MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015186	AAAATC	2	12	43105	43116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015186	AGAATG	2	12	44752	44763	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015186	TCGCTG	2	12	77240	77251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015186	GGCAAT	2	12	165574	165585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015186	GGCGCG	2	12	236035	236046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015186	CGGGGA	2	12	297901	297912	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015186	GACCTT	2	12	331878	331889	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015186	CCGGCG	2	12	344076	344087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015186	CCGGCC	2	12	347287	347298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015186	TTCTCC	2	12	371809	371820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015186	TGTTCC	2	12	432757	432768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015186	CGGCGC	2	12	436710	436721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015186	CGAGAG	2	12	454477	454488	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015186	ACGAAC	2	12	470592	470603	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015186	CCGTCT	2	12	595432	595443	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015186	GCCACC	2	12	614320	614331	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015186	CATTTT	2	12	645730	645741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015186	TAGTCG	2	12	656132	656143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015186	CTGTTT	2	12	680880	680891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015186	GCCGGG	2	12	705851	705862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015186	CCGGCC	2	12	717269	717280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015186	CGCGCC	2	12	777809	777820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015186	GCCGGC	2	12	862436	862447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015186	ATCCTG	2	12	863730	863741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015186	CCCGGC	2	12	921300	921311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015186	GGCAGG	2	12	972373	972384	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015186	GGAACA	2	12	972981	972992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015186	GCCGGC	2	12	984979	984990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015186	GATTCA	2	12	1040470	1040481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015186	TGGGTT	2	12	1040690	1040701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015186	GATCAG	2	12	1144408	1144419	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015186	GCCACC	2	12	1156308	1156319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015186	GGGGGT	2	12	1175193	1175204	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015186	GGGGGT	2	12	1176150	1176161	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015186	GCCGGC	2	12	1199313	1199324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015186	CGGCCA	2	12	1281066	1281077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015186	CGTTTG	2	12	1318916	1318927	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015186	GCCAGC	2	12	1353773	1353784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015186	TTTCCC	2	12	1367950	1367961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015186	CGGATG	2	12	1388937	1388948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015186	GGCGCC	2	12	1422522	1422533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015186	CGTCGG	2	12	1450581	1450592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015186	CCCGGC	2	12	1507437	1507448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015186	CGCCGG	2	12	1539628	1539639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015186	GCCGCG	2	12	1586174	1586185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015186	CATGGC	2	12	1590908	1590919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015186	CATCTT	2	12	1610025	1610036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015186	GCCATT	2	12	1707722	1707733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015186	CCGGCG	2	12	1769083	1769094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015186	CGGGCG	2	12	1882304	1882315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015186	CGCGCC	2	12	1935177	1935188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015186	CCCGGC	2	12	1948905	1948916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015186	ATTTCG	2	12	1951488	1951499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015186	GGATGA	2	12	1971670	1971681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015186	GCGCCG	2	12	2076308	2076319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015186	CCAGCA	2	12	2103877	2103888	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015186	CACCAA	2	12	2130924	2130935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015186	GCGCCG	2	12	2132684	2132695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015186	CAGAAC	2	12	2168321	2168332	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015186	TGAACG	2	12	2201560	2201571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015186	CAGAGC	2	12	2233603	2233614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015186	CTACGC	2	12	2290319	2290330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015186	ATTTGA	2	12	2293792	2293803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015186	GTAACA	2	12	2310102	2310113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015186	CGCCGG	2	12	2340133	2340144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015186	GGGGGT	2	12	2380401	2380412	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015186	CTGTCT	2	12	2401176	2401187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015186	GATCCT	2	12	2415640	2415651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015186	ACGAAA	2	12	2488390	2488401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015186	TGGTTG	2	12	2505812	2505823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015186	CCGCGC	2	12	2590609	2590620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015186	GCGCGG	2	12	2629880	2629891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015186	TGCCTC	2	12	2684355	2684366	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015186	CGCCGG	2	12	2825145	2825156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015186	TCCAAC	2	12	2827579	2827590	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015186	CAACGC	2	12	2841392	2841403	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015186	ACCGTG	2	12	2890039	2890050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015186	CAGCAT	2	12	2938197	2938208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015186	CTACGC	2	12	2942537	2942548	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015186	ATCGCC	2	12	3039227	3039238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015186	GGACGC	2	12	3044487	3044498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015186	GTTTTG	2	12	3052790	3052801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015186	CAAAAC	2	12	3052852	3052863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015186	CAGTTG	2	12	3082550	3082561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015186	GCTCCG	2	12	3084479	3084490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015186	ACGGGC	2	12	3237939	3237950	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015186	CCGGCG	2	12	3258459	3258470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015186	ACCCTC	2	12	3348165	3348176	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015186	CGCCCG	2	12	3378613	3378624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015186	TTGCGG	2	12	3423809	3423820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015186	CCCCTT	2	12	3427456	3427467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015186	TTCGAT	2	12	3434301	3434312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015186	GCATCG	2	12	3460452	3460463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015186	AAATTC	2	12	3469889	3469900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015186	TTGCCG	2	12	3519823	3519834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015186	TTACGT	2	12	3589597	3589608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015186	CCGCTG	2	12	3622058	3622069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015186	CAGCGC	2	12	3679482	3679493	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015186	AATGAC	2	12	3680523	3680534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015186	CCACGA	2	12	3704035	3704046	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015186	CATGCC	2	12	3708088	3708099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015186	GCAGCC	2	12	3744306	3744317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.