MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	GCT	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
2	NC_015219	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
3	NC_015219	CTG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
4	NC_015219	AAC	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926839
5	NC_015219	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926839
6	NC_015219	CGA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926839
7	NC_015219	TAT	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926839
8	NC_015219	ATA	2	6	1321	1326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
9	NC_015219	TTC	2	6	2788	2793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
10	NC_015219	ACA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926840
11	NC_015219	ATA	2	6	3272	3277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
12	NC_015219	GTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926840
13	NC_015219	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
14	NC_015219	TCA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926840
15	NC_015219	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
16	NC_015219	ATT	2	6	3547	3552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926840
17	NC_015219	ATA	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
18	NC_015219	TGT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
19	NC_015219	GTT	2	6	4623	4628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
20	NC_015219	TGA	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926841
21	NC_015219	TTA	2	6	4671	4676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926841
22	NC_015219	ATA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
23	NC_015219	CAG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926841
24	NC_015219	TTC	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
25	NC_015219	CAT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926841
26	NC_015219	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
27	NC_015219	TTG	2	6	5168	5173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
28	NC_015219	TGA	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926842
29	NC_015219	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926842
30	NC_015219	CTC	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325926842
31	NC_015219	AAC	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926842
32	NC_015219	ACC	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926842
33	NC_015219	CTA	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926842
34	NC_015219	CAG	2	6	6633	6638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
35	NC_015219	ATT	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
36	NC_015219	CTA	2	6	6662	6667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
37	NC_015219	ACG	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
38	NC_015219	ACT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
39	NC_015219	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
40	NC_015219	AGC	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
41	NC_015219	TGA	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926843
42	NC_015219	AAT	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926843
43	NC_015219	AAG	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926843
44	NC_015219	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
45	NC_015219	CTT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926844
46	NC_015219	ATT	2	6	7676	7681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926845
47	NC_015219	GAA	3	9	7708	7716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926845
48	NC_015219	TCT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926845
49	NC_015219	ATT	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926845
50	NC_015219	AAT	2	6	8370	8375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926846
51	NC_015219	ACA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
52	NC_015219	GTG	2	6	8444	8449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926846
53	NC_015219	CAA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
54	NC_015219	CAG	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926846
55	NC_015219	GGA	2	6	8559	8564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
56	NC_015219	CAA	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926846
57	NC_015219	CCG	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
58	NC_015219	ATC	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926846
59	NC_015219	GGA	2	6	8862	8867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
60	NC_015219	ATT	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
61	NC_015219	GGA	2	6	8970	8975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926846
62	NC_015219	GCG	2	6	8979	8984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325926846
63	NC_015219	TAT	2	6	9013	9018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
64	NC_015219	GCC	2	6	9103	9108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
65	NC_015219	GCG	2	6	9153	9158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325926846
66	NC_015219	TGA	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926846
67	NC_015219	AGA	2	6	9573	9578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926846
68	NC_015219	TAT	2	6	9880	9885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926846
69	NC_015219	GCT	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926846
70	NC_015219	ATG	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926846
71	NC_015219	CGC	2	6	10228	10233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926846
72	NC_015219	GAA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926847
73	NC_015219	TGA	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926847
74	NC_015219	TAC	2	6	11022	11027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926847
75	NC_015219	CAG	2	6	11083	11088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926847
76	NC_015219	AAG	2	6	11165	11170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926847
77	NC_015219	CGT	2	6	11222	11227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926848
78	NC_015219	TGG	2	6	11232	11237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926848
79	NC_015219	ATT	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926848
80	NC_015219	CAA	2	6	11278	11283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926848
81	NC_015219	GTG	2	6	11369	11374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926848
82	NC_015219	GAA	2	6	11431	11436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926848
83	NC_015219	TGA	2	6	11454	11459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
84	NC_015219	TGA	2	6	11462	11467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
85	NC_015219	TGG	2	6	11499	11504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926848
86	NC_015219	GAT	2	6	11539	11544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
87	NC_015219	GAT	2	6	11572	11577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
88	NC_015219	ATT	2	6	11639	11644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926848
89	NC_015219	TTA	2	6	11645	11650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926848
90	NC_015219	AGT	2	6	11654	11659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926848
91	NC_015219	TAA	2	6	11920	11925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926849
92	NC_015219	TAA	2	6	12048	12053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926849
93	NC_015219	TTG	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926849
94	NC_015219	TAG	2	6	12228	12233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926849
95	NC_015219	TGG	2	6	12262	12267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926849
96	NC_015219	TCT	2	6	12298	12303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926849
97	NC_015219	ATT	2	6	12349	12354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926849
98	NC_015219	TGT	2	6	12432	12437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926849
99	NC_015219	ACA	2	6	12440	12445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926849
100	NC_015219	TTG	2	6	12528	12533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926849
101	NC_015219	ATG	2	6	12632	12637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926849
102	NC_015219	ATT	2	6	12680	12685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926849
103	NC_015219	ATT	2	6	12707	12712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926849
104	NC_015219	TGG	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926849
105	NC_015219	TTG	2	6	12735	12740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926849
106	NC_015219	AGA	2	6	12743	12748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926849
107	NC_015219	ACA	2	6	12824	12829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926849
108	NC_015219	CAA	2	6	12897	12902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926849
109	NC_015219	CAG	2	6	12923	12928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926849
110	NC_015219	GGT	2	6	13001	13006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325926849
111	NC_015219	TTA	2	6	13007	13012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926849
112	NC_015219	GTT	2	6	13036	13041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926849
113	NC_015219	TTA	2	6	13085	13090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926849
114	NC_015219	TTC	2	6	13782	13787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926852
115	NC_015219	TTC	2	6	13800	13805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926852
116	NC_015219	GCT	2	6	14018	14023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926852
117	NC_015219	TTG	2	6	14072	14077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926852
118	NC_015219	ACA	2	6	14236	14241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926852
119	NC_015219	ATA	2	6	14284	14289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926852
120	NC_015219	ATA	2	6	14346	14351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926852
121	NC_015219	ATC	2	6	14442	14447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926852
122	NC_015219	CTG	2	6	14522	14527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926852
123	NC_015219	ATT	2	6	14559	14564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926852
124	NC_015219	TAT	2	6	14597	14602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926852
125	NC_015219	TAA	2	6	14615	14620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926852
126	NC_015219	CTT	2	6	15563	15568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926853
127	NC_015219	TCA	2	6	15598	15603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926853
128	NC_015219	GTT	2	6	15735	15740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926853
129	NC_015219	TGT	2	6	15851	15856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926853
130	NC_015219	CGC	2	6	15950	15955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325926853
131	NC_015219	GCT	2	6	15992	15997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926853
132	NC_015219	CCA	2	6	16346	16351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926854
133	NC_015219	CAC	2	6	16371	16376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926854
134	NC_015219	TTA	2	6	16436	16441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926854
135	NC_015219	CTT	2	6	17425	17430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926855
136	NC_015219	CTT	2	6	17836	17841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926856
137	NC_015219	TTC	2	6	17926	17931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926856
138	NC_015219	ATT	2	6	17963	17968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926856
139	NC_015219	TGT	2	6	17993	17998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926856
140	NC_015219	TTC	2	6	18090	18095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926856
141	NC_015219	TAG	2	6	18393	18398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926856
142	NC_015219	ATT	2	6	18658	18663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926857
143	NC_015219	CAA	2	6	18692	18697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926857
144	NC_015219	GCT	2	6	18720	18725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926857
145	NC_015219	CTT	2	6	18778	18783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926857
146	NC_015219	CTT	2	6	18844	18849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926857
147	NC_015219	GTT	2	6	18922	18927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926857
148	NC_015219	AAT	2	6	18939	18944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926857
149	NC_015219	TAA	2	6	19076	19081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926857
150	NC_015219	GAG	2	6	19165	19170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325926857
151	NC_015219	TTC	2	6	19474	19479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
152	NC_015219	TAC	2	6	19485	19490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926858
153	NC_015219	TTC	2	6	19498	19503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
154	NC_015219	TTC	2	6	19516	19521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
155	NC_015219	CTT	2	6	19787	19792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
156	NC_015219	CAG	2	6	20094	20099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926858
157	NC_015219	TTC	2	6	20233	20238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926858
158	NC_015219	TAA	3	9	20329	20337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926858
159	NC_015219	TAA	2	6	20377	20382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.