MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV2

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015187	CGGG	2	8	21	28	0 %	0 %	75 %	25 %	325168932
2	NC_015187	GATT	2	8	413	420	25 %	50 %	25 %	0 %	325168932
3	NC_015187	GCCG	2	8	550	557	0 %	0 %	50 %	50 %	325168932
4	NC_015187	AGCC	2	8	734	741	25 %	0 %	25 %	50 %	325168932
5	NC_015187	CGTT	2	8	1707	1714	0 %	50 %	25 %	25 %	325168933
6	NC_015187	CGAT	2	8	2606	2613	25 %	25 %	25 %	25 %	325168935
7	NC_015187	CGGC	2	8	2696	2703	0 %	0 %	50 %	50 %	325168935
8	NC_015187	GATC	2	8	3518	3525	25 %	25 %	25 %	25 %	325168937
9	NC_015187	GGCA	2	8	3880	3887	25 %	0 %	50 %	25 %	325168937
10	NC_015187	CTAA	2	8	4152	4159	50 %	25 %	0 %	25 %	325168938
11	NC_015187	GATG	2	8	4483	4490	25 %	25 %	50 %	0 %	325168939
12	NC_015187	CGGC	2	8	5601	5608	0 %	0 %	50 %	50 %	325168942
13	NC_015187	TTGG	2	8	5645	5652	0 %	50 %	50 %	0 %	325168942
14	NC_015187	CATC	2	8	5669	5676	25 %	25 %	0 %	50 %	325168942
15	NC_015187	ACGA	2	8	6718	6725	50 %	0 %	25 %	25 %	325168943
16	NC_015187	GATC	2	8	7777	7784	25 %	25 %	25 %	25 %	325168944
17	NC_015187	GGCC	2	8	8711	8718	0 %	0 %	50 %	50 %	325168946
18	NC_015187	CAGG	2	8	8785	8792	25 %	0 %	50 %	25 %	325168946
19	NC_015187	ATCC	2	8	9511	9518	25 %	25 %	0 %	50 %	325168948
20	NC_015187	GATT	2	8	9649	9656	25 %	50 %	25 %	0 %	325168948
21	NC_015187	GCCG	2	8	9840	9847	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
22	NC_015187	CCGG	2	8	10038	10045	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
23	NC_015187	CCGG	2	8	10090	10097	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
24	NC_015187	GGCC	2	8	10757	10764	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
25	NC_015187	GATG	2	8	12042	12049	25 %	25 %	50 %	0 %	325168949
26	NC_015187	CTGG	2	8	12577	12584	0 %	25 %	50 %	25 %	325168949
27	NC_015187	GCAA	2	8	12916	12923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015187	CCTG	2	8	13235	13242	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015187	GTCA	2	8	13258	13265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015187	CGGC	2	8	13685	13692	0 %	0 %	50 %	50 %	325168951
31	NC_015187	GCGG	2	8	13963	13970	0 %	0 %	75 %	25 %	325168951
32	NC_015187	CCGG	2	8	14659	14666	0 %	0 %	50 %	50 %	325168952
33	NC_015187	CAGG	2	8	14714	14721	25 %	0 %	50 %	25 %	325168952
34	NC_015187	ACGG	2	8	14761	14768	25 %	0 %	50 %	25 %	325168952
35	NC_015187	CCAG	2	8	14872	14879	25 %	0 %	25 %	50 %	325168952
36	NC_015187	CGGC	2	8	15333	15340	0 %	0 %	50 %	50 %	325168952
37	NC_015187	CAAA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015187	CGAC	2	8	16158	16165	25 %	0 %	25 %	50 %	325168953
39	NC_015187	TGCC	2	8	16203	16210	0 %	25 %	25 %	50 %	325168953
40	NC_015187	GCTG	2	8	16374	16381	0 %	25 %	50 %	25 %	325168953
41	NC_015187	CGTT	2	8	16606	16613	0 %	50 %	25 %	25 %	325168953
42	NC_015187	GGGA	2	8	16777	16784	25 %	0 %	75 %	0 %	325168953
43	NC_015187	ATCG	2	8	16978	16985	25 %	25 %	25 %	25 %	325168953
44	NC_015187	GCCG	2	8	17336	17343	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
45	NC_015187	CCAG	2	8	18286	18293	25 %	0 %	25 %	50 %	325168954
46	NC_015187	CCAG	2	8	18322	18329	25 %	0 %	25 %	50 %	325168954
47	NC_015187	CAGG	2	8	18997	19004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015187	AGCC	2	8	19754	19761	25 %	0 %	25 %	50 %	325168955
49	NC_015187	AGCC	2	8	19965	19972	25 %	0 %	25 %	50 %	325168956
50	NC_015187	GGCC	2	8	20841	20848	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
51	NC_015187	CGGC	2	8	20875	20882	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
52	NC_015187	GAAC	2	8	20895	20902	50 %	0 %	25 %	25 %	325168957
53	NC_015187	CCAG	2	8	21150	21157	25 %	0 %	25 %	50 %	325168957
54	NC_015187	GTCG	2	8	21331	21338	0 %	25 %	50 %	25 %	325168957
55	NC_015187	GATC	2	8	21497	21504	25 %	25 %	25 %	25 %	325168957
56	NC_015187	CCAT	2	8	21599	21606	25 %	25 %	0 %	50 %	325168957
57	NC_015187	CATC	2	8	22122	22129	25 %	25 %	0 %	50 %	325168958
58	NC_015187	TCTG	2	8	22181	22188	0 %	50 %	25 %	25 %	325168958
59	NC_015187	GTTT	2	8	22565	22572	0 %	75 %	25 %	0 %	325168958
60	NC_015187	GGAA	2	8	22900	22907	50 %	0 %	50 %	0 %	325168959
61	NC_015187	GTTT	2	8	23301	23308	0 %	75 %	25 %	0 %	325168960
62	NC_015187	CACG	2	8	24365	24372	25 %	0 %	25 %	50 %	325168961
63	NC_015187	AAGC	2	8	24962	24969	50 %	0 %	25 %	25 %	325168961
64	NC_015187	TCGT	2	8	25639	25646	0 %	50 %	25 %	25 %	325168961
65	NC_015187	AGCC	2	8	25920	25927	25 %	0 %	25 %	50 %	325168962
66	NC_015187	CATC	2	8	26501	26508	25 %	25 %	0 %	50 %	325168963
67	NC_015187	TCTG	2	8	26560	26567	0 %	50 %	25 %	25 %	325168963
68	NC_015187	GTTT	2	8	26944	26951	0 %	75 %	25 %	0 %	325168963
69	NC_015187	CTGG	2	8	27500	27507	0 %	25 %	50 %	25 %	325168964
70	NC_015187	GCGG	2	8	28084	28091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015187	GGCG	2	8	28502	28509	0 %	0 %	75 %	25 %	325168965
72	NC_015187	GCCG	2	8	28993	29000	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
73	NC_015187	GGCG	2	8	29465	29472	0 %	0 %	75 %	25 %	325168966
74	NC_015187	GCGG	2	8	29680	29687	0 %	0 %	75 %	25 %	325168966
75	NC_015187	GCGG	2	8	30305	30312	0 %	0 %	75 %	25 %	325168966
76	NC_015187	GGCA	2	8	30369	30376	25 %	0 %	50 %	25 %	325168966
77	NC_015187	GTCC	2	8	30465	30472	0 %	25 %	25 %	50 %	325168966
78	NC_015187	GCGG	2	8	30598	30605	0 %	0 %	75 %	25 %	325168966
79	NC_015187	CCGA	2	8	30728	30735	25 %	0 %	25 %	50 %	325168966
80	NC_015187	AAGG	2	8	30839	30846	50 %	0 %	50 %	0 %	325168966
81	NC_015187	CCGC	2	8	30891	30898	0 %	0 %	25 %	75 %	325168966
82	NC_015187	CGGC	2	8	31566	31573	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
83	NC_015187	TGGC	2	8	32041	32048	0 %	25 %	50 %	25 %	325168966
84	NC_015187	CGGC	2	8	32152	32159	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
85	NC_015187	TCGA	2	8	32297	32304	25 %	25 %	25 %	25 %	325168966
86	NC_015187	CCGG	2	8	32910	32917	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
87	NC_015187	ACGG	2	8	33014	33021	25 %	0 %	50 %	25 %	325168966
88	NC_015187	GCGG	2	8	33424	33431	0 %	0 %	75 %	25 %	325168966
89	NC_015187	GCCT	2	8	34283	34290	0 %	25 %	25 %	50 %	325168967
90	NC_015187	CGAG	2	8	34462	34469	25 %	0 %	50 %	25 %	325168967
91	NC_015187	AGCC	2	8	34915	34922	25 %	0 %	25 %	50 %	325168967
92	NC_015187	GCTG	2	8	35224	35231	0 %	25 %	50 %	25 %	325168967
93	NC_015187	GCCA	2	8	36391	36398	25 %	0 %	25 %	50 %	325168967
94	NC_015187	GCCG	2	8	36755	36762	0 %	0 %	50 %	50 %	325168969
95	NC_015187	TGGC	2	8	37527	37534	0 %	25 %	50 %	25 %	325168969
96	NC_015187	GCGT	2	8	37696	37703	0 %	25 %	50 %	25 %	325168969
97	NC_015187	CGGA	2	8	37952	37959	25 %	0 %	50 %	25 %	325168969
98	NC_015187	GCAC	2	8	38034	38041	25 %	0 %	25 %	50 %	325168969
99	NC_015187	GTCG	2	8	38231	38238	0 %	25 %	50 %	25 %	325168969
100	NC_015187	GGCT	2	8	38691	38698	0 %	25 %	50 %	25 %	325168969
101	NC_015187	GAGC	2	8	38869	38876	25 %	0 %	50 %	25 %	325168969
102	NC_015187	TCGT	2	8	39047	39054	0 %	50 %	25 %	25 %	325168970
103	NC_015187	CGGG	2	8	40167	40174	0 %	0 %	75 %	25 %	325168971
104	NC_015187	CCGG	2	8	40874	40881	0 %	0 %	50 %	50 %	325168972
105	NC_015187	TTGC	2	8	40896	40903	0 %	50 %	25 %	25 %	325168972
106	NC_015187	GCTG	2	8	41125	41132	0 %	25 %	50 %	25 %	325168972
107	NC_015187	CCGG	2	8	41359	41366	0 %	0 %	50 %	50 %	325168973
108	NC_015187	GGCC	2	8	41457	41464	0 %	0 %	50 %	50 %	325168973
109	NC_015187	TCGA	2	8	41997	42004	25 %	25 %	25 %	25 %	325168974
110	NC_015187	GACC	2	8	42112	42119	25 %	0 %	25 %	50 %	325168974
111	NC_015187	CCTT	2	8	42392	42399	0 %	50 %	0 %	50 %	325168974
112	NC_015187	GCGG	2	8	42608	42615	0 %	0 %	75 %	25 %	325168974
113	NC_015187	ACCG	2	8	42626	42633	25 %	0 %	25 %	50 %	325168974
114	NC_015187	ACGG	2	8	43019	43026	25 %	0 %	50 %	25 %	325168975
115	NC_015187	AAAT	2	8	43044	43051	75 %	25 %	0 %	0 %	325168975
116	NC_015187	CGGC	2	8	43070	43077	0 %	0 %	50 %	50 %	325168975
117	NC_015187	CTGA	2	8	43326	43333	25 %	25 %	25 %	25 %	325168975
118	NC_015187	GGCG	2	8	43468	43475	0 %	0 %	75 %	25 %	325168975
119	NC_015187	CTTG	2	8	43975	43982	0 %	50 %	25 %	25 %	325168975
120	NC_015187	CGGA	2	8	45210	45217	25 %	0 %	50 %	25 %	325168976
121	NC_015187	GTCC	2	8	45417	45424	0 %	25 %	25 %	50 %	325168976
122	NC_015187	CTTT	2	8	45540	45547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015187	CAAG	2	8	45698	45705	50 %	0 %	25 %	25 %	325168977
124	NC_015187	CAGG	2	8	46091	46098	25 %	0 %	50 %	25 %	325168977
125	NC_015187	CTGG	2	8	46140	46147	0 %	25 %	50 %	25 %	325168977
126	NC_015187	ATTG	2	8	46304	46311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015187	GCCC	2	8	47650	47657	0 %	0 %	25 %	75 %	325168979
128	NC_015187	GGGT	2	8	47759	47766	0 %	25 %	75 %	0 %	325168980
129	NC_015187	AGCG	2	8	48570	48577	25 %	0 %	50 %	25 %	325168981
130	NC_015187	GCCG	2	8	49319	49326	0 %	0 %	50 %	50 %	325168982
131	NC_015187	CCTG	2	8	49847	49854	0 %	25 %	25 %	50 %	325168983
132	NC_015187	GTGG	2	8	50103	50110	0 %	25 %	75 %	0 %	325168983
133	NC_015187	GATG	2	8	50663	50670	25 %	25 %	50 %	0 %	325168984
134	NC_015187	GCGG	2	8	51173	51180	0 %	0 %	75 %	25 %	325168984
135	NC_015187	CCGG	2	8	51642	51649	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
136	NC_015187	GGAG	2	8	52457	52464	25 %	0 %	75 %	0 %	325168984
137	NC_015187	AGGC	2	8	52746	52753	25 %	0 %	50 %	25 %	325168984
138	NC_015187	TTGC	2	8	52980	52987	0 %	50 %	25 %	25 %	325168984
139	NC_015187	AAAC	2	8	53072	53079	75 %	0 %	0 %	25 %	325168984
140	NC_015187	GGAT	2	8	53228	53235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015187	ACCG	2	8	53329	53336	25 %	0 %	25 %	50 %	325168985
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.