MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 9168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015222	CAAT	2	8	475	482	50 %	25 %	0 %	25 %	325980882
2	NC_015222	TTGC	2	8	1133	1140	0 %	50 %	25 %	25 %	325980882
3	NC_015222	TTTC	2	8	2313	2320	0 %	75 %	0 %	25 %	325980883
4	NC_015222	CCAA	2	8	2460	2467	50 %	0 %	0 %	50 %	325980883
5	NC_015222	CCGT	2	8	2911	2918	0 %	25 %	25 %	50 %	325980884
6	NC_015222	GATC	2	8	3476	3483	25 %	25 %	25 %	25 %	325980884
7	NC_015222	ACGC	2	8	3731	3738	25 %	0 %	25 %	50 %	325980884
8	NC_015222	AAGC	2	8	4968	4975	50 %	0 %	25 %	25 %	325980884
9	NC_015222	GGTT	2	8	7241	7248	0 %	50 %	50 %	0 %	325980886
10	NC_015222	CCGG	2	8	7759	7766	0 %	0 %	50 %	50 %	325980886
11	NC_015222	ATAA	2	8	8157	8164	75 %	25 %	0 %	0 %	325980886
12	NC_015222	CACG	2	8	8332	8339	25 %	0 %	25 %	50 %	325980887
13	NC_015222	GCTG	2	8	8449	8456	0 %	25 %	50 %	25 %	325980887
14	NC_015222	GTTG	2	8	9049	9056	0 %	50 %	50 %	0 %	325980887
15	NC_015222	CGTG	2	8	9197	9204	0 %	25 %	50 %	25 %	325980887
16	NC_015222	AAAC	2	8	9297	9304	75 %	0 %	0 %	25 %	325980888
17	NC_015222	TGAT	2	8	9654	9661	25 %	50 %	25 %	0 %	325980889
18	NC_015222	CGAT	2	8	10401	10408	25 %	25 %	25 %	25 %	325980890
19	NC_015222	TGGT	2	8	10608	10615	0 %	50 %	50 %	0 %	325980890
20	NC_015222	ATGG	2	8	11161	11168	25 %	25 %	50 %	0 %	325980890
21	NC_015222	GGTA	2	8	11374	11381	25 %	25 %	50 %	0 %	325980890
22	NC_015222	CAAT	2	8	11874	11881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015222	TTCT	2	8	12067	12074	0 %	75 %	0 %	25 %	325980891
24	NC_015222	TCAG	2	8	12277	12284	25 %	25 %	25 %	25 %	325980891
25	NC_015222	AATC	2	8	12386	12393	50 %	25 %	0 %	25 %	325980891
26	NC_015222	CCAT	2	8	12492	12499	25 %	25 %	0 %	50 %	325980891
27	NC_015222	GTCA	2	8	12536	12543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015222	ATCA	2	8	13134	13141	50 %	25 %	0 %	25 %	325980892
29	NC_015222	TGTT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	25 %	0 %	325980893
30	NC_015222	AGCA	2	8	13856	13863	50 %	0 %	25 %	25 %	325980894
31	NC_015222	TGCC	2	8	14190	14197	0 %	25 %	25 %	50 %	325980894
32	NC_015222	GAAT	2	8	14538	14545	50 %	25 %	25 %	0 %	325980894
33	NC_015222	GTAT	2	8	15160	15167	25 %	50 %	25 %	0 %	325980895
34	NC_015222	AGAA	2	8	15524	15531	75 %	0 %	25 %	0 %	325980896
35	NC_015222	TGCC	2	8	16228	16235	0 %	25 %	25 %	50 %	325980897
36	NC_015222	TTGA	2	8	16639	16646	25 %	50 %	25 %	0 %	325980898
37	NC_015222	TAAT	2	8	17406	17413	50 %	50 %	0 %	0 %	325980899
38	NC_015222	GGTT	2	8	17695	17702	0 %	50 %	50 %	0 %	325980899
39	NC_015222	TGGT	2	8	17944	17951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015222	CCCA	2	8	18194	18201	25 %	0 %	0 %	75 %	325980900
41	NC_015222	AAAT	2	8	18307	18314	75 %	25 %	0 %	0 %	325980900
42	NC_015222	ATCA	2	8	18922	18929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015222	TGAT	2	8	18940	18947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015222	ACGC	2	8	19218	19225	25 %	0 %	25 %	50 %	325980901
45	NC_015222	CCAT	2	8	19717	19724	25 %	25 %	0 %	50 %	325980901
46	NC_015222	TTCG	2	8	20418	20425	0 %	50 %	25 %	25 %	325980902
47	NC_015222	ACCA	2	8	22019	22026	50 %	0 %	0 %	50 %	325980903
48	NC_015222	TCAG	2	8	22308	22315	25 %	25 %	25 %	25 %	325980903
49	NC_015222	TCCA	2	8	22527	22534	25 %	25 %	0 %	50 %	325980903
50	NC_015222	ATCA	2	8	22935	22942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015222	CATT	2	8	22999	23006	25 %	50 %	0 %	25 %	325980904
52	NC_015222	CTTC	2	8	23159	23166	0 %	50 %	0 %	50 %	325980904
53	NC_015222	TGAA	2	8	23961	23968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015222	TTTG	2	8	24418	24425	0 %	75 %	25 %	0 %	325980905
55	NC_015222	TGTT	2	8	24587	24594	0 %	75 %	25 %	0 %	325980905
56	NC_015222	CAAT	2	8	24895	24902	50 %	25 %	0 %	25 %	325980905
57	NC_015222	GGTG	2	8	25176	25183	0 %	25 %	75 %	0 %	325980905
58	NC_015222	CCAA	2	8	25187	25194	50 %	0 %	0 %	50 %	325980905
59	NC_015222	GCCA	2	8	25393	25400	25 %	0 %	25 %	50 %	325980905
60	NC_015222	CATC	2	8	25972	25979	25 %	25 %	0 %	50 %	325980905
61	NC_015222	ATTT	2	8	26287	26294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015222	GCAA	2	8	27548	27555	50 %	0 %	25 %	25 %	325980906
63	NC_015222	GTGC	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	325980907
64	NC_015222	GCTC	2	8	28788	28795	0 %	25 %	25 %	50 %	325980907
65	NC_015222	GCGT	2	8	28875	28882	0 %	25 %	50 %	25 %	325980907
66	NC_015222	TACG	2	8	29090	29097	25 %	25 %	25 %	25 %	325980907
67	NC_015222	GTAT	2	8	29183	29190	25 %	50 %	25 %	0 %	325980907
68	NC_015222	CAAA	2	8	29923	29930	75 %	0 %	0 %	25 %	325980908
69	NC_015222	TGAT	2	8	31095	31102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015222	ATTG	2	8	31314	31321	25 %	50 %	25 %	0 %	325980909
71	NC_015222	GTGG	2	8	31642	31649	0 %	25 %	75 %	0 %	325980909
72	NC_015222	ATAA	2	8	32218	32225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015222	CAAG	2	8	32360	32367	50 %	0 %	25 %	25 %	325980910
74	NC_015222	TCAA	2	8	32843	32850	50 %	25 %	0 %	25 %	325980910
75	NC_015222	ATGA	2	8	33219	33226	50 %	25 %	25 %	0 %	325980911
76	NC_015222	GGTG	2	8	33323	33330	0 %	25 %	75 %	0 %	325980911
77	NC_015222	TATT	2	8	33491	33498	25 %	75 %	0 %	0 %	325980911
78	NC_015222	CGAT	2	8	34119	34126	25 %	25 %	25 %	25 %	325980912
79	NC_015222	CTGT	2	8	34559	34566	0 %	50 %	25 %	25 %	325980912
80	NC_015222	TAAA	2	8	34685	34692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015222	AGAA	2	8	35078	35085	75 %	0 %	25 %	0 %	325980913
82	NC_015222	CTGC	2	8	35865	35872	0 %	25 %	25 %	50 %	325980914
83	NC_015222	TTGA	2	8	35880	35887	25 %	50 %	25 %	0 %	325980914
84	NC_015222	TATT	2	8	36043	36050	25 %	75 %	0 %	0 %	325980914
85	NC_015222	AATT	2	8	36511	36518	50 %	50 %	0 %	0 %	325980914
86	NC_015222	GTCA	2	8	36900	36907	25 %	25 %	25 %	25 %	325980914
87	NC_015222	GTAC	2	8	37002	37009	25 %	25 %	25 %	25 %	325980914
88	NC_015222	TGAA	2	8	37204	37211	50 %	25 %	25 %	0 %	325980914
89	NC_015222	ATTA	2	8	37773	37780	50 %	50 %	0 %	0 %	325980915
90	NC_015222	AAAT	2	8	38245	38252	75 %	25 %	0 %	0 %	325980917
91	NC_015222	CATG	2	8	38423	38430	25 %	25 %	25 %	25 %	325980917
92	NC_015222	AGCA	2	8	39094	39101	50 %	0 %	25 %	25 %	325980918
93	NC_015222	GTTG	2	8	39241	39248	0 %	50 %	50 %	0 %	325980918
94	NC_015222	AAGC	2	8	39254	39261	50 %	0 %	25 %	25 %	325980918
95	NC_015222	ATTT	2	8	39290	39297	25 %	75 %	0 %	0 %	325980918
96	NC_015222	GTTT	2	8	39311	39318	0 %	75 %	25 %	0 %	325980919
97	NC_015222	TTTG	2	8	39498	39505	0 %	75 %	25 %	0 %	325980919
98	NC_015222	GTTT	2	8	39508	39515	0 %	75 %	25 %	0 %	325980919
99	NC_015222	ATTG	2	8	39845	39852	25 %	50 %	25 %	0 %	325980919
100	NC_015222	CAGC	2	8	39895	39902	25 %	0 %	25 %	50 %	325980919
101	NC_015222	ATTG	2	8	40497	40504	25 %	50 %	25 %	0 %	325980920
102	NC_015222	GCCT	2	8	41627	41634	0 %	25 %	25 %	50 %	325980921
103	NC_015222	AACT	2	8	41636	41643	50 %	25 %	0 %	25 %	325980921
104	NC_015222	ATCA	2	8	41660	41667	50 %	25 %	0 %	25 %	325980921
105	NC_015222	TCAA	2	8	41769	41776	50 %	25 %	0 %	25 %	325980922
106	NC_015222	CAGT	2	8	42195	42202	25 %	25 %	25 %	25 %	325980922
107	NC_015222	CAAG	2	8	42355	42362	50 %	0 %	25 %	25 %	325980922
108	NC_015222	GCTC	2	8	42406	42413	0 %	25 %	25 %	50 %	325980922
109	NC_015222	ATTA	2	8	42550	42557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015222	GAAT	2	8	42754	42761	50 %	25 %	25 %	0 %	325980923
111	NC_015222	GATT	2	8	42892	42899	25 %	50 %	25 %	0 %	325980923
112	NC_015222	TCGA	2	8	42980	42987	25 %	25 %	25 %	25 %	325980923
113	NC_015222	GGTG	2	8	43003	43010	0 %	25 %	75 %	0 %	325980923
114	NC_015222	GCAG	2	8	43018	43025	25 %	0 %	50 %	25 %	325980923
115	NC_015222	TCAA	2	8	43224	43231	50 %	25 %	0 %	25 %	325980923
116	NC_015222	GTTC	2	8	43597	43604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015222	GGTG	2	8	44437	44444	0 %	25 %	75 %	0 %	325980924
118	NC_015222	GGCG	2	8	44655	44662	0 %	0 %	75 %	25 %	325980924
119	NC_015222	CGTT	2	8	44744	44751	0 %	50 %	25 %	25 %	325980924
120	NC_015222	TTTC	2	8	44840	44847	0 %	75 %	0 %	25 %	325980924
121	NC_015222	AATA	2	8	44853	44860	75 %	25 %	0 %	0 %	325980924
122	NC_015222	AGCC	2	8	44978	44985	25 %	0 %	25 %	50 %	325980924
123	NC_015222	CTTC	2	8	45553	45560	0 %	50 %	0 %	50 %	325980924
124	NC_015222	TCAC	2	8	46045	46052	25 %	25 %	0 %	50 %	325980925
125	NC_015222	ATAA	2	8	46196	46203	75 %	25 %	0 %	0 %	325980925
126	NC_015222	ACCG	2	8	46215	46222	25 %	0 %	25 %	50 %	325980925
127	NC_015222	GCTG	2	8	46344	46351	0 %	25 %	50 %	25 %	325980925
128	NC_015222	ACTG	2	8	46447	46454	25 %	25 %	25 %	25 %	325980925
129	NC_015222	ATTC	2	8	46901	46908	25 %	50 %	0 %	25 %	325980925
130	NC_015222	ACAA	2	8	47022	47029	75 %	0 %	0 %	25 %	325980925
131	NC_015222	ATGC	2	8	47333	47340	25 %	25 %	25 %	25 %	325980925
132	NC_015222	CATC	2	8	47609	47616	25 %	25 %	0 %	50 %	325980925
133	NC_015222	CAGC	2	8	47978	47985	25 %	0 %	25 %	50 %	325980925
134	NC_015222	CCAT	2	8	48251	48258	25 %	25 %	0 %	50 %	325980925
135	NC_015222	GATG	2	8	48950	48957	25 %	25 %	50 %	0 %	325980925
136	NC_015222	GCAT	2	8	49292	49299	25 %	25 %	25 %	25 %	325980926
137	NC_015222	GCTT	2	8	49404	49411	0 %	50 %	25 %	25 %	325980926
138	NC_015222	GGCA	2	8	50351	50358	25 %	0 %	50 %	25 %	325980927
139	NC_015222	CCTC	2	8	50464	50471	0 %	25 %	0 %	75 %	325980927
140	NC_015222	GTTT	2	8	50539	50546	0 %	75 %	25 %	0 %	325980927
141	NC_015222	AGAT	2	8	50604	50611	50 %	25 %	25 %	0 %	325980928
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