MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC plasmid pRKC30SC1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015213	TCA	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015213	ATA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015213	CCT	2	6	159	164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015213	TTG	2	6	215	220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015213	ACT	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015213	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015213	ATA	2	6	1278	1283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015213	CTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015213	TAT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015213	CAC	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015213	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015213	AAG	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015213	TCG	2	6	2847	2852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015213	GTT	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015213	TAT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015213	CGA	2	6	2955	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015213	TAA	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015213	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015213	TTC	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015213	CAG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015213	CTG	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015213	TTC	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015213	GCA	2	6	4919	4924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015213	ATC	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015213	TTG	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015213	ACA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015213	ACA	2	6	5272	5277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015213	ATT	2	6	5502	5507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015213	AAT	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015213	TCC	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015213	TTG	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015213	CTT	2	6	6162	6167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015213	TTC	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015213	TCT	2	6	6317	6322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015213	TAT	4	12	6363	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015213	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015213	TAA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015213	CTT	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015213	TGT	2	6	6784	6789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015213	ATA	2	6	6946	6951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015213	CAT	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015213	TAA	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015213	CGT	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.