MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC plasmid pRKC30SC1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015213	TGAT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	325955699
2	NC_015213	TTAA	2	8	1041	1048	50 %	50 %	0 %	0 %	325955699
3	NC_015213	TACA	2	8	1094	1101	50 %	25 %	0 %	25 %	325955699
4	NC_015213	GAAT	2	8	1120	1127	50 %	25 %	25 %	0 %	325955699
5	NC_015213	ATCC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	325955699
6	NC_015213	AGAT	2	8	1713	1720	50 %	25 %	25 %	0 %	325955700
7	NC_015213	TGTT	2	8	1806	1813	0 %	75 %	25 %	0 %	325955700
8	NC_015213	TAAA	2	8	2112	2119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015213	TTTG	2	8	2136	2143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015213	TATT	2	8	2205	2212	25 %	75 %	0 %	0 %	325955701
11	NC_015213	ATCT	2	8	3279	3286	25 %	50 %	0 %	25 %	325955702
12	NC_015213	ACTC	2	8	3453	3460	25 %	25 %	0 %	50 %	325955703
13	NC_015213	GTCC	2	8	3906	3913	0 %	25 %	25 %	50 %	325955703
14	NC_015213	CGCC	2	8	4388	4395	0 %	0 %	25 %	75 %	325955703
15	NC_015213	TAAA	2	8	4486	4493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015213	CAAA	2	8	4930	4937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015213	CAAA	2	8	5076	5083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015213	ACAG	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015213	ACTA	2	8	5329	5336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015213	TATG	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015213	TAAA	2	8	5788	5795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015213	ATTT	2	8	5829	5836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015213	TTTA	2	8	6487	6494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.