MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 26509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015214	ACG	2	6	43	48	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955722
2	NC_015214	TAC	2	6	235	240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955722
3	NC_015214	AAC	2	6	334	339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955722
4	NC_015214	TGC	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955722
5	NC_015214	AGT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955722
6	NC_015214	TTA	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955722
7	NC_015214	TTA	2	6	660	665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955722
8	NC_015214	AAG	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955722
9	NC_015214	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955722
10	NC_015214	TGA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955722
11	NC_015214	CTC	2	6	853	858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955722
12	NC_015214	GAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955722
13	NC_015214	TGA	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955722
14	NC_015214	CTA	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955722
15	NC_015214	TCA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955723
16	NC_015214	CTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955723
17	NC_015214	AGA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955723
18	NC_015214	AGT	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955723
19	NC_015214	AAT	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955723
20	NC_015214	TGC	2	6	1933	1938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955723
21	NC_015214	ATT	2	6	2144	2149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955723
22	NC_015214	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955723
23	NC_015214	CAA	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955723
24	NC_015214	AGA	3	9	2479	2487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955723
25	NC_015214	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955723
26	NC_015214	TCA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955723
27	NC_015214	AGA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955723
28	NC_015214	TTA	2	6	2677	2682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955723
29	NC_015214	TAT	2	6	2920	2925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955724
30	NC_015214	AGG	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955724
31	NC_015214	AGC	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955724
32	NC_015214	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955725
33	NC_015214	TTA	2	6	3346	3351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955725
34	NC_015214	AGA	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955725
35	NC_015214	AGA	2	6	3614	3619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955725
36	NC_015214	ATT	2	6	3623	3628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955725
37	NC_015214	CGC	2	6	3721	3726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955725
38	NC_015214	ATC	2	6	3812	3817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955725
39	NC_015214	ATA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955725
40	NC_015214	ACT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955725
41	NC_015214	GAT	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955725
42	NC_015214	GCA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955725
43	NC_015214	GAT	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955725
44	NC_015214	GTC	2	6	4115	4120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955725
45	NC_015214	CTT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955725
46	NC_015214	TTA	2	6	4163	4168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955725
47	NC_015214	AAG	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955725
48	NC_015214	GGT	2	6	4357	4362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955726
49	NC_015214	ATT	2	6	4441	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955726
50	NC_015214	CCA	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955726
51	NC_015214	GAT	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955726
52	NC_015214	GTC	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955726
53	NC_015214	TTC	2	6	4604	4609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955726
54	NC_015214	CGG	2	6	4614	4619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955726
55	NC_015214	GGT	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955726
56	NC_015214	GTT	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955726
57	NC_015214	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955726
58	NC_015214	TGA	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955726
59	NC_015214	GGT	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955726
60	NC_015214	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955726
61	NC_015214	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955726
62	NC_015214	AAC	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955726
63	NC_015214	GTT	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955726
64	NC_015214	CTG	2	6	5366	5371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955726
65	NC_015214	CTG	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955726
66	NC_015214	ACA	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955726
67	NC_015214	TCG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955726
68	NC_015214	GGT	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955726
69	NC_015214	CTT	2	6	5848	5853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955726
70	NC_015214	GAA	2	6	5971	5976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955726
71	NC_015214	ACT	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955726
72	NC_015214	AGT	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955726
73	NC_015214	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955726
74	NC_015214	AAC	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955726
75	NC_015214	AGG	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955726
76	NC_015214	ATG	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
77	NC_015214	CTT	2	6	6310	6315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955727
78	NC_015214	CGT	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955727
79	NC_015214	AAG	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955727
80	NC_015214	TTG	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
81	NC_015214	TCA	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
82	NC_015214	TGA	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
83	NC_015214	GAT	2	6	6698	6703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
84	NC_015214	AGT	2	6	6718	6723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
85	NC_015214	TTA	2	6	6819	6824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955727
86	NC_015214	TGA	2	6	6840	6845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
87	NC_015214	CTA	2	6	6858	6863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
88	NC_015214	TGA	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
89	NC_015214	GTT	2	6	6971	6976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
90	NC_015214	ATC	2	6	7100	7105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
91	NC_015214	TGA	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
92	NC_015214	GTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
93	NC_015214	AAC	2	6	7199	7204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955727
94	NC_015214	TTG	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
95	NC_015214	CAC	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955727
96	NC_015214	TAC	2	6	7304	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
97	NC_015214	AAG	2	6	7320	7325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955727
98	NC_015214	TGT	2	6	7327	7332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
99	NC_015214	ACA	2	6	7410	7415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955727
100	NC_015214	CAT	2	6	7432	7437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
101	NC_015214	TGA	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
102	NC_015214	GTT	2	6	7721	7726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955727
103	NC_015214	GTG	2	6	7833	7838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955727
104	NC_015214	AAG	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955727
105	NC_015214	AGT	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
106	NC_015214	GAT	2	6	8072	8077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955727
107	NC_015214	ACT	2	6	8079	8084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
108	NC_015214	GTG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955727
109	NC_015214	CAT	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
110	NC_015214	TAC	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955727
111	NC_015214	CAT	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955728
112	NC_015214	ACA	2	6	8981	8986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955728
113	NC_015214	GGT	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955728
114	NC_015214	CGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955728
115	NC_015214	CTG	2	6	9128	9133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955728
116	NC_015214	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955729
117	NC_015214	TAC	2	6	9321	9326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955729
118	NC_015214	CAG	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955729
119	NC_015214	ATA	2	6	9515	9520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
120	NC_015214	GTT	3	9	9550	9558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955729
121	NC_015214	TGG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955729
122	NC_015214	AAT	2	6	9628	9633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
123	NC_015214	ATA	2	6	9638	9643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
124	NC_015214	AAT	2	6	9670	9675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
125	NC_015214	AAT	2	6	9691	9696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
126	NC_015214	AAT	2	6	9703	9708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
127	NC_015214	AAT	2	6	9718	9723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955729
128	NC_015214	TGA	3	9	9768	9776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955729
129	NC_015214	CAA	2	6	9824	9829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955730
130	NC_015214	AGA	2	6	9830	9835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955730
131	NC_015214	CGT	4	12	9842	9853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955730
132	NC_015214	CGT	2	6	9953	9958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955730
133	NC_015214	TTA	2	6	10260	10265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955731
134	NC_015214	GTT	2	6	10348	10353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955731
135	NC_015214	AAG	2	6	10479	10484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955731
136	NC_015214	GCT	2	6	10627	10632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955731
137	NC_015214	TCG	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955731
138	NC_015214	TGG	2	6	10701	10706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955731
139	NC_015214	AAG	2	6	10901	10906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955731
140	NC_015214	TGA	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955731
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143	NC_015214	GTA	2	6	11288	11293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955731
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151	NC_015214	AGA	2	6	11875	11880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955731
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155	NC_015214	ATT	2	6	12113	12118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955731
156	NC_015214	CGG	2	6	12130	12135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955731
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158	NC_015214	TGA	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955731
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162	NC_015214	TTG	2	6	12557	12562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955732
163	NC_015214	ATT	2	6	12714	12719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955732
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167	NC_015214	TGA	2	6	12979	12984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955733
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170	NC_015214	TGA	2	6	13159	13164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955733
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242	NC_015214	TTG	2	6	17838	17843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955738
243	NC_015214	ATA	2	6	17983	17988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955738
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249	NC_015214	GTT	2	6	18395	18400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955739
250	NC_015214	CGA	2	6	18505	18510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955739
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252	NC_015214	GCC	2	6	18753	18758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955739
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254	NC_015214	GCC	2	6	18826	18831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955739
255	NC_015214	ATG	2	6	19381	19386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955740
256	NC_015214	TTG	2	6	19408	19413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955740
257	NC_015214	TAT	2	6	19487	19492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955740
258	NC_015214	TCA	2	6	19594	19599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955740
259	NC_015214	ATG	2	6	19615	19620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955740
260	NC_015214	GGC	2	6	19683	19688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955740
261	NC_015214	TGT	2	6	19710	19715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955740
262	NC_015214	GGC	2	6	19788	19793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955740
263	NC_015214	CAC	2	6	19952	19957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955740
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271	NC_015214	TAT	2	6	21144	21149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955741
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280	NC_015214	ATT	2	6	21723	21728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955741
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285	NC_015214	TGA	2	6	22336	22341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955743
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289	NC_015214	AAT	2	6	22664	22669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955743
290	NC_015214	TGC	2	6	22769	22774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955743
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292	NC_015214	ACC	2	6	22870	22875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955743
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303	NC_015214	TCT	2	6	24159	24164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955745
304	NC_015214	TTG	2	6	24173	24178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955745
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365	NC_015214	AAT	2	6	29266	29271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955748
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370	NC_015214	TGG	2	6	29564	29569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955748
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372	NC_015214	GAA	2	6	29593	29598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
373	NC_015214	GAT	3	9	29755	29763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955748
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376	NC_015214	ATC	2	6	29863	29868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955748
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379	NC_015214	TAC	2	6	30174	30179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
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500	NC_015214	GCC	2	6	39981	39986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955760

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