MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV2

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015187	CCCCT	2	10	92	101	0 %	20 %	0 %	80 %	325168932
2	NC_015187	AAGGG	2	10	2833	2842	40 %	0 %	60 %	0 %	325168935
3	NC_015187	AGGCA	2	10	2993	3002	40 %	0 %	40 %	20 %	325168936
4	NC_015187	GCACC	2	10	5767	5776	20 %	0 %	20 %	60 %	325168942
5	NC_015187	GGGCG	2	10	6384	6393	0 %	0 %	80 %	20 %	325168943
6	NC_015187	GGCTG	2	10	8493	8502	0 %	20 %	60 %	20 %	325168946
7	NC_015187	TTTCA	2	10	9129	9138	20 %	60 %	0 %	20 %	325168947
8	NC_015187	CGCGG	2	10	9803	9812	0 %	0 %	60 %	40 %	325168948
9	NC_015187	AACGG	2	10	12711	12720	40 %	0 %	40 %	20 %	325168949
10	NC_015187	AAGCG	2	10	18483	18492	40 %	0 %	40 %	20 %	325168954
11	NC_015187	ACCGC	2	10	19655	19664	20 %	0 %	20 %	60 %	325168955
12	NC_015187	GCGAG	2	10	19980	19989	20 %	0 %	60 %	20 %	325168956
13	NC_015187	TGCCG	2	10	21273	21282	0 %	20 %	40 %	40 %	325168957
14	NC_015187	TCCGC	2	10	21456	21465	0 %	20 %	20 %	60 %	325168957
15	NC_015187	AAGCT	2	10	23156	23165	40 %	20 %	20 %	20 %	325168960
16	NC_015187	GTGAG	2	10	24053	24062	20 %	20 %	60 %	0 %	325168961
17	NC_015187	CCGCG	2	10	24887	24896	0 %	0 %	40 %	60 %	325168961
18	NC_015187	GGAGC	2	10	27080	27089	20 %	0 %	60 %	20 %	325168963
19	NC_015187	TCCCG	2	10	27092	27101	0 %	20 %	20 %	60 %	325168963
20	NC_015187	GCGCC	2	10	27678	27687	0 %	0 %	40 %	60 %	325168964
21	NC_015187	GCCCC	2	10	29165	29174	0 %	0 %	20 %	80 %	325168966
22	NC_015187	GGCGC	2	10	30608	30617	0 %	0 %	60 %	40 %	325168966
23	NC_015187	GGCGC	2	10	31157	31166	0 %	0 %	60 %	40 %	325168966
24	NC_015187	TGGCG	2	10	31888	31897	0 %	20 %	60 %	20 %	325168966
25	NC_015187	GGCGT	2	10	31999	32008	0 %	20 %	60 %	20 %	325168966
26	NC_015187	ACGGC	2	10	32466	32475	20 %	0 %	40 %	40 %	325168966
27	NC_015187	GGCGA	2	10	32615	32624	20 %	0 %	60 %	20 %	325168966
28	NC_015187	CTCGG	2	10	36068	36077	0 %	20 %	40 %	40 %	325168967
29	NC_015187	CGCTG	2	10	39996	40005	0 %	20 %	40 %	40 %	325168971
30	NC_015187	CCAGC	2	10	40649	40658	20 %	0 %	20 %	60 %	325168972
31	NC_015187	CGCAT	2	10	41200	41209	20 %	20 %	20 %	40 %	325168972
32	NC_015187	CGCAG	2	10	43060	43069	20 %	0 %	40 %	40 %	325168975
33	NC_015187	GGCCG	2	10	43346	43355	0 %	0 %	60 %	40 %	325168975
34	NC_015187	TCAGC	2	10	43630	43639	20 %	20 %	20 %	40 %	325168975
35	NC_015187	AAGCC	2	10	43688	43697	40 %	0 %	20 %	40 %	325168975
36	NC_015187	TCCAG	2	10	44050	44059	20 %	20 %	20 %	40 %	325168975
37	NC_015187	AGCGG	2	10	45359	45368	20 %	0 %	60 %	20 %	325168976
38	NC_015187	TCCAC	2	10	49084	49093	20 %	20 %	0 %	60 %	325168982
39	NC_015187	TGCGG	2	10	49286	49295	0 %	20 %	60 %	20 %	325168982
40	NC_015187	CCGGT	2	10	49578	49587	0 %	20 %	40 %	40 %	325168983
41	NC_015187	CGGCG	2	10	50458	50467	0 %	0 %	60 %	40 %	325168984
42	NC_015187	GCGTC	2	10	52240	52249	0 %	20 %	40 %	40 %	325168984
43	NC_015187	GCGCC	2	10	52298	52307	0 %	0 %	40 %	60 %	325168984
44	NC_015187	AGCCG	2	10	52969	52978	20 %	0 %	40 %	40 %	325168984
45	NC_015187	TCCGC	2	10	54677	54686	0 %	20 %	20 %	60 %	325168986
46	NC_015187	GCCGG	2	10	54924	54933	0 %	0 %	60 %	40 %	325168986
47	NC_015187	GGCGA	2	10	55916	55925	20 %	0 %	60 %	20 %	325168988
48	NC_015187	TGGCG	2	10	56786	56795	0 %	20 %	60 %	20 %	325168989
49	NC_015187	GCCCT	2	10	61283	61292	0 %	20 %	20 %	60 %	325168995
50	NC_015187	GCCCG	2	10	62052	62061	0 %	0 %	40 %	60 %	325168995
51	NC_015187	TGATT	2	10	62750	62759	20 %	60 %	20 %	0 %	325168995
52	NC_015187	GCCCC	2	10	62819	62828	0 %	0 %	20 %	80 %	325168996
53	NC_015187	CGCCC	2	10	64995	65004	0 %	0 %	20 %	80 %	325169000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.