MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV2

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015187	GC	3	6	591	596	0 %	0 %	50 %	50 %	325168932
2	NC_015187	GC	3	6	772	777	0 %	0 %	50 %	50 %	325168932
3	NC_015187	GT	3	6	1429	1434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015187	GT	3	6	2107	2112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015187	CG	3	6	3163	3168	0 %	0 %	50 %	50 %	325168936
6	NC_015187	GC	3	6	3413	3418	0 %	0 %	50 %	50 %	325168937
7	NC_015187	CG	3	6	3443	3448	0 %	0 %	50 %	50 %	325168937
8	NC_015187	GC	3	6	3593	3598	0 %	0 %	50 %	50 %	325168937
9	NC_015187	TC	3	6	4544	4549	0 %	50 %	0 %	50 %	325168939
10	NC_015187	CG	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	325168939
11	NC_015187	CG	3	6	4870	4875	0 %	0 %	50 %	50 %	325168940
12	NC_015187	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	325168941
13	NC_015187	GC	3	6	6069	6074	0 %	0 %	50 %	50 %	325168942
14	NC_015187	GC	3	6	6419	6424	0 %	0 %	50 %	50 %	325168943
15	NC_015187	GC	3	6	6530	6535	0 %	0 %	50 %	50 %	325168943
16	NC_015187	GC	3	6	7215	7220	0 %	0 %	50 %	50 %	325168943
17	NC_015187	CG	3	6	7409	7414	0 %	0 %	50 %	50 %	325168943
18	NC_015187	CG	3	6	7792	7797	0 %	0 %	50 %	50 %	325168944
19	NC_015187	TA	3	6	8920	8925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015187	GA	3	6	8961	8966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015187	GC	3	6	10316	10321	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
22	NC_015187	GC	4	8	11106	11113	0 %	0 %	50 %	50 %	325168948
23	NC_015187	TC	4	8	11163	11170	0 %	50 %	0 %	50 %	325168948
24	NC_015187	CT	3	6	11700	11705	0 %	50 %	0 %	50 %	325168948
25	NC_015187	GT	3	6	11881	11886	0 %	50 %	50 %	0 %	325168948
26	NC_015187	GC	3	6	12488	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	325168949
27	NC_015187	GC	3	6	12700	12705	0 %	0 %	50 %	50 %	325168949
28	NC_015187	CG	3	6	13076	13081	0 %	0 %	50 %	50 %	325168950
29	NC_015187	GC	3	6	14139	14144	0 %	0 %	50 %	50 %	325168951
30	NC_015187	GT	3	6	14739	14744	0 %	50 %	50 %	0 %	325168952
31	NC_015187	TC	3	6	15625	15630	0 %	50 %	0 %	50 %	325168952
32	NC_015187	TG	3	6	15745	15750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015187	GC	3	6	17322	17327	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
34	NC_015187	GC	3	6	17365	17370	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
35	NC_015187	GC	3	6	17585	17590	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
36	NC_015187	GC	4	8	17735	17742	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
37	NC_015187	GC	3	6	17860	17865	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
38	NC_015187	GC	3	6	18551	18556	0 %	0 %	50 %	50 %	325168954
39	NC_015187	GT	3	6	18866	18871	0 %	50 %	50 %	0 %	325168954
40	NC_015187	AG	3	6	18896	18901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015187	CG	3	6	21174	21179	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
42	NC_015187	GC	3	6	21214	21219	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
43	NC_015187	GC	3	6	21238	21243	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
44	NC_015187	GC	3	6	21283	21288	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
45	NC_015187	GC	4	8	21571	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	325168957
46	NC_015187	GA	3	6	21861	21866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015187	AT	3	6	21976	21981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015187	TA	3	6	22706	22711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015187	AG	3	6	23014	23019	50 %	0 %	50 %	0 %	325168959
50	NC_015187	CA	3	6	23199	23204	50 %	0 %	0 %	50 %	325168960
51	NC_015187	AG	3	6	23679	23684	50 %	0 %	50 %	0 %	325168961
52	NC_015187	CG	3	6	24413	24418	0 %	0 %	50 %	50 %	325168961
53	NC_015187	CG	3	6	25092	25097	0 %	0 %	50 %	50 %	325168961
54	NC_015187	GC	4	8	25158	25165	0 %	0 %	50 %	50 %	325168961
55	NC_015187	CG	3	6	26711	26716	0 %	0 %	50 %	50 %	325168963
56	NC_015187	CG	3	6	26754	26759	0 %	0 %	50 %	50 %	325168963
57	NC_015187	GC	3	6	27314	27319	0 %	0 %	50 %	50 %	325168963
58	NC_015187	GA	3	6	28510	28515	50 %	0 %	50 %	0 %	325168965
59	NC_015187	GC	3	6	28882	28887	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
60	NC_015187	CG	3	6	28940	28945	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
61	NC_015187	CG	4	8	29304	29311	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
62	NC_015187	GC	3	6	29546	29551	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
63	NC_015187	GC	3	6	29696	29701	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
64	NC_015187	GC	3	6	30343	30348	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
65	NC_015187	CG	3	6	31666	31671	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
66	NC_015187	GC	3	6	31753	31758	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
67	NC_015187	GC	3	6	31776	31781	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
68	NC_015187	GC	3	6	32054	32059	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
69	NC_015187	CG	5	10	32387	32396	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
70	NC_015187	CG	5	10	32602	32611	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
71	NC_015187	CG	3	6	33178	33183	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
72	NC_015187	CG	3	6	33328	33333	0 %	0 %	50 %	50 %	325168966
73	NC_015187	AG	3	6	33522	33527	50 %	0 %	50 %	0 %	325168966
74	NC_015187	GA	3	6	33648	33653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015187	CG	3	6	34352	34357	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
76	NC_015187	GC	3	6	34705	34710	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
77	NC_015187	CG	3	6	34800	34805	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
78	NC_015187	CG	3	6	35203	35208	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
79	NC_015187	GC	3	6	35549	35554	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
80	NC_015187	GC	3	6	35594	35599	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
81	NC_015187	CG	3	6	35600	35605	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
82	NC_015187	CG	3	6	36114	36119	0 %	0 %	50 %	50 %	325168967
83	NC_015187	CA	3	6	36735	36740	50 %	0 %	0 %	50 %	325168969
84	NC_015187	AC	3	6	37013	37018	50 %	0 %	0 %	50 %	325168969
85	NC_015187	AC	3	6	37249	37254	50 %	0 %	0 %	50 %	325168969
86	NC_015187	GC	3	6	37617	37622	0 %	0 %	50 %	50 %	325168969
87	NC_015187	GC	3	6	37886	37891	0 %	0 %	50 %	50 %	325168969
88	NC_015187	GC	3	6	38067	38072	0 %	0 %	50 %	50 %	325168969
89	NC_015187	CA	3	6	39320	39325	50 %	0 %	0 %	50 %	325168970
90	NC_015187	GC	4	8	41005	41012	0 %	0 %	50 %	50 %	325168972
91	NC_015187	CA	3	6	41237	41242	50 %	0 %	0 %	50 %	325168972
92	NC_015187	CG	3	6	41769	41774	0 %	0 %	50 %	50 %	325168974
93	NC_015187	GC	4	8	42355	42362	0 %	0 %	50 %	50 %	325168974
94	NC_015187	CG	3	6	42507	42512	0 %	0 %	50 %	50 %	325168974
95	NC_015187	GA	3	6	42835	42840	50 %	0 %	50 %	0 %	325168974
96	NC_015187	CG	3	6	42942	42947	0 %	0 %	50 %	50 %	325168974
97	NC_015187	CG	3	6	43850	43855	0 %	0 %	50 %	50 %	325168975
98	NC_015187	GC	3	6	43860	43865	0 %	0 %	50 %	50 %	325168975
99	NC_015187	CG	3	6	44125	44130	0 %	0 %	50 %	50 %	325168975
100	NC_015187	CG	3	6	44725	44730	0 %	0 %	50 %	50 %	325168975
101	NC_015187	AC	3	6	45104	45109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015187	GC	3	6	45166	45171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015187	GC	3	6	45656	45661	0 %	0 %	50 %	50 %	325168977
104	NC_015187	GA	3	6	45978	45983	50 %	0 %	50 %	0 %	325168977
105	NC_015187	TC	3	6	46615	46620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015187	GC	3	6	47215	47220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015187	GC	3	6	48630	48635	0 %	0 %	50 %	50 %	325168981
108	NC_015187	CG	3	6	49885	49890	0 %	0 %	50 %	50 %	325168983
109	NC_015187	GC	3	6	50080	50085	0 %	0 %	50 %	50 %	325168983
110	NC_015187	CG	3	6	50971	50976	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
111	NC_015187	CG	3	6	51244	51249	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
112	NC_015187	GC	3	6	52193	52198	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
113	NC_015187	TC	3	6	52668	52673	0 %	50 %	0 %	50 %	325168984
114	NC_015187	GC	3	6	52752	52757	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
115	NC_015187	GC	3	6	52835	52840	0 %	0 %	50 %	50 %	325168984
116	NC_015187	GC	3	6	55055	55060	0 %	0 %	50 %	50 %	325168986
117	NC_015187	GC	3	6	55481	55486	0 %	0 %	50 %	50 %	325168987
118	NC_015187	GT	3	6	55709	55714	0 %	50 %	50 %	0 %	325168988
119	NC_015187	AT	3	6	55754	55759	50 %	50 %	0 %	0 %	325168988
120	NC_015187	CG	3	6	55954	55959	0 %	0 %	50 %	50 %	325168988
121	NC_015187	CG	4	8	56752	56759	0 %	0 %	50 %	50 %	325168989
122	NC_015187	GT	4	8	56775	56782	0 %	50 %	50 %	0 %	325168989
123	NC_015187	CG	4	8	57098	57105	0 %	0 %	50 %	50 %	325168989
124	NC_015187	AG	3	6	57929	57934	50 %	0 %	50 %	0 %	325168990
125	NC_015187	CG	3	6	57978	57983	0 %	0 %	50 %	50 %	325168990
126	NC_015187	GA	3	6	59253	59258	50 %	0 %	50 %	0 %	325168992
127	NC_015187	GA	3	6	60024	60029	50 %	0 %	50 %	0 %	325168994
128	NC_015187	GC	3	6	60445	60450	0 %	0 %	50 %	50 %	325168995
129	NC_015187	GC	3	6	61521	61526	0 %	0 %	50 %	50 %	325168995
130	NC_015187	CG	3	6	61559	61564	0 %	0 %	50 %	50 %	325168995
131	NC_015187	CT	3	6	61681	61686	0 %	50 %	0 %	50 %	325168995
132	NC_015187	CG	3	6	62091	62096	0 %	0 %	50 %	50 %	325168995
133	NC_015187	GC	3	6	62917	62922	0 %	0 %	50 %	50 %	325168996
134	NC_015187	GA	3	6	64409	64414	50 %	0 %	50 %	0 %	325168999
135	NC_015187	GC	3	6	64507	64512	0 %	0 %	50 %	50 %	325168999
136	NC_015187	GC	3	6	65184	65189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015187	CA	3	6	65268	65273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015187	CG	3	6	65276	65281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015187	CT	3	6	65291	65296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015187	CG	3	6	65337	65342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.