MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	TTTA	2	8	106	113	25 %	75 %	0 %	0 %	325983715
2	NC_015223	ATAC	2	8	370	377	50 %	25 %	0 %	25 %	325983715
3	NC_015223	TGTT	2	8	793	800	0 %	75 %	25 %	0 %	325983715
4	NC_015223	AATC	2	8	1414	1421	50 %	25 %	0 %	25 %	325983716
5	NC_015223	AATC	2	8	1465	1472	50 %	25 %	0 %	25 %	325983716
6	NC_015223	AGCT	2	8	1601	1608	25 %	25 %	25 %	25 %	325983716
7	NC_015223	TTGG	2	8	1631	1638	0 %	50 %	50 %	0 %	325983716
8	NC_015223	CTTG	2	8	1750	1757	0 %	50 %	25 %	25 %	325983716
9	NC_015223	TCTT	2	8	1796	1803	0 %	75 %	0 %	25 %	325983716
10	NC_015223	TAAA	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	325983716
11	NC_015223	TACT	2	8	2173	2180	25 %	50 %	0 %	25 %	325983716
12	NC_015223	ATTT	2	8	2276	2283	25 %	75 %	0 %	0 %	325983716
13	NC_015223	GTAA	2	8	2793	2800	50 %	25 %	25 %	0 %	325983716
14	NC_015223	TTCT	2	8	2812	2819	0 %	75 %	0 %	25 %	325983716
15	NC_015223	CTGA	2	8	3731	3738	25 %	25 %	25 %	25 %	325983716
16	NC_015223	ATTT	2	8	3823	3830	25 %	75 %	0 %	0 %	325983716
17	NC_015223	TAAA	2	8	4157	4164	75 %	25 %	0 %	0 %	325983716
18	NC_015223	AATA	2	8	4385	4392	75 %	25 %	0 %	0 %	325983716
19	NC_015223	AGGA	2	8	4638	4645	50 %	0 %	50 %	0 %	325983716
20	NC_015223	TTCT	2	8	4762	4769	0 %	75 %	0 %	25 %	325983716
21	NC_015223	GTAA	2	8	5712	5719	50 %	25 %	25 %	0 %	325983716
22	NC_015223	GTAA	2	8	5966	5973	50 %	25 %	25 %	0 %	325983717
23	NC_015223	TTGT	2	8	6183	6190	0 %	75 %	25 %	0 %	325983717
24	NC_015223	ACTG	2	8	6274	6281	25 %	25 %	25 %	25 %	325983717
25	NC_015223	TTAT	2	8	6673	6680	25 %	75 %	0 %	0 %	325983718
26	NC_015223	CCTG	2	8	6905	6912	0 %	25 %	25 %	50 %	325983718
27	NC_015223	GCAA	2	8	7274	7281	50 %	0 %	25 %	25 %	325983718
28	NC_015223	AAGC	2	8	7296	7303	50 %	0 %	25 %	25 %	325983718
29	NC_015223	ATCC	2	8	8538	8545	25 %	25 %	0 %	50 %	325983719
30	NC_015223	AAGC	2	8	8775	8782	50 %	0 %	25 %	25 %	325983719
31	NC_015223	TTAT	2	8	10325	10332	25 %	75 %	0 %	0 %	325983721
32	NC_015223	ATCC	2	8	10684	10691	25 %	25 %	0 %	50 %	325983722
33	NC_015223	GGCA	2	8	11896	11903	25 %	0 %	50 %	25 %	325983724
34	NC_015223	ACAT	2	8	11943	11950	50 %	25 %	0 %	25 %	325983724
35	NC_015223	TACA	2	8	12135	12142	50 %	25 %	0 %	25 %	325983724
36	NC_015223	ATTC	2	8	13227	13234	25 %	50 %	0 %	25 %	325983725
37	NC_015223	GGAT	2	8	13235	13242	25 %	25 %	50 %	0 %	325983725
38	NC_015223	GAAA	2	8	13424	13431	75 %	0 %	25 %	0 %	325983725
39	NC_015223	CGGG	2	8	15345	15352	0 %	0 %	75 %	25 %	325983726
40	NC_015223	GCAC	2	8	15935	15942	25 %	0 %	25 %	50 %	325983726
41	NC_015223	AACT	2	8	16036	16043	50 %	25 %	0 %	25 %	325983726
42	NC_015223	AGTG	2	8	16531	16538	25 %	25 %	50 %	0 %	325983726
43	NC_015223	AATC	2	8	16773	16780	50 %	25 %	0 %	25 %	325983726
44	NC_015223	GATT	2	8	17028	17035	25 %	50 %	25 %	0 %	325983726
45	NC_015223	TCAA	2	8	17345	17352	50 %	25 %	0 %	25 %	325983726
46	NC_015223	GAAA	2	8	17362	17369	75 %	0 %	25 %	0 %	325983726
47	NC_015223	TGAC	2	8	17645	17652	25 %	25 %	25 %	25 %	325983726
48	NC_015223	CTTC	2	8	18509	18516	0 %	50 %	0 %	50 %	325983727
49	NC_015223	TGGC	2	8	18977	18984	0 %	25 %	50 %	25 %	325983727
50	NC_015223	GAAT	2	8	19110	19117	50 %	25 %	25 %	0 %	325983727
51	NC_015223	AAAT	2	8	19258	19265	75 %	25 %	0 %	0 %	325983727
52	NC_015223	ACCC	2	8	19481	19488	25 %	0 %	0 %	75 %	325983727
53	NC_015223	CGGT	2	8	19592	19599	0 %	25 %	50 %	25 %	325983728
54	NC_015223	CTCG	2	8	19910	19917	0 %	25 %	25 %	50 %	325983728
55	NC_015223	AAAT	2	8	21181	21188	75 %	25 %	0 %	0 %	325983729
56	NC_015223	TGGG	2	8	22331	22338	0 %	25 %	75 %	0 %	325983730
57	NC_015223	TCCA	2	8	23239	23246	25 %	25 %	0 %	50 %	325983731
58	NC_015223	TAAT	2	8	23494	23501	50 %	50 %	0 %	0 %	325983732
59	NC_015223	GTTT	2	8	23563	23570	0 %	75 %	25 %	0 %	325983732
60	NC_015223	CCCT	2	8	23708	23715	0 %	25 %	0 %	75 %	325983732
61	NC_015223	CTGA	2	8	24598	24605	25 %	25 %	25 %	25 %	325983734
62	NC_015223	TTAT	2	8	25572	25579	25 %	75 %	0 %	0 %	325983734
63	NC_015223	GCAT	2	8	26264	26271	25 %	25 %	25 %	25 %	325983734
64	NC_015223	CACC	2	8	26291	26298	25 %	0 %	0 %	75 %	325983734
65	NC_015223	ACCG	2	8	26514	26521	25 %	0 %	25 %	50 %	325983734
66	NC_015223	CGGG	2	8	26921	26928	0 %	0 %	75 %	25 %	325983734
67	NC_015223	AACC	2	8	29000	29007	50 %	0 %	0 %	50 %	325983735
68	NC_015223	TTGC	2	8	29104	29111	0 %	50 %	25 %	25 %	325983735
69	NC_015223	GCCA	2	8	30192	30199	25 %	0 %	25 %	50 %	325983737
70	NC_015223	CTTT	2	8	31130	31137	0 %	75 %	0 %	25 %	325983738
71	NC_015223	ATTG	2	8	31488	31495	25 %	50 %	25 %	0 %	325983739
72	NC_015223	CATA	2	8	31844	31851	50 %	25 %	0 %	25 %	325983739
73	NC_015223	TGAT	2	8	31934	31941	25 %	50 %	25 %	0 %	325983739
74	NC_015223	ATTG	2	8	32011	32018	25 %	50 %	25 %	0 %	325983739
75	NC_015223	ACCC	2	8	32418	32425	25 %	0 %	0 %	75 %	325983740
76	NC_015223	CCTT	2	8	34182	34189	0 %	50 %	0 %	50 %	325983742
77	NC_015223	ATGG	2	8	34230	34237	25 %	25 %	50 %	0 %	325983742
78	NC_015223	GATG	2	8	34627	34634	25 %	25 %	50 %	0 %	325983742
79	NC_015223	ATCC	2	8	34732	34739	25 %	25 %	0 %	50 %	325983742
80	NC_015223	CCAG	2	8	35124	35131	25 %	0 %	25 %	50 %	325983743
81	NC_015223	CATT	2	8	35240	35247	25 %	50 %	0 %	25 %	325983743
82	NC_015223	ATGC	2	8	35367	35374	25 %	25 %	25 %	25 %	325983743
83	NC_015223	CAAT	2	8	35514	35521	50 %	25 %	0 %	25 %	325983743
84	NC_015223	TTTG	2	8	35670	35677	0 %	75 %	25 %	0 %	325983743
85	NC_015223	CTGA	2	8	36492	36499	25 %	25 %	25 %	25 %	325983744
86	NC_015223	CAAA	2	8	36549	36556	75 %	0 %	0 %	25 %	325983744
87	NC_015223	CATC	2	8	37019	37026	25 %	25 %	0 %	50 %	325983744
88	NC_015223	TTCA	2	8	37608	37615	25 %	50 %	0 %	25 %	325983744
89	NC_015223	GATG	2	8	38465	38472	25 %	25 %	50 %	0 %	325983745
90	NC_015223	GAAT	2	8	38937	38944	50 %	25 %	25 %	0 %	325983746
91	NC_015223	GATT	2	8	39725	39732	25 %	50 %	25 %	0 %	325983747
92	NC_015223	GCTT	2	8	39917	39924	0 %	50 %	25 %	25 %	325983747
93	NC_015223	ACTC	2	8	40123	40130	25 %	25 %	0 %	50 %	325983748
94	NC_015223	TGTT	2	8	40393	40400	0 %	75 %	25 %	0 %	325983748
95	NC_015223	AAGA	2	8	41854	41861	75 %	0 %	25 %	0 %	325983749
96	NC_015223	ATTA	2	8	41987	41994	50 %	50 %	0 %	0 %	325983750
97	NC_015223	ATTT	2	8	42033	42040	25 %	75 %	0 %	0 %	325983750
98	NC_015223	ACAA	2	8	42097	42104	75 %	0 %	0 %	25 %	325983750
99	NC_015223	ACAA	2	8	42550	42557	75 %	0 %	0 %	25 %	325983751
100	NC_015223	TCTT	2	8	43409	43416	0 %	75 %	0 %	25 %	325983752
101	NC_015223	TAGC	2	8	43530	43537	25 %	25 %	25 %	25 %	325983752
102	NC_015223	AACT	2	8	43680	43687	50 %	25 %	0 %	25 %	325983752
103	NC_015223	GGAA	2	8	43702	43709	50 %	0 %	50 %	0 %	325983752
104	NC_015223	ATAA	2	8	44002	44009	75 %	25 %	0 %	0 %	325983752
105	NC_015223	TTGT	2	8	44049	44056	0 %	75 %	25 %	0 %	325983752
106	NC_015223	AACC	2	8	44576	44583	50 %	0 %	0 %	50 %	325983753
107	NC_015223	CAAC	2	8	44916	44923	50 %	0 %	0 %	50 %	325983753
108	NC_015223	CTAC	2	8	45213	45220	25 %	25 %	0 %	50 %	325983754
109	NC_015223	CTTT	2	8	45506	45513	0 %	75 %	0 %	25 %	325983754
110	NC_015223	GAAG	2	8	46285	46292	50 %	0 %	50 %	0 %	325983755
111	NC_015223	TCAA	2	8	46299	46306	50 %	25 %	0 %	25 %	325983755
112	NC_015223	CCAT	2	8	46472	46479	25 %	25 %	0 %	50 %	325983755
113	NC_015223	TAAA	2	8	46646	46653	75 %	25 %	0 %	0 %	325983755
114	NC_015223	TCGA	2	8	47182	47189	25 %	25 %	25 %	25 %	325983757
115	NC_015223	ATTC	2	8	47229	47236	25 %	50 %	0 %	25 %	325983757
116	NC_015223	TGCC	2	8	47323	47330	0 %	25 %	25 %	50 %	325983757
117	NC_015223	TGTT	2	8	47473	47480	0 %	75 %	25 %	0 %	325983757
118	NC_015223	CTTT	2	8	51792	51799	0 %	75 %	0 %	25 %	325983758
119	NC_015223	GATT	2	8	51970	51977	25 %	50 %	25 %	0 %	325983758
120	NC_015223	TAAA	2	8	51987	51994	75 %	25 %	0 %	0 %	325983758
121	NC_015223	ATTT	2	8	52711	52718	25 %	75 %	0 %	0 %	325983758
122	NC_015223	ATTA	2	8	52742	52749	50 %	50 %	0 %	0 %	325983758
123	NC_015223	AATT	2	8	52969	52976	50 %	50 %	0 %	0 %	325983759
124	NC_015223	TCCA	2	8	53491	53498	25 %	25 %	0 %	50 %	325983760
125	NC_015223	ATGA	2	8	53623	53630	50 %	25 %	25 %	0 %	325983760
126	NC_015223	TCAA	2	8	53756	53763	50 %	25 %	0 %	25 %	325983760
127	NC_015223	ACGA	2	8	54005	54012	50 %	0 %	25 %	25 %	325983761
128	NC_015223	TTCG	2	8	54296	54303	0 %	50 %	25 %	25 %	325983761
129	NC_015223	CTGA	2	8	55125	55132	25 %	25 %	25 %	25 %	325983763
130	NC_015223	TCAG	2	8	55156	55163	25 %	25 %	25 %	25 %	325983763
131	NC_015223	ACAT	2	8	55405	55412	50 %	25 %	0 %	25 %	325983763
132	NC_015223	AATA	2	8	55418	55425	75 %	25 %	0 %	0 %	325983763
133	NC_015223	CACT	2	8	55627	55634	25 %	25 %	0 %	50 %	325983763
134	NC_015223	GTTG	2	8	55724	55731	0 %	50 %	50 %	0 %	325983763
135	NC_015223	GATC	2	8	55767	55774	25 %	25 %	25 %	25 %	325983763
136	NC_015223	CAAT	2	8	56494	56501	50 %	25 %	0 %	25 %	325983763
137	NC_015223	CCAG	2	8	57486	57493	25 %	0 %	25 %	50 %	325983764
138	NC_015223	ATGG	2	8	57613	57620	25 %	25 %	50 %	0 %	325983764
139	NC_015223	ATCA	2	8	58774	58781	50 %	25 %	0 %	25 %	325983765
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.