MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC plasmid pRKC30SC2

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015218	GAAA	2	8	58	65	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015218	TTTA	2	8	268	275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015218	AAGA	2	8	342	349	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015218	AGAA	2	8	723	730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015218	AAGA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	325955706
6	NC_015218	TAAA	2	8	1702	1709	75 %	25 %	0 %	0 %	325955709
7	NC_015218	AATT	2	8	2282	2289	50 %	50 %	0 %	0 %	325955709
8	NC_015218	TGCC	2	8	2775	2782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015218	TATC	2	8	2895	2902	25 %	50 %	0 %	25 %	325955711
10	NC_015218	GGAC	2	8	3362	3369	25 %	0 %	50 %	25 %	325955711
11	NC_015218	GAAA	2	8	3428	3435	75 %	0 %	25 %	0 %	325955711
12	NC_015218	TTAC	2	8	3580	3587	25 %	50 %	0 %	25 %	325955711
13	NC_015218	ATTT	2	8	3589	3596	25 %	75 %	0 %	0 %	325955711
14	NC_015218	AAAG	2	8	3688	3695	75 %	0 %	25 %	0 %	325955711
15	NC_015218	GGCT	2	8	3908	3915	0 %	25 %	50 %	25 %	325955712
16	NC_015218	GTTG	2	8	4491	4498	0 %	50 %	50 %	0 %	325955712
17	NC_015218	TTCG	2	8	4660	4667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015218	CAAA	2	8	4779	4786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015218	ATTT	2	8	4918	4925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015218	TACC	2	8	5278	5285	25 %	25 %	0 %	50 %	325955713
21	NC_015218	AATC	2	8	6571	6578	50 %	25 %	0 %	25 %	325955714
22	NC_015218	GGAG	2	8	7062	7069	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015218	ATTT	2	8	7409	7416	25 %	75 %	0 %	0 %	325955715
24	NC_015218	GAAG	2	8	7698	7705	50 %	0 %	50 %	0 %	325955715
25	NC_015218	TCGA	2	8	8938	8945	25 %	25 %	25 %	25 %	325955717
26	NC_015218	TCTT	2	8	9200	9207	0 %	75 %	0 %	25 %	325955718
27	NC_015218	TTGA	2	8	10354	10361	25 %	50 %	25 %	0 %	325955719
28	NC_015218	CTTT	2	8	10493	10500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015218	TAAT	2	8	10578	10585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015218	TTAT	2	8	10629	10636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015218	TATT	2	8	10733	10740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015218	AATT	2	8	10781	10788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015218	ATTG	2	8	11849	11856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015218	TAAA	2	8	11886	11893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015218	TAAA	2	8	11995	12002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015218	AGGC	2	8	12542	12549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.