MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	GCCCTC	2	12	2778	2789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325980821
2	NC_015221	GAAGCG	2	12	4859	4870	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325980823
3	NC_015221	TACCAA	2	12	6975	6986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325980826
4	NC_015221	TCACAT	2	12	9679	9690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980829
5	NC_015221	ACAAGG	2	12	10633	10644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325980830
6	NC_015221	ATCGCA	2	12	11112	11123	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325980831
7	NC_015221	TTTTCA	2	12	12271	12282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325980832
8	NC_015221	AGCGGC	2	12	18105	18116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325980837
9	NC_015221	AATGAA	2	12	19832	19843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325980840
10	NC_015221	GTACGT	2	12	41689	41700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325980862
11	NC_015221	ATCACG	2	12	54239	54250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325980872
12	NC_015221	GGCGAT	2	12	58554	58565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325980874
13	NC_015221	TGGGAG	4	24	59521	59544	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	325980874
14	NC_015221	CCGCAC	2	12	60570	60581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325980876
15	NC_015221	CCATAT	2	12	60747	60758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.