MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 2196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	AGGAA	2	10	1177	1186	60 %	0 %	40 %	0 %	325957760
2	NC_015216	TGAAC	2	10	2242	2251	40 %	20 %	20 %	20 %	325957761
3	NC_015216	AAAAT	2	10	2757	2766	80 %	20 %	0 %	0 %	325957762
4	NC_015216	TAATT	2	10	3000	3009	40 %	60 %	0 %	0 %	325957762
5	NC_015216	CGATT	2	10	4358	4367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015216	AACCA	2	10	4914	4923	60 %	0 %	0 %	40 %	325957766
7	NC_015216	CTTTC	2	10	9832	9841	0 %	60 %	0 %	40 %	325957770
8	NC_015216	ATTTG	2	10	10386	10395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015216	CTTAT	2	10	10576	10585	20 %	60 %	0 %	20 %	325957771
10	NC_015216	GTGAT	2	10	13094	13103	20 %	40 %	40 %	0 %	325957773
11	NC_015216	ATGGC	2	10	15881	15890	20 %	20 %	40 %	20 %	325957776
12	NC_015216	TCCAG	2	10	16994	17003	20 %	20 %	20 %	40 %	325957776
13	NC_015216	CCATC	2	10	18507	18516	20 %	20 %	0 %	60 %	325957776
14	NC_015216	TGAAT	2	10	18826	18835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015216	GTTCT	2	10	19572	19581	0 %	60 %	20 %	20 %	325957778
16	NC_015216	CAGGC	2	10	21531	21540	20 %	0 %	40 %	40 %	325957780
17	NC_015216	ATTTT	2	10	21684	21693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015216	TTGAA	2	10	22474	22483	40 %	40 %	20 %	0 %	325957782
19	NC_015216	TATAA	2	10	25246	25255	60 %	40 %	0 %	0 %	325957786
20	NC_015216	AAAAT	2	10	26678	26687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015216	TAAAA	2	10	26723	26732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015216	TTCAT	2	10	30213	30222	20 %	60 %	0 %	20 %	325957793
23	NC_015216	ATTAG	2	10	31862	31871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015216	TGCTG	2	10	33081	33090	0 %	40 %	40 %	20 %	325957796
25	NC_015216	GGAAG	2	10	36883	36892	40 %	0 %	60 %	0 %	325957799
26	NC_015216	TATGG	2	10	38042	38051	20 %	40 %	40 %	0 %	325957801
27	NC_015216	CAGTA	2	10	42288	42297	40 %	20 %	20 %	20 %	325957803
28	NC_015216	AGCAT	2	10	43375	43384	40 %	20 %	20 %	20 %	325957805
29	NC_015216	GTTTG	2	10	44820	44829	0 %	60 %	40 %	0 %	325957806
30	NC_015216	TTTAG	2	10	46461	46470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015216	TTCAC	2	10	46767	46776	20 %	40 %	0 %	40 %	325957808
32	NC_015216	TTTAA	2	10	48100	48109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015216	AACCA	2	10	51361	51370	60 %	0 %	0 %	40 %	325957813
34	NC_015216	ATTTT	2	10	51973	51982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015216	GTTTT	2	10	53676	53685	0 %	80 %	20 %	0 %	325957816
36	NC_015216	AAAAG	2	10	55955	55964	80 %	0 %	20 %	0 %	325957818
37	NC_015216	TTGAA	2	10	60408	60417	40 %	40 %	20 %	0 %	325957823
38	NC_015216	TAATT	2	10	61579	61588	40 %	60 %	0 %	0 %	325957824
39	NC_015216	TTTAA	2	10	61622	61631	40 %	60 %	0 %	0 %	325957824
40	NC_015216	TTCCT	2	10	61681	61690	0 %	60 %	0 %	40 %	325957824
41	NC_015216	ATATT	2	10	61995	62004	40 %	60 %	0 %	0 %	325957825
42	NC_015216	CATTA	2	10	62138	62147	40 %	40 %	0 %	20 %	325957825
43	NC_015216	ATATT	2	10	62580	62589	40 %	60 %	0 %	0 %	325957825
44	NC_015216	ACTTG	2	10	62667	62676	20 %	40 %	20 %	20 %	325957825
45	NC_015216	TTCAG	2	10	62766	62775	20 %	40 %	20 %	20 %	325957825
46	NC_015216	CCACA	2	10	63049	63058	40 %	0 %	0 %	60 %	325957825
47	NC_015216	TTGTC	2	10	63521	63530	0 %	60 %	20 %	20 %	325957826
48	NC_015216	CCAGT	2	10	63611	63620	20 %	20 %	20 %	40 %	325957826
49	NC_015216	AGTGT	2	10	64159	64168	20 %	40 %	40 %	0 %	325957826
50	NC_015216	GGATT	2	10	66634	66643	20 %	40 %	40 %	0 %	325957829
51	NC_015216	AACAG	2	10	66739	66748	60 %	0 %	20 %	20 %	325957829
52	NC_015216	AACTA	2	10	71924	71933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015216	ATGGG	2	10	78160	78169	20 %	20 %	60 %	0 %	325957841
54	NC_015216	TGCTG	2	10	78822	78831	0 %	40 %	40 %	20 %	325957841
55	NC_015216	CCACA	2	10	79829	79838	40 %	0 %	0 %	60 %	325957842
56	NC_015216	TATAA	2	10	81688	81697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015216	ATGAT	2	10	83918	83927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015216	AAATT	2	10	86167	86176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015216	GTTTC	2	10	86329	86338	0 %	60 %	20 %	20 %	325957848
60	NC_015216	GGATC	2	10	87187	87196	20 %	20 %	40 %	20 %	325957848
61	NC_015216	AGGAG	2	10	87307	87316	40 %	0 %	60 %	0 %	325957848
62	NC_015216	ATATT	2	10	87450	87459	40 %	60 %	0 %	0 %	325957848
63	NC_015216	TTGAA	2	10	90545	90554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015216	AATCA	2	10	90650	90659	60 %	20 %	0 %	20 %	325957851
65	NC_015216	CTGTT	2	10	99766	99775	0 %	60 %	20 %	20 %	325957859
66	NC_015216	CTTAT	2	10	100265	100274	20 %	60 %	0 %	20 %	325957859
67	NC_015216	GTTTG	2	10	100483	100492	0 %	60 %	40 %	0 %	325957859
68	NC_015216	ATGAA	2	10	102605	102614	60 %	20 %	20 %	0 %	325957861
69	NC_015216	GTGAT	2	10	103836	103845	20 %	40 %	40 %	0 %	325957863
70	NC_015216	ATACA	2	10	104570	104579	60 %	20 %	0 %	20 %	325957863
71	NC_015216	GAAGA	2	10	105732	105741	60 %	0 %	40 %	0 %	325957864
72	NC_015216	GTAAA	2	10	107114	107123	60 %	20 %	20 %	0 %	325957865
73	NC_015216	TCAGA	2	10	109745	109754	40 %	20 %	20 %	20 %	325957866
74	NC_015216	TGGAT	2	10	110506	110515	20 %	40 %	40 %	0 %	325957867
75	NC_015216	ATTTA	2	10	110891	110900	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015216	ATTTT	2	10	111865	111874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015216	CTTTT	2	10	112117	112126	0 %	80 %	0 %	20 %	325957869
78	NC_015216	TTGAA	2	10	113157	113166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015216	ATAAA	2	10	113765	113774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015216	ATAAA	2	10	113788	113797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015216	AAATT	2	10	113919	113928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015216	AATTT	2	10	114301	114310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015216	AAAAT	2	10	115340	115349	80 %	20 %	0 %	0 %	325957870
84	NC_015216	TGAAA	2	10	116114	116123	60 %	20 %	20 %	0 %	325957871
85	NC_015216	ATTTA	2	10	116476	116485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015216	TACCA	2	10	118373	118382	40 %	20 %	0 %	40 %	325957874
87	NC_015216	TAACA	2	10	119309	119318	60 %	20 %	0 %	20 %	325957875
88	NC_015216	AAAAC	2	10	120877	120886	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015216	AAATT	2	10	120948	120957	60 %	40 %	0 %	0 %	325957877
90	NC_015216	ATTTC	2	10	121183	121192	20 %	60 %	0 %	20 %	325957877
91	NC_015216	AAAAT	2	10	123568	123577	80 %	20 %	0 %	0 %	325957879
92	NC_015216	AGGTA	2	10	125546	125555	40 %	20 %	40 %	0 %	325957881
93	NC_015216	AATTT	2	10	126572	126581	40 %	60 %	0 %	0 %	325957883
94	NC_015216	TTTCC	2	10	127076	127085	0 %	60 %	0 %	40 %	325957884
95	NC_015216	ATAGG	2	10	128550	128559	40 %	20 %	40 %	0 %	325957885
96	NC_015216	TAAAA	2	10	129071	129080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015216	TGAAA	2	10	132175	132184	60 %	20 %	20 %	0 %	325957890
98	NC_015216	TGGGT	2	10	138109	138118	0 %	40 %	60 %	0 %	325957895
99	NC_015216	TCCAA	2	10	141048	141057	40 %	20 %	0 %	40 %	325957898
100	NC_015216	TGATT	2	10	142459	142468	20 %	60 %	20 %	0 %	325957899
101	NC_015216	TTTTA	2	10	142895	142904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015216	AAATT	2	10	143463	143472	60 %	40 %	0 %	0 %	325957900
103	NC_015216	CAAAA	2	10	144508	144517	80 %	0 %	0 %	20 %	325957901
104	NC_015216	AAAGA	2	10	144763	144772	80 %	0 %	20 %	0 %	325957902
105	NC_015216	TTGAA	2	10	144911	144920	40 %	40 %	20 %	0 %	325957902
106	NC_015216	GATTA	2	10	145171	145180	40 %	40 %	20 %	0 %	325957902
107	NC_015216	TGGAT	2	10	146002	146011	20 %	40 %	40 %	0 %	325957904
108	NC_015216	AATAA	2	10	146214	146223	80 %	20 %	0 %	0 %	325957904
109	NC_015216	TAATT	2	10	148215	148224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015216	GATGT	2	10	148852	148861	20 %	40 %	40 %	0 %	325957906
111	NC_015216	GTGTT	2	10	149465	149474	0 %	60 %	40 %	0 %	325957907
112	NC_015216	GAAAT	2	10	150127	150136	60 %	20 %	20 %	0 %	325957907
113	NC_015216	ATTCA	2	10	150361	150370	40 %	40 %	0 %	20 %	325957908
114	NC_015216	CAGTA	2	10	151886	151895	40 %	20 %	20 %	20 %	325957909
115	NC_015216	GGATC	2	10	153967	153976	20 %	20 %	40 %	20 %	325957911
116	NC_015216	CATAC	2	10	155295	155304	40 %	20 %	0 %	40 %	325957911
117	NC_015216	TAACA	2	10	157680	157689	60 %	20 %	0 %	20 %	325957912
118	NC_015216	TGATC	2	10	159169	159178	20 %	40 %	20 %	20 %	325957913
119	NC_015216	CTATC	2	10	159835	159844	20 %	40 %	0 %	40 %	325957913
120	NC_015216	ATTGG	2	10	161703	161712	20 %	40 %	40 %	0 %	325957916
121	NC_015216	TCGGC	2	10	162752	162761	0 %	20 %	40 %	40 %	325957918
122	NC_015216	TAAAA	2	10	163086	163095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015216	ATAAA	2	10	166051	166060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015216	TTATC	2	10	168090	168099	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015216	ATTTA	2	10	168464	168473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015216	AACCA	2	10	169114	169123	60 %	0 %	0 %	40 %	325957923
127	NC_015216	TTAGT	2	10	171921	171930	20 %	60 %	20 %	0 %	325957925
128	NC_015216	ATTGA	2	10	173359	173368	40 %	40 %	20 %	0 %	325957926
129	NC_015216	AAGAA	2	10	175788	175797	80 %	0 %	20 %	0 %	325957929
130	NC_015216	ATCCT	2	10	175830	175839	20 %	40 %	0 %	40 %	325957929
131	NC_015216	AACCC	2	10	176163	176172	40 %	0 %	0 %	60 %	325957929
132	NC_015216	CTGTA	2	10	177407	177416	20 %	40 %	20 %	20 %	325957930
133	NC_015216	TGGAA	2	10	177589	177598	40 %	20 %	40 %	0 %	325957930
134	NC_015216	AATTA	2	10	178066	178075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015216	ATAAA	2	10	179202	179211	80 %	20 %	0 %	0 %	325957932
136	NC_015216	TATGA	2	10	179999	180008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015216	AATTA	2	10	181031	181040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015216	TTTTG	2	10	182367	182376	0 %	80 %	20 %	0 %	325957934
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272	NC_015216	TGATA	2	10	352443	352452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_015216	TCCAA	2	10	372870	372879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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375	NC_015216	TAAAA	2	10	496435	496444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_015216	TTGAG	2	10	512468	512477	20 %	40 %	40 %	0 %	325958283
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397	NC_015216	TTTTA	2	10	515424	515433	20 %	80 %	0 %	0 %	325958287
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400	NC_015216	CAAAA	2	10	519822	519831	80 %	0 %	0 %	20 %	325958289
401	NC_015216	TAACA	2	10	520382	520391	60 %	20 %	0 %	20 %	325958290
402	NC_015216	ATCCA	2	10	520565	520574	40 %	20 %	0 %	40 %	325958290
403	NC_015216	ATTTA	2	10	520984	520993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_015216	TGATC	2	10	521057	521066	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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