MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015188	GCGG	2	8	504	511	0 %	0 %	75 %	25 %	325169002
2	NC_015188	CCCG	2	8	979	986	0 %	0 %	25 %	75 %	325169002
3	NC_015188	GCCG	2	8	1886	1893	0 %	0 %	50 %	50 %	325169004
4	NC_015188	ATTG	2	8	2016	2023	25 %	50 %	25 %	0 %	325169004
5	NC_015188	GGGT	2	8	2329	2336	0 %	25 %	75 %	0 %	325169005
6	NC_015188	CGGG	2	8	2844	2851	0 %	0 %	75 %	25 %	325169006
7	NC_015188	TTGA	2	8	3158	3165	25 %	50 %	25 %	0 %	325169007
8	NC_015188	GCAG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	325169007
9	NC_015188	GAAC	2	8	3698	3705	50 %	0 %	25 %	25 %	325169009
10	NC_015188	CAAG	2	8	3743	3750	50 %	0 %	25 %	25 %	325169009
11	NC_015188	GGCC	2	8	3756	3763	0 %	0 %	50 %	50 %	325169009
12	NC_015188	TGCC	2	8	4039	4046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015188	TACG	2	8	4117	4124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015188	GATG	2	8	4997	5004	25 %	25 %	50 %	0 %	325169011
15	NC_015188	GCGG	2	8	5507	5514	0 %	0 %	75 %	25 %	325169011
16	NC_015188	CCGG	2	8	5976	5983	0 %	0 %	50 %	50 %	325169011
17	NC_015188	GGAG	2	8	6791	6798	25 %	0 %	75 %	0 %	325169011
18	NC_015188	AGGC	2	8	7080	7087	25 %	0 %	50 %	25 %	325169011
19	NC_015188	TTGC	2	8	7314	7321	0 %	50 %	25 %	25 %	325169011
20	NC_015188	AAAC	2	8	7406	7413	75 %	0 %	0 %	25 %	325169011
21	NC_015188	GGAT	2	8	7562	7569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015188	ACCG	2	8	7663	7670	25 %	0 %	25 %	50 %	325169012
23	NC_015188	GCCC	2	8	7765	7772	0 %	0 %	25 %	75 %	325169012
24	NC_015188	TCGC	2	8	8030	8037	0 %	25 %	25 %	50 %	325169012
25	NC_015188	TGAA	2	8	8308	8315	50 %	25 %	25 %	0 %	325169013
26	NC_015188	CCAG	2	8	8393	8400	25 %	0 %	25 %	50 %	325169013
27	NC_015188	CGGC	2	8	8584	8591	0 %	0 %	50 %	50 %	325169013
28	NC_015188	GCCG	2	8	8620	8627	0 %	0 %	50 %	50 %	325169013
29	NC_015188	CTCG	2	8	8808	8815	0 %	25 %	25 %	50 %	325169013
30	NC_015188	CCAG	2	8	9428	9435	25 %	0 %	25 %	50 %	325169013
31	NC_015188	GAAC	2	8	9880	9887	50 %	0 %	25 %	25 %	325169013
32	NC_015188	CGGC	2	8	10219	10226	0 %	0 %	50 %	50 %	325169013
33	NC_015188	TGAT	2	8	10255	10262	25 %	50 %	25 %	0 %	325169013
34	NC_015188	GCCA	2	8	10372	10379	25 %	0 %	25 %	50 %	325169013
35	NC_015188	CTGG	2	8	10383	10390	0 %	25 %	50 %	25 %	325169013
36	NC_015188	CGGT	2	8	10588	10595	0 %	25 %	50 %	25 %	325169013
37	NC_015188	CGGC	2	8	10806	10813	0 %	0 %	50 %	50 %	325169013
38	NC_015188	TCCC	2	8	11001	11008	0 %	25 %	0 %	75 %	325169014
39	NC_015188	TGTT	2	8	11012	11019	0 %	75 %	25 %	0 %	325169014
40	NC_015188	CCGG	2	8	11163	11170	0 %	0 %	50 %	50 %	325169014
41	NC_015188	CCTG	2	8	11207	11214	0 %	25 %	25 %	50 %	325169014
42	NC_015188	GTCG	2	8	11563	11570	0 %	25 %	50 %	25 %	325169014
43	NC_015188	CTGG	2	8	12627	12634	0 %	25 %	50 %	25 %	325169017
44	NC_015188	GGTG	2	8	13642	13649	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015188	TCGC	2	8	13940	13947	0 %	25 %	25 %	50 %	325169019
46	NC_015188	GCCG	2	8	14172	14179	0 %	0 %	50 %	50 %	325169019
47	NC_015188	ACGA	2	8	14293	14300	50 %	0 %	25 %	25 %	325169019
48	NC_015188	GTGC	2	8	14308	14315	0 %	25 %	50 %	25 %	325169019
49	NC_015188	GATC	2	8	14331	14338	25 %	25 %	25 %	25 %	325169019
50	NC_015188	GCGG	2	8	14663	14670	0 %	0 %	75 %	25 %	325169019
51	NC_015188	GCGG	2	8	15291	15298	0 %	0 %	75 %	25 %	325169019
52	NC_015188	CAGA	2	8	15322	15329	50 %	0 %	25 %	25 %	325169019
53	NC_015188	GCGG	2	8	15393	15400	0 %	0 %	75 %	25 %	325169019
54	NC_015188	GACG	2	8	15534	15541	25 %	0 %	50 %	25 %	325169019
55	NC_015188	GTCG	2	8	15716	15723	0 %	25 %	50 %	25 %	325169019
56	NC_015188	GCGG	2	8	16227	16234	0 %	0 %	75 %	25 %	325169019
57	NC_015188	GGAT	2	8	16320	16327	25 %	25 %	50 %	0 %	325169019
58	NC_015188	CGGG	2	8	16362	16369	0 %	0 %	75 %	25 %	325169019
59	NC_015188	CGGC	2	8	16374	16381	0 %	0 %	50 %	50 %	325169019
60	NC_015188	AAGG	2	8	16704	16711	50 %	0 %	50 %	0 %	325169020
61	NC_015188	GGCT	2	8	16875	16882	0 %	25 %	50 %	25 %	325169020
62	NC_015188	GTCA	2	8	16920	16927	25 %	25 %	25 %	25 %	325169020
63	NC_015188	TCGT	2	8	17703	17710	0 %	50 %	25 %	25 %	325169021
64	NC_015188	GTCG	2	8	18217	18224	0 %	25 %	50 %	25 %	325169022
65	NC_015188	GATT	2	8	18343	18350	25 %	50 %	25 %	0 %	325169022
66	NC_015188	TCGA	2	8	19250	19257	25 %	25 %	25 %	25 %	325169023
67	NC_015188	GCCC	2	8	19345	19352	0 %	0 %	25 %	75 %	325169023
68	NC_015188	CCCG	2	8	19886	19893	0 %	0 %	25 %	75 %	325169023
69	NC_015188	GGCC	2	8	19936	19943	0 %	0 %	50 %	50 %	325169023
70	NC_015188	CGCC	2	8	19999	20006	0 %	0 %	25 %	75 %	325169023
71	NC_015188	GCCG	2	8	20494	20501	0 %	0 %	50 %	50 %	325169024
72	NC_015188	CCCG	2	8	21556	21563	0 %	0 %	25 %	75 %	325169026
73	NC_015188	CGAC	2	8	21779	21786	25 %	0 %	25 %	50 %	325169026
74	NC_015188	CCGC	2	8	22331	22338	0 %	0 %	25 %	75 %	325169026
75	NC_015188	CCAC	2	8	22498	22505	25 %	0 %	0 %	75 %	325169027
76	NC_015188	GATG	2	8	23026	23033	25 %	25 %	50 %	0 %	325169028
77	NC_015188	CTGG	2	8	23561	23568	0 %	25 %	50 %	25 %	325169028
78	NC_015188	ATCT	2	8	24459	24466	25 %	50 %	0 %	25 %	325169029
79	NC_015188	GAGG	2	8	24909	24916	25 %	0 %	75 %	0 %	325169029
80	NC_015188	AGCC	2	8	24997	25004	25 %	0 %	25 %	50 %	325169029
81	NC_015188	GGCC	2	8	26983	26990	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
82	NC_015188	GGCT	2	8	27018	27025	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
83	NC_015188	GAAC	2	8	27037	27044	50 %	0 %	25 %	25 %	325169030
84	NC_015188	AGCC	2	8	27281	27288	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
85	NC_015188	CCAG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
86	NC_015188	GTCG	2	8	27473	27480	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
87	NC_015188	CCAT	2	8	27741	27748	25 %	25 %	0 %	50 %	325169030
88	NC_015188	GCCA	2	8	28096	28103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015188	GCTT	2	8	28208	28215	0 %	50 %	25 %	25 %	325169031
90	NC_015188	TGCT	2	8	28870	28877	0 %	50 %	25 %	25 %	325169031
91	NC_015188	GTCG	2	8	28886	28893	0 %	25 %	50 %	25 %	325169031
92	NC_015188	GGCT	2	8	29558	29565	0 %	25 %	50 %	25 %	325169032
93	NC_015188	CCGG	2	8	29784	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	325169032
94	NC_015188	GTCC	2	8	30186	30193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015188	CGAG	2	8	30370	30377	25 %	0 %	50 %	25 %	325169033
96	NC_015188	GGCG	2	8	30517	30524	0 %	0 %	75 %	25 %	325169033
97	NC_015188	TGGA	2	8	30557	30564	25 %	25 %	50 %	0 %	325169033
98	NC_015188	GCCA	2	8	31163	31170	25 %	0 %	25 %	50 %	325169034
99	NC_015188	CATC	2	8	31699	31706	25 %	25 %	0 %	50 %	325169034
100	NC_015188	CGCT	2	8	31793	31800	0 %	25 %	25 %	50 %	325169034
101	NC_015188	TGAT	2	8	31923	31930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015188	GATG	2	8	32746	32753	25 %	25 %	50 %	0 %	325169035
103	NC_015188	GAGC	2	8	33719	33726	25 %	0 %	50 %	25 %	325169036
104	NC_015188	TCCG	2	8	33849	33856	0 %	25 %	25 %	50 %	325169036
105	NC_015188	TACG	2	8	34602	34609	25 %	25 %	25 %	25 %	325169038
106	NC_015188	GCCG	2	8	34671	34678	0 %	0 %	50 %	50 %	325169038
107	NC_015188	GCGG	2	8	34777	34784	0 %	0 %	75 %	25 %	325169038
108	NC_015188	CGGT	2	8	34945	34952	0 %	25 %	50 %	25 %	325169038
109	NC_015188	GCTC	2	8	35585	35592	0 %	25 %	25 %	50 %	325169039
110	NC_015188	GATC	2	8	36119	36126	25 %	25 %	25 %	25 %	325169040
111	NC_015188	AACC	2	8	36136	36143	50 %	0 %	0 %	50 %	325169040
112	NC_015188	GTAT	2	8	36399	36406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015188	GAAC	2	8	36438	36445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015188	AAAT	2	8	36485	36492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015188	TCAT	2	8	36648	36655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015188	GATG	2	8	36882	36889	25 %	25 %	50 %	0 %	325169041
117	NC_015188	CTGG	2	8	37417	37424	0 %	25 %	50 %	25 %	325169041
118	NC_015188	GCGG	2	8	37841	37848	0 %	0 %	75 %	25 %	325169042
119	NC_015188	AACG	2	8	37889	37896	50 %	0 %	25 %	25 %	325169042
120	NC_015188	AGCC	2	8	37932	37939	25 %	0 %	25 %	50 %	325169042
121	NC_015188	CTTC	2	8	37966	37973	0 %	50 %	0 %	50 %	325169042
122	NC_015188	TACG	2	8	38027	38034	25 %	25 %	25 %	25 %	325169042
123	NC_015188	CTGG	2	8	38602	38609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015188	GAAT	2	8	38692	38699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015188	GTCT	2	8	38810	38817	0 %	50 %	25 %	25 %	325169043
126	NC_015188	TCAC	2	8	39006	39013	25 %	25 %	0 %	50 %	325169043
127	NC_015188	GAAA	2	8	39187	39194	75 %	0 %	25 %	0 %	325169044
128	NC_015188	CGCC	2	8	40227	40234	0 %	0 %	25 %	75 %	325169045
129	NC_015188	CGGG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.