MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Desulfurobacterium thermolithotrophum DSM 11699 chromosome

Total Repeats: 727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015185	AGCAGT	2	12	1483	1494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325294208
2	NC_015185	AAGCAG	2	12	1950	1961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325294208
3	NC_015185	TAGAAG	2	12	1968	1979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294208
4	NC_015185	AAAGCA	2	12	2054	2065	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325294208
5	NC_015185	CAATGA	2	12	6355	6366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325294213
6	NC_015185	AAAGGA	2	12	6680	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294213
7	NC_015185	AGAGGT	2	12	7241	7252	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325294213
8	NC_015185	CATTTA	2	12	7951	7962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325294214
9	NC_015185	AGTTAA	2	12	16796	16807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325294224
10	NC_015185	GTCAAA	2	12	17846	17857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325294225
11	NC_015185	TTTTCC	2	12	18347	18358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294225
12	NC_015185	ATTCTT	2	12	22679	22690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325294229
13	NC_015185	GTAGCT	2	12	22763	22774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325294230
14	NC_015185	AAAAGA	2	12	29484	29495	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325294236
15	NC_015185	AAAAGT	2	12	32632	32643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294240
16	NC_015185	GTTGCA	2	12	35195	35206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325294244
17	NC_015185	AAAAAC	2	12	35314	35325	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325294244
18	NC_015185	TAAAAA	2	12	35658	35669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325294244
19	NC_015185	CCAAAA	2	12	35984	35995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325294244
20	NC_015185	GATTTA	2	12	36085	36096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325294245
21	NC_015185	GAAAGA	2	12	37734	37745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294247
22	NC_015185	GAAAAT	2	12	39317	39328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294247
23	NC_015185	AGTAAA	2	12	40645	40656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294248
24	NC_015185	TTCTTT	2	12	44399	44410	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294251
25	NC_015185	AACTAT	2	12	44712	44723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325294252
26	NC_015185	TTTACT	2	12	46341	46352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325294253
27	NC_015185	TGTAGG	2	12	49108	49119	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325294257
28	NC_015185	TTCAGC	2	12	50791	50802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325294259
29	NC_015185	GGGGAC	2	12	51186	51197	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	325294259
30	NC_015185	CTTCAA	2	12	51724	51735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294260
31	NC_015185	AAGTAA	2	12	52705	52716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294262
32	NC_015185	TCCTTC	2	12	53180	53191	0 %	50 %	0 %	50 %	325294262
33	NC_015185	TTGATT	2	12	54486	54497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325294264
34	NC_015185	CAGTTA	2	12	54973	54984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325294265
35	NC_015185	TATCTT	2	12	58131	58142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325294269
36	NC_015185	TTCTTT	2	12	58175	58186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294269
37	NC_015185	AAGTAT	2	12	61254	61265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325294272
38	NC_015185	GGAAAA	2	12	63919	63930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294278
39	NC_015185	TGGAAA	2	12	64439	64450	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294278
40	NC_015185	TTTCTG	2	12	67495	67506	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325294282
41	NC_015185	TTCTCT	2	12	67568	67579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294282
42	NC_015185	TGAAGA	2	12	67799	67810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294282
43	NC_015185	GAAAGG	2	12	69493	69504	50 %	0 %	50 %	0 %	325294283
44	NC_015185	CAAAAA	2	12	70163	70174	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325294283
45	NC_015185	AAGGAA	2	12	70271	70282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294283
46	NC_015185	TAACTG	2	12	72815	72826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325294287
47	NC_015185	CCCTTT	2	12	74205	74216	0 %	50 %	0 %	50 %	325294288
48	NC_015185	CTAAAA	2	12	75777	75788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325294291
49	NC_015185	GAAGTT	2	12	82522	82533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294296
50	NC_015185	TATCCT	2	12	83401	83412	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325294298
51	NC_015185	GCAGTT	2	12	83488	83499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325294298
52	NC_015185	AGCAGG	2	12	85485	85496	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	325294300
53	NC_015185	TAGAAA	2	12	96261	96272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294310
54	NC_015185	TATGGA	2	12	98631	98642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294312
55	NC_015185	TTTTAA	2	12	100777	100788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325294314
56	NC_015185	TAACTG	2	12	102473	102484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325294317
57	NC_015185	TAAAGA	2	12	109282	109293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294322
58	NC_015185	CTGCAA	2	12	113449	113460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325294326
59	NC_015185	AGGAGA	2	12	114722	114733	50 %	0 %	50 %	0 %	325294328
60	NC_015185	AAAGAG	2	12	115766	115777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294329
61	NC_015185	TTTCTA	2	12	119516	119527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325294332
62	NC_015185	ACAAAA	2	12	119700	119711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	325294332
63	NC_015185	ATTTCC	2	12	122937	122948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325294335
64	NC_015185	TGGAGA	2	12	125802	125813	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325294339
65	NC_015185	TTTTCT	2	12	127897	127908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294341
66	NC_015185	GGAAAT	2	12	129237	129248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294342
67	NC_015185	GAATAT	2	12	130926	130937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325294345
68	NC_015185	GAGAAA	2	12	131134	131145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294345
69	NC_015185	ATGCTT	2	12	131462	131473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325294345
70	NC_015185	AGATGT	2	12	134790	134801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294348
71	NC_015185	CGGCAA	2	12	147709	147720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325294355
72	NC_015185	CTCTTT	2	12	154259	154270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294363
73	NC_015185	CTTAAA	2	12	156261	156272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325294364
74	NC_015185	ATTTGG	2	12	156701	156712	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325294364
75	NC_015185	TATGGA	2	12	158369	158380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294366
76	NC_015185	TTTACA	2	12	160429	160440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325294369
77	NC_015185	TTTCTT	2	12	165886	165897	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294375
78	NC_015185	TTCTTT	2	12	166466	166477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294375
79	NC_015185	ATTGAA	2	12	177761	177772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325294386
80	NC_015185	ATTTTC	2	12	178316	178327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325294387
81	NC_015185	AAAGAG	2	12	178515	178526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294387
82	NC_015185	TGATAT	2	12	179729	179740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325294388
83	NC_015185	TAAAAA	2	12	179842	179853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325294388
84	NC_015185	CTGTTA	2	12	186753	186764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325294396
85	NC_015185	GTGCTT	2	12	187128	187139	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325294396
86	NC_015185	GGGTAA	3	18	190771	190788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325294403
87	NC_015185	TGGAAA	2	12	194523	194534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294413
88	NC_015185	TGGAGA	2	12	195501	195512	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325294415
89	NC_015185	AAAAGT	2	12	198167	198178	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294418
90	NC_015185	GCTTGA	2	12	200069	200080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325294423
91	NC_015185	AATTTC	2	12	201634	201645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325294426
92	NC_015185	CTTCTG	2	12	202797	202808	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325294428
93	NC_015185	ATAGAT	2	12	203950	203961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325294429
94	NC_015185	TGCTTT	2	12	210369	210380	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325294434
95	NC_015185	ATTTGT	2	12	212700	212711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325294434
96	NC_015185	CTTCAT	2	12	217340	217351	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325294439
97	NC_015185	TGATGG	2	12	219007	219018	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	325294442
98	NC_015185	CCCTCA	2	12	222264	222275	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325294444
99	NC_015185	TTTGTC	2	12	226650	226661	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325294446
100	NC_015185	AAATAT	2	12	227039	227050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325294446
101	NC_015185	ACAAAT	2	12	230885	230896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325294448
102	NC_015185	AATTTT	2	12	234109	234120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325294451
103	NC_015185	TAAAAG	2	12	240361	240372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294456
104	NC_015185	TAGCTG	2	12	242514	242525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325294458
105	NC_015185	GGAAAT	2	12	242960	242971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294458
106	NC_015185	ATTGGA	2	12	243233	243244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325294458
107	NC_015185	TAACCT	2	12	243778	243789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325294458
108	NC_015185	TTCCTT	2	12	250011	250022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294465
109	NC_015185	TCTCTT	2	12	258036	258047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294473
110	NC_015185	TAGCTT	2	12	261781	261792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325294476
111	NC_015185	CTCTTC	2	12	263439	263450	0 %	50 %	0 %	50 %	325294477
112	NC_015185	TAAGAA	2	12	269320	269331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325294481
113	NC_015185	CTTTTT	2	12	273492	273503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	325294484
114	NC_015185	AACATA	2	12	273561	273572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325294484
115	NC_015185	AACTTT	2	12	274246	274257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	325294486
116	NC_015185	CTTTTC	2	12	275698	275709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325294487
117	NC_015185	TCTTGT	2	12	281936	281947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325294495
118	NC_015185	AGAAAG	2	12	282677	282688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325294496
119	NC_015185	TGGAAA	2	12	288246	288257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325294501
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460	NC_015185	TTGCTC	2	12	1005975	1005986	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325295191
461	NC_015185	TCCCTT	2	12	1006115	1006126	0 %	50 %	0 %	50 %	325295191
462	NC_015185	TTGGAA	2	12	1006910	1006921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325295192
463	NC_015185	TTATAG	2	12	1007466	1007477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	325295193
464	NC_015185	ATTCCT	2	12	1011021	1011032	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325295197
465	NC_015185	TTATCT	2	12	1011083	1011094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	325295197
466	NC_015185	TTTTAG	2	12	1013356	1013367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325295199
467	NC_015185	ACACTT	2	12	1014725	1014736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325295202
468	NC_015185	CCAGCA	2	12	1022239	1022250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325295207
469	NC_015185	CCCTTT	2	12	1028994	1029005	0 %	50 %	0 %	50 %	325295215
470	NC_015185	TCCAAC	2	12	1031028	1031039	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325295217
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483	NC_015185	TTATGT	2	12	1071380	1071391	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	325295261
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489	NC_015185	TTGGAA	2	12	1080765	1080776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325295269
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