MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015222	AAATAA	2	12	1559	1570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015222	ATACTT	2	12	37380	37391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015222	CTCATT	2	12	59061	59072	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015222	ATTTTT	2	12	96218	96229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015222	TAAAAA	2	12	114254	114265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015222	GAGTCA	2	12	153027	153038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015222	AGAAAT	2	12	209466	209477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015222	GTTCTT	2	12	244385	244396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015222	CGTGAT	2	12	280663	280674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015222	TTTAGA	2	12	376141	376152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015222	TTCTCA	2	12	443586	443597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015222	TTTTAT	2	12	451187	451198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015222	AGATGC	3	18	476252	476269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015222	TTCTGT	2	12	493023	493034	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015222	TTTCCA	2	12	523037	523048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015222	TGATAC	2	12	533828	533839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015222	AACCTG	2	12	565650	565661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015222	TTTAAA	2	12	575246	575257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015222	ATTGAA	2	12	588536	588547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015222	CTTAAT	2	12	608222	608233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015222	TGCAAC	2	12	621480	621491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015222	ATATGA	2	12	623325	623336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015222	CTATAA	2	12	664934	664945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015222	AAATAG	2	12	695712	695723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015222	AAAGAA	2	12	719567	719578	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015222	TCTCAA	2	12	719594	719605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015222	TATATT	2	12	723528	723539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015222	GTGATT	2	12	724125	724136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015222	TAGTTT	2	12	749043	749054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015222	TGTTAT	2	12	751596	751607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015222	TTATAC	2	12	766868	766879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015222	CCTTTC	2	12	782036	782047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015222	CGAGCG	2	12	783274	783285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015222	GAATTA	2	12	798996	799007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015222	TAAATC	2	12	812390	812401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015222	AAAAAT	2	12	812650	812661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015222	CTTTAC	2	12	817132	817143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015222	TAGAAT	2	12	879820	879831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015222	AGGGAT	2	12	910795	910806	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015222	AATCTA	2	12	910965	910976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015222	TATTCA	2	12	975327	975338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015222	TTGTTT	2	12	978950	978961	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015222	TTTTTC	2	12	983683	983694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015222	ATAAAA	2	12	987674	987685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015222	GATATA	2	12	994260	994271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015222	TGAAAA	3	18	1057381	1057398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015222	AGTAAT	2	12	1057410	1057421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015222	ATTACT	2	12	1067214	1067225	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015222	ATGTTA	2	12	1131999	1132010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015222	TCAAAA	2	12	1153592	1153603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015222	CTTATT	2	12	1153647	1153658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015222	TCCGCT	2	12	1183362	1183373	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015222	TTAAAA	2	12	1184582	1184593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015222	GGTATT	2	12	1222561	1222572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015222	GATATT	2	12	1222573	1222584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015222	TTGTTA	2	12	1284046	1284057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015222	TGAAAA	2	12	1323530	1323541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015222	GCATGT	6	36	1325393	1325428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015222	TTATGC	2	12	1347793	1347804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015222	TTTTTC	2	12	1351557	1351568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015222	CGATGG	2	12	1351975	1351986	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015222	AAGTTC	2	12	1366081	1366092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015222	AAAGCA	2	12	1375684	1375695	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015222	ATCAGG	2	12	1384852	1384863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015222	ACTATA	2	12	1409467	1409478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015222	AAGCGT	2	12	1434532	1434543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015222	CAGTTC	2	12	1447316	1447327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015222	TTAAAA	2	12	1455871	1455882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015222	ATTTTT	2	12	1468217	1468228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015222	CTTTCT	2	12	1481252	1481263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015222	CTTGAA	2	12	1530537	1530548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015222	CTAATA	2	12	1540885	1540896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015222	TGTTCA	2	12	1551868	1551879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015222	TTCCGG	2	12	1560609	1560620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015222	CTTTAT	2	12	1575462	1575473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015222	GAAATA	2	12	1585170	1585181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015222	TTTTTC	2	12	1588616	1588627	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015222	AAAATC	2	12	1602117	1602128	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015222	GATAAG	2	12	1621132	1621143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015222	GAATAA	2	12	1635808	1635819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015222	AGTAGC	2	12	1696431	1696442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015222	AATTTG	2	12	1727582	1727593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015222	AATCAT	2	12	1738154	1738165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015222	CTTTTT	2	12	1762979	1762990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015222	TTAAAT	2	12	1772768	1772779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015222	AAGCCA	2	12	1808441	1808452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015222	TTGGAG	2	12	1823489	1823500	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015222	AATTTG	2	12	1824200	1824211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015222	TTAGCT	2	12	1844624	1844635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015222	ATCCCT	2	12	1845293	1845304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015222	AATTTC	2	12	1851493	1851504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015222	CAGATT	3	18	1853817	1853834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015222	ACAGAG	2	12	1856762	1856773	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015222	AAACCA	2	12	1910270	1910281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015222	TTTTTC	2	12	1911006	1911017	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015222	TATGGA	2	12	1939427	1939438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015222	TATTTA	2	12	2001058	2001069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015222	AATCTT	2	12	2007582	2007593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015222	CCATTC	2	12	2013217	2013228	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015222	AAATAA	2	12	2052508	2052519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015222	TTAACT	2	12	2077618	2077629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015222	AGCGGA	2	12	2138529	2138540	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015222	CAAAAA	2	12	2151089	2151100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015222	ATTTTG	2	12	2163492	2163503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015222	GAGGCA	8	48	2178976	2179023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015222	ATTACC	2	12	2219298	2219309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015222	GCCAAG	2	12	2251621	2251632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015222	CTTTTT	2	12	2309851	2309862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015222	CAAGGT	2	12	2310787	2310798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015222	TTTTTC	2	12	2414143	2414154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015222	CGTTTG	2	12	2425883	2425894	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015222	TCCACT	2	12	2425937	2425948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015222	CTGATG	2	12	2516374	2516385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015222	ATGTGA	2	12	2524625	2524636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015222	ATTAAA	2	12	2536056	2536067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015222	AAAGAA	2	12	2562629	2562640	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015222	TAACGA	2	12	2567505	2567516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015222	ACAATC	2	12	2578794	2578805	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015222	TTAAAA	2	12	2584648	2584659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015222	TTTTTC	2	12	2604208	2604219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015222	TAAAGG	2	12	2658509	2658520	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015222	GATCAA	2	12	2674680	2674691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015222	TAACAA	2	12	2681986	2681997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015222	TTATAA	2	12	2694090	2694101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015222	TTTGAT	2	12	2747052	2747063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015222	GAATTA	2	12	2775742	2775753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015222	CCACAC	2	12	2777167	2777178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015222	TCTGTA	2	12	2799447	2799458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015222	CAATCC	2	12	2842915	2842926	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015222	AATTGA	2	12	2843600	2843611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015222	AATAAG	2	12	2843781	2843792	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015222	TAGAAG	2	12	2845679	2845690	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015222	CGTTGT	2	12	2852113	2852124	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015222	AACTTT	2	12	2887132	2887143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_015222	AAATAT	2	12	2895788	2895799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015222	CAACAT	2	12	2957872	2957883	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015222	ACTATA	2	12	2985135	2985146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015222	TCATAA	2	12	2985737	2985748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_015222	TCACTT	2	12	2997258	2997269	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015222	ACTCGC	2	12	3019358	3019369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015222	CGATAC	2	12	3019821	3019832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015222	TTTAAT	2	12	3024681	3024692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015222	TTTTTC	2	12	3026802	3026813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_015222	ATTTAT	2	12	3029995	3030006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015222	GGGGCA	2	12	3038403	3038414	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_015222	TGCCCC	2	12	3044078	3044089	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_015222	ATTTGT	2	12	3064563	3064574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015222	TATTTC	2	12	3066994	3067005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_015222	AAAGTT	2	12	3072917	3072928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015222	GAAAAA	2	12	3123634	3123645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015222	GTAAAA	2	12	3127383	3127394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015222	AATTGA	2	12	3130818	3130829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015222	CAGGAA	2	12	3142791	3142802	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.