MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	TTTGA	2	10	602	611	20 %	60 %	20 %	0 %	325926839
2	NC_015219	CATGA	2	10	1057	1066	40 %	20 %	20 %	20 %	325926839
3	NC_015219	ATCGC	2	10	1648	1657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015219	TCAGC	2	10	2146	2155	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015219	ACCAC	2	10	2267	2276	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015219	AGAAA	2	10	3487	3496	80 %	0 %	20 %	0 %	325926840
7	NC_015219	ATATA	2	10	3784	3793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015219	AATAT	2	10	3794	3803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015219	CTTTT	2	10	3927	3936	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015219	AACTG	2	10	4373	4382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015219	TAGAC	2	10	4911	4920	40 %	20 %	20 %	20 %	325926841
12	NC_015219	TATCC	2	10	5900	5909	20 %	40 %	0 %	40 %	325926842
13	NC_015219	CATGA	2	10	6499	6508	40 %	20 %	20 %	20 %	325926842
14	NC_015219	GAAAG	2	10	10721	10730	60 %	0 %	40 %	0 %	325926847
15	NC_015219	AGCAG	2	10	11090	11099	40 %	0 %	40 %	20 %	325926847
16	NC_015219	AAATG	2	10	11872	11881	60 %	20 %	20 %	0 %	325926849
17	NC_015219	TTTCT	2	10	12456	12465	0 %	80 %	0 %	20 %	325926849
18	NC_015219	AGAAA	2	10	14499	14508	80 %	0 %	20 %	0 %	325926852
19	NC_015219	ATATA	2	10	14752	14761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015219	AATAT	2	10	14762	14771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015219	CTTTT	2	10	14895	14904	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015219	TATAA	2	10	14968	14977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015219	TCCAT	2	10	16230	16239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015219	CAGTA	2	10	16286	16295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015219	TAATA	2	10	16752	16761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015219	CAACC	2	10	17026	17035	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.