2	8	90634	90641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015223	GCTT	2	8	91729	91736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015223	TATT	2	8	92662	92669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.