MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	ATT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015219	TAT	3	9	206	214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015219	ATA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015219	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015219	CTA	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015219	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015219	CCG	2	6	1608	1613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015219	CAA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015219	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015219	ACG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015219	TGA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015219	TCC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015219	CAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015219	TCC	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015219	AAC	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015219	TGA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015219	TAA	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015219	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015219	TAT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015219	AGT	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015219	ACT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015219	GAA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015219	GCC	2	6	4061	4066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015219	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015219	AAG	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015219	TAT	3	9	4265	4273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015219	ATC	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015219	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015219	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015219	AAT	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015219	GAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015219	AAT	2	6	6574	6579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015219	AGG	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015219	TCT	2	6	7538	7543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015219	ATC	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015219	GGC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015219	GAT	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015219	TAT	2	6	8094	8099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015219	TAA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015219	ATG	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015219	TAA	2	6	10386	10391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015219	TCA	2	6	10487	10492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015219	ATC	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015219	CAA	2	6	11661	11666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015219	TTG	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015219	TGA	2	6	11689	11694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015219	AGG	2	6	11748	11753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015219	TCT	2	6	13444	13449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015219	TAC	2	6	13457	13462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015219	TTC	2	6	13651	13656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015219	CTT	2	6	13679	13684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015219	AAT	2	6	13701	13706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015219	ACC	2	6	13728	13733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015219	TCC	2	6	13749	13754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015219	AGT	2	6	14918	14923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015219	ACT	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015219	CAA	3	9	14979	14987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015219	TCA	2	6	15108	15113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015219	AAC	2	6	15161	15166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015219	AAC	2	6	15188	15193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015219	ATT	2	6	15266	15271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015219	AGG	2	6	15414	15419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015219	TAT	2	6	15427	15432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015219	TGA	2	6	16217	16222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015219	ATA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015219	AGC	3	9	16484	16492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015219	TTC	2	6	16616	16621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015219	TAA	2	6	16688	16693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015219	ATA	3	9	16702	16710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015219	ATT	2	6	16818	16823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015219	GTT	2	6	16899	16904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015219	AGC	2	6	17012	17017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015219	CTT	2	6	17056	17061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015219	TCT	2	6	17149	17154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015219	TCA	2	6	17170	17175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015219	CTA	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015219	TCT	2	6	17529	17534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015219	ATA	2	6	17567	17572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015219	CTT	3	9	17580	17588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015219	AGC	2	6	17674	17679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015219	ATA	2	6	17681	17686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015219	GAT	2	6	17762	17767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015219	TCC	2	6	18461	18466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015219	ATT	2	6	18482	18487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015219	ATT	2	6	18548	18553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015219	TCA	2	6	19249	19254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015219	ATT	2	6	19267	19272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015219	ATT	2	6	19275	19280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015219	CTT	2	6	19357	19362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015219	ATC	2	6	19422	19427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015219	ATA	2	6	20547	20552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015219	TCA	2	6	20600	20605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.