MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 36174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015216	AGA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
3	NC_015216	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
4	NC_015216	CAT	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
5	NC_015216	GAA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
6	NC_015216	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
7	NC_015216	CAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
8	NC_015216	TGA	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
9	NC_015216	GAA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
10	NC_015216	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
11	NC_015216	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957760
12	NC_015216	AAC	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
13	NC_015216	CTC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957760
14	NC_015216	ATT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957760
15	NC_015216	CCA	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015216	CTA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015216	ATA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
18	NC_015216	ATG	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
19	NC_015216	TAG	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
20	NC_015216	TGA	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
21	NC_015216	TGG	2	6	1999	2004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
22	NC_015216	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957761
23	NC_015216	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
24	NC_015216	GCA	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
25	NC_015216	AGC	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
26	NC_015216	TTG	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
27	NC_015216	GAT	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
28	NC_015216	TGG	2	6	2233	2238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
29	NC_015216	TGT	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
30	NC_015216	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
31	NC_015216	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957761
32	NC_015216	GTT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
33	NC_015216	ACA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957761
34	NC_015216	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957762
35	NC_015216	GGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957762
36	NC_015216	ATG	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957762
37	NC_015216	GTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957762
38	NC_015216	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957763
39	NC_015216	AGA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957763
40	NC_015216	TAA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957763
41	NC_015216	CAC	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957763
42	NC_015216	TTG	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
43	NC_015216	TTC	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957764
44	NC_015216	TTA	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
45	NC_015216	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957764
46	NC_015216	CCA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957764
47	NC_015216	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
48	NC_015216	TCC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957764
49	NC_015216	GTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
50	NC_015216	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015216	TAT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015216	ACT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957765
53	NC_015216	TTA	2	6	3997	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
54	NC_015216	TAT	2	6	4010	4015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
55	NC_015216	TCC	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957765
56	NC_015216	ATT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
57	NC_015216	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957765
58	NC_015216	TGC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957765
59	NC_015216	TAT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
60	NC_015216	AAG	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957765
61	NC_015216	CCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957765
62	NC_015216	ATT	2	6	4296	4301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
63	NC_015216	TCC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015216	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015216	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015216	TCC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957766
67	NC_015216	AAC	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
68	NC_015216	CTG	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957766
69	NC_015216	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957766
70	NC_015216	TTA	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957766
71	NC_015216	CAA	2	6	4857	4862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
72	NC_015216	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015216	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015216	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015216	TTA	2	6	5019	5024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015216	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015216	TGC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
78	NC_015216	TAA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957767
79	NC_015216	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957767
80	NC_015216	GAA	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
81	NC_015216	AGA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
82	NC_015216	AAC	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957767
83	NC_015216	AGG	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
84	NC_015216	GTG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957767
85	NC_015216	AGG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
86	NC_015216	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
87	NC_015216	GAA	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
88	NC_015216	CTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
89	NC_015216	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957767
90	NC_015216	TCA	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957767
91	NC_015216	AGT	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957767
92	NC_015216	AGC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957767
93	NC_015216	ACA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957767
94	NC_015216	GAA	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015216	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
96	NC_015216	GAA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
97	NC_015216	GTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
98	NC_015216	TGG	2	6	6732	6737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
99	NC_015216	GAA	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
100	NC_015216	GAA	2	6	6821	6826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
101	NC_015216	AAT	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957768
102	NC_015216	CAC	2	6	6919	6924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957768
103	NC_015216	ATA	2	6	6953	6958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957768
104	NC_015216	GAA	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
105	NC_015216	GTT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
106	NC_015216	GTT	2	6	7352	7357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
107	NC_015216	AAC	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957768
108	NC_015216	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957768
109	NC_015216	CTG	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957768
110	NC_015216	GTT	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957768
111	NC_015216	ACA	2	6	7823	7828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957768
112	NC_015216	GAA	2	6	8015	8020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957768
113	NC_015216	TGG	2	6	8032	8037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
114	NC_015216	ATC	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957768
115	NC_015216	GAT	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957768
116	NC_015216	CAG	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957768
117	NC_015216	ATG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957768
118	NC_015216	GTG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
119	NC_015216	CAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957768
120	NC_015216	GTG	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957768
121	NC_015216	CCT	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957768
122	NC_015216	GAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957769
123	NC_015216	ATT	2	6	9109	9114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957770
124	NC_015216	AAC	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957770
125	NC_015216	CTG	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957770
126	NC_015216	TTG	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
127	NC_015216	CAC	2	6	9321	9326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957770
128	NC_015216	TTG	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
129	NC_015216	CTT	2	6	9686	9691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957770
130	NC_015216	TCG	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957770
131	NC_015216	GTT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957770
132	NC_015216	CAT	2	6	9917	9922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957770
133	NC_015216	ATC	2	6	9930	9935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957770
134	NC_015216	CTA	2	6	9968	9973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957770
135	NC_015216	TTC	2	6	10056	10061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957770
136	NC_015216	ACT	2	6	10065	10070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957770
137	NC_015216	CTG	2	6	10141	10146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957770
138	NC_015216	TTC	2	6	10257	10262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957770
139	NC_015216	TAT	2	6	10310	10315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957770
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141	NC_015216	TTA	2	6	10468	10473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_015216	CAC	2	6	19594	19599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957778
256	NC_015216	GTA	2	6	19624	19629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957778
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258	NC_015216	TTG	2	6	19700	19705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957778
259	NC_015216	ATC	2	6	19747	19752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957778
260	NC_015216	TTC	2	6	19783	19788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957778
261	NC_015216	ATT	2	6	19841	19846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957778
262	NC_015216	TGT	2	6	19894	19899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957778
263	NC_015216	GTT	2	6	19983	19988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957778
264	NC_015216	TAC	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_015216	GGA	2	6	20242	20247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015216	TAA	2	6	20279	20284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957779
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270	NC_015216	ATC	2	6	20391	20396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957779
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274	NC_015216	ATG	2	6	20652	20657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957779
275	NC_015216	ATG	2	6	20733	20738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957779
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381	NC_015216	AGG	2	6	27580	27585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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