MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 1275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015214	AGCAA	2	10	3437	3446	60 %	0 %	20 %	20 %	325955725
2	NC_015214	ATTTT	2	10	3478	3487	20 %	80 %	0 %	0 %	325955725
3	NC_015214	AAGGC	2	10	3644	3653	40 %	0 %	40 %	20 %	325955725
4	NC_015214	GATGA	2	10	4768	4777	40 %	20 %	40 %	0 %	325955726
5	NC_015214	CAAGG	2	10	5938	5947	40 %	0 %	40 %	20 %	325955726
6	NC_015214	CAAAA	2	10	12192	12201	80 %	0 %	0 %	20 %	325955731
7	NC_015214	TGGTT	2	10	14602	14611	0 %	60 %	40 %	0 %	325955734
8	NC_015214	TATGC	2	10	15792	15801	20 %	40 %	20 %	20 %	325955735
9	NC_015214	AGAAA	2	10	16466	16475	80 %	0 %	20 %	0 %	325955736
10	NC_015214	AAGGC	2	10	17580	17589	40 %	0 %	40 %	20 %	325955737
11	NC_015214	GTAAA	2	10	17604	17613	60 %	20 %	20 %	0 %	325955737
12	NC_015214	AAAAC	2	10	18475	18484	80 %	0 %	0 %	20 %	325955739
13	NC_015214	CAAAG	2	10	21510	21519	60 %	0 %	20 %	20 %	325955741
14	NC_015214	ACAAT	2	10	23781	23790	60 %	20 %	0 %	20 %	325955744
15	NC_015214	GATAG	2	10	24146	24155	40 %	20 %	40 %	0 %	325955745
16	NC_015214	TAATT	2	10	24794	24803	40 %	60 %	0 %	0 %	325955745
17	NC_015214	ATTTT	2	10	26913	26922	20 %	80 %	0 %	0 %	325955746
18	NC_015214	CTTTG	2	10	27903	27912	0 %	60 %	20 %	20 %	325955747
19	NC_015214	TTTGC	2	10	32412	32421	0 %	60 %	20 %	20 %	325955753
20	NC_015214	TAAAC	2	10	34304	34313	60 %	20 %	0 %	20 %	325955753
21	NC_015214	AATTA	2	10	36481	36490	60 %	40 %	0 %	0 %	325955756
22	NC_015214	CTGGT	2	10	37056	37065	0 %	40 %	40 %	20 %	325955757
23	NC_015214	TCATT	2	10	37461	37470	20 %	60 %	0 %	20 %	325955757
24	NC_015214	AGTTC	2	10	37648	37657	20 %	40 %	20 %	20 %	325955757
25	NC_015214	TTTTC	2	10	38952	38961	0 %	80 %	0 %	20 %	325955759
26	NC_015214	CTTTT	2	10	41459	41468	0 %	80 %	0 %	20 %	325955761
27	NC_015214	TTTGC	2	10	41981	41990	0 %	60 %	20 %	20 %	325955763
28	NC_015214	TGATT	2	10	42343	42352	20 %	60 %	20 %	0 %	325955763
29	NC_015214	GTGCG	2	10	44161	44170	0 %	20 %	60 %	20 %	325955764
30	NC_015214	TAAAA	2	10	44602	44611	80 %	20 %	0 %	0 %	325955764
31	NC_015214	GATCA	2	10	44880	44889	40 %	20 %	20 %	20 %	325955765
32	NC_015214	TTTTA	2	10	45571	45580	20 %	80 %	0 %	0 %	325955766
33	NC_015214	GTGAA	2	10	47764	47773	40 %	20 %	40 %	0 %	325955768
34	NC_015214	AAAGA	2	10	50426	50435	80 %	0 %	20 %	0 %	325955770
35	NC_015214	TTTAC	2	10	50850	50859	20 %	60 %	0 %	20 %	325955771
36	NC_015214	TTGCT	2	10	51238	51247	0 %	60 %	20 %	20 %	325955771
37	NC_015214	AAAAT	2	10	52573	52582	80 %	20 %	0 %	0 %	325955771
38	NC_015214	TAATG	2	10	55224	55233	40 %	40 %	20 %	0 %	325955773
39	NC_015214	TGAGT	2	10	63185	63194	20 %	40 %	40 %	0 %	325955775
40	NC_015214	GCTGG	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	325955777
41	NC_015214	TCGGT	2	10	66765	66774	0 %	40 %	40 %	20 %	325955780
42	NC_015214	ATTGA	2	10	67023	67032	40 %	40 %	20 %	0 %	325955780
43	NC_015214	ATTGA	2	10	68350	68359	40 %	40 %	20 %	0 %	325955781
44	NC_015214	TTCAC	2	10	73398	73407	20 %	40 %	0 %	40 %	325955788
45	NC_015214	GCAAA	2	10	74050	74059	60 %	0 %	20 %	20 %	325955789
46	NC_015214	ATGAA	2	10	75131	75140	60 %	20 %	20 %	0 %	325955791
47	NC_015214	CTTAT	2	10	76556	76565	20 %	60 %	0 %	20 %	325955792
48	NC_015214	ATCAA	2	10	77041	77050	60 %	20 %	0 %	20 %	325955792
49	NC_015214	TAAAT	2	10	77138	77147	60 %	40 %	0 %	0 %	325955792
50	NC_015214	TGATG	2	10	77469	77478	20 %	40 %	40 %	0 %	325955793
51	NC_015214	TACAT	2	10	78079	78088	40 %	40 %	0 %	20 %	325955793
52	NC_015214	TCGAA	2	10	81646	81655	40 %	20 %	20 %	20 %	325955797
53	NC_015214	CAAAA	2	10	82481	82490	80 %	0 %	0 %	20 %	325955797
54	NC_015214	CCTTA	2	10	82707	82716	20 %	40 %	0 %	40 %	325955797
55	NC_015214	TTGTG	2	10	82816	82825	0 %	60 %	40 %	0 %	325955798
56	NC_015214	AATAA	2	10	88196	88205	80 %	20 %	0 %	0 %	325955803
57	NC_015214	GATTA	2	10	88468	88477	40 %	40 %	20 %	0 %	325955803
58	NC_015214	AATGC	2	10	88484	88493	40 %	20 %	20 %	20 %	325955803
59	NC_015214	TTTAA	2	10	89920	89929	40 %	60 %	0 %	0 %	325955805
60	NC_015214	GGTAA	2	10	90226	90235	40 %	20 %	40 %	0 %	325955805
61	NC_015214	GTTAA	2	10	93679	93688	40 %	40 %	20 %	0 %	325955809
62	NC_015214	CAAAA	2	10	94628	94637	80 %	0 %	0 %	20 %	325955810
63	NC_015214	GAAAA	2	10	97271	97280	80 %	0 %	20 %	0 %	325955813
64	NC_015214	TAAAT	2	10	99287	99296	60 %	40 %	0 %	0 %	325955814
65	NC_015214	AACCA	2	10	99475	99484	60 %	0 %	0 %	40 %	325955815
66	NC_015214	AGATG	2	10	100332	100341	40 %	20 %	40 %	0 %	325955816
67	NC_015214	ATGCC	2	10	101107	101116	20 %	20 %	20 %	40 %	325955818
68	NC_015214	AGACA	2	10	102329	102338	60 %	0 %	20 %	20 %	325955819
69	NC_015214	TGATG	2	10	102596	102605	20 %	40 %	40 %	0 %	325955819
70	NC_015214	AAGTA	2	10	104088	104097	60 %	20 %	20 %	0 %	325955820
71	NC_015214	CTAAA	2	10	104245	104254	60 %	20 %	0 %	20 %	325955820
72	NC_015214	AAATT	2	10	110702	110711	60 %	40 %	0 %	0 %	325955827
73	NC_015214	CTTTT	2	10	111518	111527	0 %	80 %	0 %	20 %	325955828
74	NC_015214	TTGGC	2	10	112904	112913	0 %	40 %	40 %	20 %	325955830
75	NC_015214	TGATC	2	10	114317	114326	20 %	40 %	20 %	20 %	325955832
76	NC_015214	ATTTT	2	10	116509	116518	20 %	80 %	0 %	0 %	325955834
77	NC_015214	CTTTG	2	10	117499	117508	0 %	60 %	20 %	20 %	325955835
78	NC_015214	ATTAC	2	10	121726	121735	40 %	40 %	0 %	20 %	325955840
79	NC_015214	GCTTG	2	10	122540	122549	0 %	40 %	40 %	20 %	325955841
80	NC_015214	TAATG	2	10	122645	122654	40 %	40 %	20 %	0 %	325955841
81	NC_015214	ATGGA	2	10	124617	124626	40 %	20 %	40 %	0 %	325955843
82	NC_015214	AGAAA	2	10	126967	126976	80 %	0 %	20 %	0 %	325955845
83	NC_015214	AGCAA	2	10	128075	128084	60 %	0 %	20 %	20 %	325955846
84	NC_015214	ATTTT	2	10	128577	128586	20 %	80 %	0 %	0 %	325955847
85	NC_015214	CAACT	2	10	130606	130615	40 %	20 %	0 %	40 %	325955848
86	NC_015214	GCAAA	2	10	131507	131516	60 %	0 %	20 %	20 %	325955849
87	NC_015214	ACGCA	2	10	132511	132520	40 %	0 %	20 %	40 %	325955850
88	NC_015214	AATGG	2	10	134480	134489	40 %	20 %	40 %	0 %	325955852
89	NC_015214	TTTCT	2	10	134569	134578	0 %	80 %	0 %	20 %	325955853
90	NC_015214	TTCAA	2	10	134843	134852	40 %	40 %	0 %	20 %	325955853
91	NC_015214	AACTT	2	10	136623	136632	40 %	40 %	0 %	20 %	325955853
92	NC_015214	ACAGA	2	10	137774	137783	60 %	0 %	20 %	20 %	325955854
93	NC_015214	TTTAC	2	10	142869	142878	20 %	60 %	0 %	20 %	325955859
94	NC_015214	TCATT	2	10	144972	144981	20 %	60 %	0 %	20 %	325955862
95	NC_015214	TTGGT	2	10	145347	145356	0 %	60 %	40 %	0 %	325955862
96	NC_015214	CAAGA	2	10	146320	146329	60 %	0 %	20 %	20 %	325955864
97	NC_015214	TATTT	2	10	148199	148208	20 %	80 %	0 %	0 %	325955865
98	NC_015214	AAGTT	2	10	149502	149511	40 %	40 %	20 %	0 %	325955866
99	NC_015214	TATGG	2	10	150347	150356	20 %	40 %	40 %	0 %	325955867
100	NC_015214	TACTT	2	10	152093	152102	20 %	60 %	0 %	20 %	325955868
101	NC_015214	AAAGA	2	10	152961	152970	80 %	0 %	20 %	0 %	325955868
102	NC_015214	GATAG	2	10	153816	153825	40 %	20 %	40 %	0 %	325955869
103	NC_015214	GGAAC	2	10	159877	159886	40 %	0 %	40 %	20 %	325955875
104	NC_015214	ATTCC	2	10	160272	160281	20 %	40 %	0 %	40 %	325955875
105	NC_015214	ATTTC	2	10	163327	163336	20 %	60 %	0 %	20 %	325955878
106	NC_015214	AATAA	2	10	163652	163661	80 %	20 %	0 %	0 %	325955879
107	NC_015214	TCAAG	2	10	164719	164728	40 %	20 %	20 %	20 %	325955880
108	NC_015214	CATAA	2	10	167533	167542	60 %	20 %	0 %	20 %	325955881
109	NC_015214	ATATC	2	10	169021	169030	40 %	40 %	0 %	20 %	325955883
110	NC_015214	ATTTA	2	10	169119	169128	40 %	60 %	0 %	0 %	325955883
111	NC_015214	CCTTG	2	10	170472	170481	0 %	40 %	20 %	40 %	325955884
112	NC_015214	ACTTG	2	10	170906	170915	20 %	40 %	20 %	20 %	325955885
113	NC_015214	TAAGA	2	10	179384	179393	60 %	20 %	20 %	0 %	325955891
114	NC_015214	ATCGA	2	10	182029	182038	40 %	20 %	20 %	20 %	325955894
115	NC_015214	GGTTG	2	10	182421	182430	0 %	40 %	60 %	0 %	325955895
116	NC_015214	AATCA	2	10	183363	183372	60 %	20 %	0 %	20 %	325955896
117	NC_015214	CCTAA	2	10	183735	183744	40 %	20 %	0 %	40 %	325955896
118	NC_015214	TAAAT	2	10	184391	184400	60 %	40 %	0 %	0 %	325955897
119	NC_015214	TACTT	2	10	184721	184730	20 %	60 %	0 %	20 %	325955898
120	NC_015214	ACAAG	2	10	188170	188179	60 %	0 %	20 %	20 %	325955900
121	NC_015214	ATATG	2	10	189275	189284	40 %	40 %	20 %	0 %	325955900
122	NC_015214	TATTT	2	10	189683	189692	20 %	80 %	0 %	0 %	325955901
123	NC_015214	ATTCC	2	10	190288	190297	20 %	40 %	0 %	40 %	325955901
124	NC_015214	ATTAA	2	10	190529	190538	60 %	40 %	0 %	0 %	325955901
125	NC_015214	GGCGC	2	10	190827	190836	0 %	0 %	60 %	40 %	325955902
126	NC_015214	CCATT	2	10	191451	191460	20 %	40 %	0 %	40 %	325955902
127	NC_015214	TGGTT	2	10	194614	194623	0 %	60 %	40 %	0 %	325955905
128	NC_015214	AAGAA	2	10	194640	194649	80 %	0 %	20 %	0 %	325955905
129	NC_015214	CACGA	2	10	195559	195568	40 %	0 %	20 %	40 %	325955906
130	NC_015214	TTTAC	2	10	196503	196512	20 %	60 %	0 %	20 %	325955907
131	NC_015214	TTTAC	2	10	198196	198205	20 %	60 %	0 %	20 %	325955908
132	NC_015214	CGAAG	2	10	201122	201131	40 %	0 %	40 %	20 %	325955910
133	NC_015214	AGTTT	2	10	206711	206720	20 %	60 %	20 %	0 %	325955914
134	NC_015214	AATCA	2	10	207066	207075	60 %	20 %	0 %	20 %	325955915
135	NC_015214	AAACC	2	10	209340	209349	60 %	0 %	0 %	40 %	325955917
136	NC_015214	ATTCC	2	10	212053	212062	20 %	40 %	0 %	40 %	325955921
137	NC_015214	CGGTT	2	10	212861	212870	0 %	40 %	40 %	20 %	325955922
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142	NC_015214	TTAAG	2	10	220038	220047	40 %	40 %	20 %	0 %	325955927
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144	NC_015214	ACTTG	2	10	227129	227138	20 %	40 %	20 %	20 %	325955934
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149	NC_015214	TAGTG	2	10	240035	240044	20 %	40 %	40 %	0 %	325955945
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252	NC_015214	ATGAC	2	10	396696	396705	40 %	20 %	20 %	20 %	325956119
253	NC_015214	TAATT	2	10	398058	398067	40 %	60 %	0 %	0 %	325956120
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256	NC_015214	AAGTT	2	10	403095	403104	40 %	40 %	20 %	0 %	325956121
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261	NC_015214	TTTTA	2	10	415742	415751	20 %	80 %	0 %	0 %	325956130
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