MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015214	TAAA	2	8	1512	1519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015214	AAAT	2	8	9790	9797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015214	AGGA	2	8	10210	10217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015214	ATTA	2	8	14331	14338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015214	ATTA	2	8	16353	16360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015214	AAGA	2	8	17387	17394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015214	TTAG	2	8	17703	17710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015214	AAAT	2	8	19314	19321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015214	AATC	2	8	21867	21874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015214	GTTT	2	8	23222	23229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015214	TAAA	2	8	25338	25345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015214	TATG	2	8	34625	34632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015214	TTAG	2	8	38273	38280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015214	TAAT	2	8	41877	41884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015214	GAAA	2	8	44646	44653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015214	CAAA	2	8	47311	47318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015214	ATTT	2	8	47360	47367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015214	AGAT	2	8	48638	48645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015214	TTAT	2	8	50017	50024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015214	ATTA	2	8	50507	50514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015214	TTAC	2	8	50567	50574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015214	ATAG	2	8	56558	56565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015214	CGAA	2	8	56671	56678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015214	CGGA	2	8	56945	56952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015214	CAAA	2	8	57009	57016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015214	GCAA	2	8	57032	57039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015214	CGAG	2	8	57155	57162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015214	AGCG	2	8	57201	57208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015214	GTGA	2	8	57518	57525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015214	AGCG	2	8	57688	57695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015214	AAGC	2	8	58370	58377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015214	ATAG	2	8	59265	59272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015214	AGAA	2	8	59324	59331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015214	GCGA	2	8	59353	59360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015214	GTGA	2	8	59423	59430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015214	AGTT	2	8	59796	59803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015214	TAGG	2	8	61236	61243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015214	CTGC	2	8	62173	62180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015214	TACA	2	8	63393	63400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015214	AGCA	2	8	73463	73470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015214	GAAA	2	8	73569	73576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015214	TTGA	2	8	76110	76117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015214	TTGA	2	8	77206	77213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015214	AAGA	2	8	79836	79843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015214	AATC	2	8	79994	80001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015214	AAAG	2	8	80840	80847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015214	CTTT	2	8	80872	80879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015214	TGAG	2	8	80890	80897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015214	ATTT	2	8	87415	87422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015214	AATT	2	8	88846	88853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015214	AAGG	2	8	93357	93364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015214	AATT	2	8	107227	107234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015214	ATTA	2	8	107239	107246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015214	TAAA	2	8	109716	109723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015214	AAAC	2	8	109738	109745	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015214	TAAT	2	8	111908	111915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015214	CAAC	2	8	118302	118309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015214	TAGA	2	8	121305	121312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015214	AAAG	2	8	122085	122092	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015214	AATT	2	8	122150	122157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015214	TGAT	2	8	124493	124500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015214	TTCT	2	8	126126	126133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015214	TAAT	2	8	126148	126155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015214	ATTA	2	8	129720	129727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015214	TGTA	2	8	139157	139164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015214	ATTT	2	8	139248	139255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015214	AATG	2	8	141987	141994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015214	GTTT	2	8	142119	142126	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015214	TATT	2	8	146156	146163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015214	GATT	2	8	154641	154648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015214	TGAT	2	8	163432	163439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015214	AATC	2	8	163760	163767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015214	CTTT	2	8	163836	163843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015214	CAAA	2	8	163972	163979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015214	GTTT	2	8	165427	165434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015214	ATTA	2	8	165519	165526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015214	AAAT	2	8	167645	167652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015214	CATT	2	8	167704	167711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015214	TTTA	2	8	168439	168446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015214	TCTA	2	8	168477	168484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015214	GTAT	2	8	168679	168686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015214	AGTT	2	8	171487	171494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015214	TATT	2	8	172012	172019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015214	AAAG	2	8	172073	172080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015214	TTTA	2	8	172088	172095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015214	GTAA	2	8	172137	172144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015214	GATA	2	8	173924	173931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015214	GCAT	2	8	174257	174264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015214	ATCG	2	8	174283	174290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015214	TTGA	2	8	177521	177528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015214	TTTG	2	8	179419	179426	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015214	AAAT	2	8	179438	179445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015214	CAAA	2	8	179477	179484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015214	GATT	2	8	179504	179511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015214	AAGA	2	8	183249	183256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015214	ATAA	2	8	189343	189350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015214	GTGG	2	8	190710	190717	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015214	TGAT	2	8	194037	194044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015214	ACAA	2	8	200830	200837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015214	AATA	2	8	200845	200852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015214	TTTA	2	8	200910	200917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015214	TAAA	2	8	205041	205048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015214	TATT	2	8	205098	205105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015214	GGAT	2	8	205151	205158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015214	ATTT	2	8	205196	205203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015214	TAAA	2	8	205251	205258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015214	AGTC	2	8	210495	210502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015214	TAAA	2	8	211641	211648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015214	TAGC	2	8	213967	213974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015214	TATT	2	8	221412	221419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015214	TAAA	2	8	223720	223727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015214	TATT	2	8	223795	223802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015214	AGGT	2	8	223855	223862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015214	TAGT	2	8	226616	226623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015214	AAAT	2	8	227793	227800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015214	TAGA	2	8	231687	231694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015214	ATAA	2	8	235553	235560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015214	CTAC	2	8	243691	243698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015214	TTCA	2	8	243738	243745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015214	TTGC	2	8	245196	245203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015214	ATTG	2	8	245279	245286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015214	AATT	2	8	248692	248699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015214	TTTC	2	8	251104	251111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015214	ATTA	2	8	252093	252100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015214	TAAA	2	8	253883	253890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015214	TTAA	2	8	265594	265601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015214	ATTA	2	8	265604	265611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015214	AGCA	2	8	266740	266747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015214	TTGT	2	8	266767	266774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015214	TTAA	2	8	276432	276439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015214	TTTC	2	8	281940	281947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015214	AAGA	2	8	282018	282025	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015214	TTGT	2	8	284126	284133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015214	TTAA	2	8	287538	287545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015214	AAAT	2	8	287792	287799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015214	AAAT	2	8	287978	287985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015214	TTAC	2	8	288810	288817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015214	TACA	2	8	304333	304340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015214	AGGA	2	8	307669	307676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015214	AAGC	2	8	327845	327852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015214	AAAG	2	8	328110	328117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015214	TATT	2	8	328170	328177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015214	TCCA	2	8	331969	331976	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015214	CCTT	2	8	334364	334371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015214	GGAA	2	8	335198	335205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015214	AGGG	2	8	335701	335708	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015214	AAAG	2	8	340742	340749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015214	AAAG	2	8	348093	348100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015214	ATTT	2	8	350758	350765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015214	TAAA	2	8	355307	355314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015214	TAAT	2	8	355387	355394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015214	AATA	2	8	355673	355680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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