MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 5560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015216	CCA	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015216	CTA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015216	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015216	TAT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015216	TCC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015216	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015216	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015216	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015216	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015216	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015216	TTA	2	6	5019	5024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015216	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015216	GAA	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015216	AAC	2	6	10415	10420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015216	TTA	2	6	10468	10473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015216	AAT	2	6	10474	10479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015216	AAT	2	6	14055	14060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015216	GAA	2	6	14066	14071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015216	AGG	2	6	14139	14144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015216	ATC	2	6	18732	18737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015216	ATT	2	6	18790	18795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015216	CAA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015216	ATA	2	6	18861	18866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015216	TAC	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015216	GGA	2	6	20242	20247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015216	AGT	2	6	22146	22151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015216	TAA	2	6	22815	22820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015216	GTT	2	6	22833	22838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015216	AAC	2	6	22913	22918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015216	TAT	2	6	22999	23004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015216	TAT	2	6	24214	24219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015216	ATA	2	6	24225	24230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015216	GTA	2	6	24243	24248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015216	TTG	2	6	24697	24702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015216	TTC	2	6	25071	25076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015216	ATA	2	6	26260	26265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015216	GAG	2	6	26397	26402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015216	TAA	2	6	26404	26409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015216	ACT	2	6	26492	26497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015216	ATT	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015216	TCC	2	6	26568	26573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015216	GAA	2	6	26611	26616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015216	TAT	2	6	26708	26713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015216	TTA	2	6	26714	26719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015216	AAT	2	6	26818	26823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015216	GAG	2	6	27545	27550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015216	AGG	2	6	27580	27585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015216	ATA	2	6	27984	27989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015216	TAA	2	6	29352	29357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015216	ATT	2	6	29400	29405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015216	AAT	2	6	29444	29449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015216	TCC	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015216	ATT	3	9	29803	29811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015216	ATA	2	6	29832	29837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015216	TCC	2	6	31641	31646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015216	CAT	2	6	31685	31690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015216	TTA	2	6	31699	31704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015216	ATT	2	6	31795	31800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015216	AAT	2	6	31808	31813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015216	CAC	2	6	31846	31851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015216	ACT	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015216	TAT	2	6	33934	33939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015216	TAA	2	6	35623	35628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015216	TAT	2	6	35629	35634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015216	TTA	2	6	35658	35663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015216	ATT	2	6	37090	37095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015216	ATA	2	6	37551	37556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015216	ACG	2	6	37558	37563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015216	ATC	2	6	37586	37591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015216	TAA	2	6	37627	37632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015216	ATT	2	6	40290	40295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015216	AAT	2	6	40340	40345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015216	CGA	2	6	40389	40394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015216	ATT	3	9	40425	40433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015216	CAA	2	6	40487	40492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015216	TTA	2	6	40688	40693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015216	ATA	2	6	40695	40700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015216	CAT	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015216	GTA	2	6	42411	42416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015216	TAT	2	6	45101	45106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015216	ACT	2	6	46435	46440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015216	TCT	2	6	46482	46487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015216	AAG	2	6	46501	46506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015216	AAC	2	6	46551	46556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015216	ATT	2	6	48998	49003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015216	TTG	2	6	49028	49033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015216	ACA	2	6	50092	50097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015216	TGG	2	6	50129	50134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015216	TTA	2	6	50341	50346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015216	TCA	2	6	51012	51017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015216	CAT	2	6	51116	51121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015216	TAA	2	6	52066	52071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015216	AAT	2	6	52074	52079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015216	TTA	3	9	53253	53261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015216	CAA	2	6	53281	53286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015216	AAT	2	6	53320	53325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015216	TAT	2	6	54534	54539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015216	GAT	2	6	54618	54623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015216	TAT	2	6	55504	55509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015216	TTA	2	6	59652	59657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015216	ATA	2	6	60027	60032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015216	AAT	2	6	60100	60105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015216	AGT	2	6	60112	60117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015216	ATA	2	6	60128	60133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015216	TAA	2	6	60233	60238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015216	TCT	2	6	60266	60271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015216	GTT	3	9	63410	63418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015216	AAT	2	6	63420	63425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015216	TAA	2	6	64272	64277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015216	ACA	2	6	66051	66056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015216	ATT	2	6	66084	66089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015216	GGT	2	6	66181	66186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015216	ACT	2	6	67490	67495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015216	ACT	2	6	67516	67521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015216	ATA	2	6	67543	67548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015216	GGA	2	6	67651	67656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015216	ATA	2	6	68916	68921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015216	AGT	2	6	68948	68953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015216	ATT	2	6	68972	68977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015216	TTA	2	6	68990	68995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015216	TAA	2	6	69023	69028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015216	AAT	2	6	69135	69140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015216	TAA	2	6	69162	69167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015216	TAA	2	6	69194	69199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015216	TAA	2	6	69288	69293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015216	GTA	2	6	69332	69337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015216	AGG	2	6	69346	69351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015216	ATT	2	6	70375	70380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015216	AAT	2	6	70407	70412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015216	TAT	2	6	70430	70435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015216	TTA	2	6	70466	70471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015216	TAA	2	6	70484	70489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015216	TAA	2	6	70516	70521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015216	TTA	2	6	70522	70527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015216	AAT	2	6	71444	71449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015216	TAG	2	6	71491	71496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015216	CAT	2	6	71509	71514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015216	AGT	2	6	71517	71522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015216	TTA	2	6	71536	71541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015216	GAA	2	6	71606	71611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_015216	TAA	2	6	252425	252430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_015216	TGG	2	6	255520	255525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_015216	ATT	2	6	276289	276294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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