MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurobacterium thermolithotrophum DSM 11699 chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015185	AAAC	2	8	2654	2661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015185	TTTC	2	8	15785	15792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015185	CTTT	2	8	16167	16174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015185	TATT	2	8	20807	20814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015185	AATT	2	8	20832	20839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015185	GAAG	2	8	23550	23557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015185	AAAC	2	8	28403	28410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015185	CTGT	2	8	32806	32813	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015185	GAAA	2	8	39732	39739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015185	TTTA	2	8	47549	47556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015185	TATT	2	8	47602	47609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015185	GAAG	2	8	73269	73276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015185	ATAA	2	8	78514	78521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015185	ACCT	2	8	79500	79507	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015185	TTCT	2	8	80378	80385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015185	AGAT	2	8	82855	82862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015185	ATTA	2	8	85379	85386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015185	GTGG	2	8	94910	94917	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015185	AGGA	2	8	112726	112733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015185	TCCT	2	8	112741	112748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015185	TAAG	2	8	129488	129495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015185	GATT	2	8	130591	130598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015185	TAAT	2	8	150488	150495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015185	GGAG	2	8	150528	150535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015185	TTAA	2	8	152913	152920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015185	TTCT	2	8	155337	155344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015185	TCCT	2	8	174762	174769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015185	AATT	2	8	174827	174834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015185	CTTT	2	8	181942	181949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015185	AGGA	2	8	182419	182426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015185	GGTA	2	8	186355	186362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015185	TAAT	2	8	198322	198329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015185	TTTA	2	8	201602	201609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015185	AATT	2	8	203328	203335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015185	TAAA	2	8	206106	206113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015185	CTCC	2	8	214729	214736	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015185	CTTT	2	8	218388	218395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015185	CTTT	2	8	221990	221997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015185	CCTT	2	8	224961	224968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015185	ACGA	2	8	224969	224976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015185	TACG	2	8	225035	225042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015185	AAAG	2	8	225302	225309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015185	AAAT	2	8	225482	225489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015185	ATAG	2	8	225497	225504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015185	TTAT	2	8	227954	227961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015185	AAGT	2	8	229908	229915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015185	ACTT	2	8	241542	241549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015185	GAAA	2	8	248538	248545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015185	ATTT	2	8	251805	251812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015185	TATT	2	8	256477	256484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015185	AGTT	2	8	264043	264050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015185	AATT	2	8	267913	267920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015185	TAAT	2	8	268366	268373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015185	AAAC	2	8	268393	268400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015185	CATT	2	8	269605	269612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015185	GTTT	2	8	269632	269639	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015185	CATC	2	8	269663	269670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015185	ATTC	2	8	270122	270129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015185	TGTA	2	8	270384	270391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015185	TTTG	2	8	270448	270455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015185	TACT	2	8	270717	270724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015185	AACT	2	8	270761	270768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015185	AGGA	2	8	270904	270911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015185	ATTT	2	8	300859	300866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015185	TTTA	2	8	300882	300889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015185	TAAG	2	8	305565	305572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015185	ACAA	2	8	314436	314443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015185	AGAA	2	8	324121	324128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015185	TTTA	2	8	336636	336643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015185	AATT	2	8	346482	346489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015185	ATTT	2	8	350622	350629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015185	AGAA	2	8	350698	350705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015185	TTAT	2	8	352328	352335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015185	TTTC	2	8	355809	355816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015185	ATTT	2	8	355854	355861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015185	TAAC	2	8	355968	355975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015185	CTTT	2	8	356067	356074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015185	TTGT	2	8	356432	356439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015185	TAAA	2	8	356857	356864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015185	CACG	2	8	357049	357056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015185	AATA	2	8	361738	361745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015185	TAGT	2	8	374413	374420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015185	AATT	2	8	388129	388136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015185	TTTG	2	8	412827	412834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015185	TTAC	2	8	419410	419417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015185	TTTA	2	8	421720	421727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015185	AGCA	2	8	421818	421825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015185	ATAG	2	8	422976	422983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015185	TCCA	2	8	423246	423253	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015185	TCTT	2	8	439562	439569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015185	GAAA	2	8	439616	439623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015185	ATTA	2	8	446119	446126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015185	ATTA	2	8	447940	447947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015185	TTAG	2	8	457059	457066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015185	TTTA	2	8	457169	457176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015185	CCTT	2	8	463737	463744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015185	AGAA	2	8	463828	463835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015185	ATCA	2	8	466007	466014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015185	TAAA	2	8	471114	471121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015185	ATTT	2	8	472158	472165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015185	TTTA	2	8	475055	475062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015185	ATAA	2	8	476744	476751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015185	TTTC	2	8	484108	484115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015185	TTTG	2	8	484444	484451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015185	TAAT	2	8	487218	487225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015185	TAAA	2	8	489043	489050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015185	CGGA	2	8	490754	490761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015185	GATA	2	8	494965	494972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015185	TTGA	2	8	494988	494995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015185	GAGG	2	8	496548	496555	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015185	GCCT	2	8	496827	496834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015185	GGCA	2	8	497069	497076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015185	CCAC	2	8	498161	498168	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_015185	AAGG	2	8	498290	498297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015185	CTCC	2	8	500636	500643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_015185	TATT	2	8	500871	500878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015185	GAAA	2	8	505270	505277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015185	TAAT	2	8	509213	509220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015185	AAAT	2	8	524266	524273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015185	AAGA	2	8	524345	524352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015185	GGCC	2	8	526378	526385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015185	AATC	2	8	569655	569662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015185	TGTT	2	8	579000	579007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015185	CAAA	2	8	595158	595165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015185	TCTT	2	8	595824	595831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015185	AGAA	2	8	598068	598075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015185	TGTT	2	8	598091	598098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015185	TGAT	2	8	605330	605337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015185	GGTG	2	8	656817	656824	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015185	CTTT	2	8	656925	656932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015185	GTTT	2	8	657230	657237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015185	TCCC	2	8	663856	663863	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015185	CTTT	2	8	663869	663876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015185	AGGA	2	8	665131	665138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015185	TTCC	2	8	689783	689790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015185	TATT	2	8	697423	697430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015185	CCTT	2	8	699494	699501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015185	TGGG	2	8	699554	699561	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015185	TTCT	2	8	701167	701174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015185	ATGC	2	8	701295	701302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015185	GGCG	2	8	705151	705158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015185	CAGC	2	8	705163	705170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015185	ATCT	2	8	711642	711649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015185	TCCT	2	8	717940	717947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015185	AAAT	2	8	717962	717969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015185	AAAT	2	8	717974	717981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015185	AGTT	2	8	727356	727363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015185	GAAA	2	8	736635	736642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015185	TCTT	2	8	737782	737789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015185	AAGA	2	8	737800	737807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_015185	TTTA	2	8	738052	738059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_015185	TCGC	2	8	1425303	1425310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
299	NC_015185	CTGC	2	8	1425411	1425418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
300	NC_015185	CTAT	2	8	1425548	1425555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
301	NC_015185	CCTC	2	8	1425759	1425766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
302	NC_015185	TCCT	2	8	1426042	1426049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
303	NC_015185	CTGG	2	8	1426492	1426499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
304	NC_015185	TCAA	2	8	1427319	1427326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
305	NC_015185	TATC	2	8	1427342	1427349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
306	NC_015185	CTCC	2	8	1434692	1434699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
307	NC_015185	CCGC	2	8	1434855	1434862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
308	NC_015185	ATTC	2	8	1455973	1455980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
309	NC_015185	TTCT	2	8	1463497	1463504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
310	NC_015185	AGAA	2	8	1467239	1467246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
311	NC_015185	CTTA	2	8	1468527	1468534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
312	NC_015185	AAAG	2	8	1489840	1489847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
313	NC_015185	AAAG	2	8	1489851	1489858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
314	NC_015185	TGAT	2	8	1491575	1491582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
315	NC_015185	GGTT	2	8	1491902	1491909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
316	NC_015185	TAAA	2	8	1499199	1499206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_015185	AAAC	2	8	1537579	1537586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
318	NC_015185	GAAA	2	8	1537658	1537665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.