MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	ACAT	2	8	54	61	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015221	CTGA	2	8	402	409	25 %	25 %	25 %	25 %	325980817
3	NC_015221	CACT	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	325980818
4	NC_015221	CATT	2	8	1495	1502	25 %	50 %	0 %	25 %	325980818
5	NC_015221	TTCT	2	8	1891	1898	0 %	75 %	0 %	25 %	325980819
6	NC_015221	CCTC	2	8	2770	2777	0 %	25 %	0 %	75 %	325980821
7	NC_015221	GCTG	2	8	3265	3272	0 %	25 %	50 %	25 %	325980822
8	NC_015221	GCCA	2	8	3314	3321	25 %	0 %	25 %	50 %	325980822
9	NC_015221	CCAC	2	8	3998	4005	25 %	0 %	0 %	75 %	325980823
10	NC_015221	GTGC	2	8	4553	4560	0 %	25 %	50 %	25 %	325980823
11	NC_015221	CCGG	2	8	4581	4588	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
12	NC_015221	CGGC	2	8	4698	4705	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
13	NC_015221	CGGC	2	8	4746	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
14	NC_015221	GCCG	2	8	4810	4817	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
15	NC_015221	TTAA	2	8	6022	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015221	GCCA	2	8	6844	6851	25 %	0 %	25 %	50 %	325980826
17	NC_015221	CTAT	2	8	7202	7209	25 %	50 %	0 %	25 %	325980826
18	NC_015221	TTCT	2	8	7784	7791	0 %	75 %	0 %	25 %	325980827
19	NC_015221	ATTG	2	8	8141	8148	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
20	NC_015221	TGAT	2	8	8587	8594	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
21	NC_015221	ATTG	2	8	8664	8671	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
22	NC_015221	ACCC	2	8	9071	9078	25 %	0 %	0 %	75 %	325980829
23	NC_015221	ATCT	2	8	9572	9579	25 %	50 %	0 %	25 %	325980829
24	NC_015221	TGAC	2	8	10317	10324	25 %	25 %	25 %	25 %	325980830
25	NC_015221	CCTT	2	8	10820	10827	0 %	50 %	0 %	50 %	325980831
26	NC_015221	CCAG	2	8	11241	11248	25 %	0 %	25 %	50 %	325980831
27	NC_015221	ATCC	2	8	11370	11377	25 %	25 %	0 %	50 %	325980831
28	NC_015221	CTGC	2	8	11412	11419	0 %	25 %	25 %	50 %	325980831
29	NC_015221	CCAG	2	8	11780	11787	25 %	0 %	25 %	50 %	325980832
30	NC_015221	ATGC	2	8	12023	12030	25 %	25 %	25 %	25 %	325980832
31	NC_015221	CAAT	2	8	12170	12177	50 %	25 %	0 %	25 %	325980832
32	NC_015221	TTTG	2	8	12326	12333	0 %	75 %	25 %	0 %	325980832
33	NC_015221	CAAA	2	8	13205	13212	75 %	0 %	0 %	25 %	325980833
34	NC_015221	CCAC	2	8	13311	13318	25 %	0 %	0 %	75 %	325980833
35	NC_015221	CATC	2	8	13675	13682	25 %	25 %	0 %	50 %	325980833
36	NC_015221	GTAA	2	8	15006	15013	50 %	25 %	25 %	0 %	325980834
37	NC_015221	GATG	2	8	15121	15128	25 %	25 %	50 %	0 %	325980834
38	NC_015221	CCAG	2	8	15522	15529	25 %	0 %	25 %	50 %	325980835
39	NC_015221	TTGC	2	8	15564	15571	0 %	50 %	25 %	25 %	325980835
40	NC_015221	CAAG	2	8	16670	16677	50 %	0 %	25 %	25 %	325980836
41	NC_015221	CAAG	2	8	16724	16731	50 %	0 %	25 %	25 %	325980836
42	NC_015221	CATA	2	8	17175	17182	50 %	25 %	0 %	25 %	325980836
43	NC_015221	ATGA	2	8	17338	17345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015221	TTAA	2	8	17351	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015221	GATT	2	8	17601	17608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015221	ATAA	2	8	17866	17873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015221	ACTC	2	8	17995	18002	25 %	25 %	0 %	50 %	325980837
48	NC_015221	TGTT	2	8	18265	18272	0 %	75 %	25 %	0 %	325980837
49	NC_015221	GTTT	2	8	18334	18341	0 %	75 %	25 %	0 %	325980838
50	NC_015221	AAGA	2	8	18725	18732	75 %	0 %	25 %	0 %	325980839
51	NC_015221	GACA	2	8	19229	19236	50 %	0 %	25 %	25 %	325980839
52	NC_015221	AAGA	2	8	19725	19732	75 %	0 %	25 %	0 %	325980839
53	NC_015221	ATTA	2	8	19858	19865	50 %	50 %	0 %	0 %	325980840
54	NC_015221	ATTT	2	8	19904	19911	25 %	75 %	0 %	0 %	325980840
55	NC_015221	CAAG	2	8	19969	19976	50 %	0 %	25 %	25 %	325980840
56	NC_015221	ATCA	2	8	20750	20757	50 %	25 %	0 %	25 %	325980841
57	NC_015221	ATCT	2	8	21064	21071	25 %	50 %	0 %	25 %	325980841
58	NC_015221	CATC	2	8	21285	21292	25 %	25 %	0 %	50 %	325980842
59	NC_015221	TTAA	2	8	21966	21973	50 %	50 %	0 %	0 %	325980843
60	NC_015221	GCCA	2	8	22114	22121	25 %	0 %	25 %	50 %	325980843
61	NC_015221	TTTA	2	8	22674	22681	25 %	75 %	0 %	0 %	325980844
62	NC_015221	CCTG	2	8	23070	23077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015221	AATA	2	8	23123	23130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015221	AATA	2	8	23413	23420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015221	GATC	2	8	24250	24257	25 %	25 %	25 %	25 %	325980846
66	NC_015221	AGTA	2	8	25998	26005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015221	GTGA	2	8	26180	26187	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015221	ATTA	2	8	26440	26447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015221	CTTT	2	8	26990	26997	0 %	75 %	0 %	25 %	325980848
70	NC_015221	CGTT	2	8	26999	27006	0 %	50 %	25 %	25 %	325980848
71	NC_015221	CTTT	2	8	27063	27070	0 %	75 %	0 %	25 %	325980848
72	NC_015221	GATT	2	8	27168	27175	25 %	50 %	25 %	0 %	325980848
73	NC_015221	CTGT	2	8	27238	27245	0 %	50 %	25 %	25 %	325980848
74	NC_015221	ATTT	2	8	27906	27913	25 %	75 %	0 %	0 %	325980848
75	NC_015221	ATGC	2	8	27918	27925	25 %	25 %	25 %	25 %	325980848
76	NC_015221	ATTA	2	8	27937	27944	50 %	50 %	0 %	0 %	325980848
77	NC_015221	CAAG	2	8	28323	28330	50 %	0 %	25 %	25 %	325980849
78	NC_015221	TCCA	2	8	28686	28693	25 %	25 %	0 %	50 %	325980850
79	NC_015221	TCAA	2	8	28951	28958	50 %	25 %	0 %	25 %	325980850
80	NC_015221	ACGA	2	8	29200	29207	50 %	0 %	25 %	25 %	325980851
81	NC_015221	TTCG	2	8	29491	29498	0 %	50 %	25 %	25 %	325980851
82	NC_015221	ATTA	2	8	29555	29562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015221	TTAC	2	8	29606	29613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015221	TATT	2	8	29708	29715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015221	AAAC	2	8	29737	29744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015221	CTGA	2	8	30320	30327	25 %	25 %	25 %	25 %	325980853
87	NC_015221	TCAG	2	8	30351	30358	25 %	25 %	25 %	25 %	325980853
88	NC_015221	CACT	2	8	30822	30829	25 %	25 %	0 %	50 %	325980853
89	NC_015221	GGAT	2	8	31083	31090	25 %	25 %	50 %	0 %	325980853
90	NC_015221	AATC	2	8	31545	31552	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
91	NC_015221	CAAT	2	8	31698	31705	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
92	NC_015221	AAAT	2	8	32088	32095	75 %	25 %	0 %	0 %	325980854
93	NC_015221	CACT	2	8	32501	32508	25 %	25 %	0 %	50 %	325980854
94	NC_015221	CCAG	2	8	32699	32706	25 %	0 %	25 %	50 %	325980854
95	NC_015221	TGGA	2	8	32827	32834	25 %	25 %	50 %	0 %	325980854
96	NC_015221	CCAA	2	8	33771	33778	50 %	0 %	0 %	50 %	325980855
97	NC_015221	GATC	2	8	33975	33982	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
98	NC_015221	GATC	2	8	34064	34071	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
99	NC_015221	AGGC	2	8	34072	34079	25 %	0 %	50 %	25 %	325980855
100	NC_015221	TAAT	2	8	34295	34302	50 %	50 %	0 %	0 %	325980855
101	NC_015221	GGCT	2	8	34517	34524	0 %	25 %	50 %	25 %	325980856
102	NC_015221	GTTG	2	8	34724	34731	0 %	50 %	50 %	0 %	325980857
103	NC_015221	AATA	2	8	35775	35782	75 %	25 %	0 %	0 %	325980857
104	NC_015221	CAAG	2	8	35856	35863	50 %	0 %	25 %	25 %	325980857
105	NC_015221	GATG	2	8	36321	36328	25 %	25 %	50 %	0 %	325980857
106	NC_015221	CTTA	2	8	36623	36630	25 %	50 %	0 %	25 %	325980857
107	NC_015221	CGAG	2	8	37211	37218	25 %	0 %	50 %	25 %	325980857
108	NC_015221	GAAG	2	8	38506	38513	50 %	0 %	50 %	0 %	325980858
109	NC_015221	GTAG	2	8	38550	38557	25 %	25 %	50 %	0 %	325980858
110	NC_015221	TGAT	2	8	38745	38752	25 %	50 %	25 %	0 %	325980859
111	NC_015221	CCAA	2	8	38785	38792	50 %	0 %	0 %	50 %	325980859
112	NC_015221	TTGA	2	8	38906	38913	25 %	50 %	25 %	0 %	325980859
113	NC_015221	AGAA	2	8	39789	39796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015221	AAGA	2	8	39997	40004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015221	TCTT	2	8	40364	40371	0 %	75 %	0 %	25 %	325980860
116	NC_015221	TTTA	2	8	40378	40385	25 %	75 %	0 %	0 %	325980860
117	NC_015221	TTAT	2	8	40734	40741	25 %	75 %	0 %	0 %	325980860
118	NC_015221	ATTG	2	8	41021	41028	25 %	50 %	25 %	0 %	325980861
119	NC_015221	GCAG	2	8	41210	41217	25 %	0 %	50 %	25 %	325980861
120	NC_015221	TTTA	2	8	41419	41426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015221	CTTG	2	8	41537	41544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015221	ACGA	2	8	41614	41621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015221	TTGA	2	8	41841	41848	25 %	50 %	25 %	0 %	325980862
124	NC_015221	CATC	2	8	42209	42216	25 %	25 %	0 %	50 %	325980863
125	NC_015221	CCGG	2	8	42481	42488	0 %	0 %	50 %	50 %	325980863
126	NC_015221	ATTA	2	8	42831	42838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015221	TTAT	2	8	42846	42853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015221	ATGC	2	8	42990	42997	25 %	25 %	25 %	25 %	325980864
129	NC_015221	TTGA	2	8	43032	43039	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
130	NC_015221	ATGT	2	8	43363	43370	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
131	NC_015221	CAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	0 %	25 %	325980864
132	NC_015221	ATCG	2	8	43583	43590	25 %	25 %	25 %	25 %	325980864
133	NC_015221	GAGC	2	8	43679	43686	25 %	0 %	50 %	25 %	325980864
134	NC_015221	GAGC	2	8	43812	43819	25 %	0 %	50 %	25 %	325980864
135	NC_015221	AAAC	2	8	43926	43933	75 %	0 %	0 %	25 %	325980864
136	NC_015221	ATTT	2	8	43999	44006	25 %	75 %	0 %	0 %	325980864
137	NC_015221	TCCC	2	8	44050	44057	0 %	25 %	0 %	75 %	325980864
138	NC_015221	TTGA	2	8	44479	44486	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
139	NC_015221	AATC	2	8	44587	44594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015221	TTAT	2	8	44679	44686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015221	TTTC	2	8	44814	44821	0 %	75 %	0 %	25 %	325980865
142	NC_015221	GCAC	2	8	45960	45967	25 %	0 %	25 %	50 %	325980866
143	NC_015221	ATTG	2	8	46000	46007	25 %	50 %	25 %	0 %	325980866
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162	NC_015221	TGCT	2	8	53160	53167	0 %	50 %	25 %	25 %	325980871
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185	NC_015221	TAAT	2	8	62909	62916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_015221	AATA	2	8	63367	63374	75 %	25 %	0 %	0 %	325980879
188	NC_015221	TTCT	2	8	63438	63445	0 %	75 %	0 %	25 %	325980880
189	NC_015221	GCTT	2	8	63490	63497	0 %	50 %	25 %	25 %	325980880
190	NC_015221	AATT	2	8	63641	63648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.