MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015184	AACGA	2	10	598	607	60 %	0 %	20 %	20 %	325168280
2	NC_015184	GAGCG	2	10	987	996	20 %	0 %	60 %	20 %	325168280
3	NC_015184	CGTTG	2	10	1068	1077	0 %	40 %	40 %	20 %	325168280
4	NC_015184	GATCG	2	10	2989	2998	20 %	20 %	40 %	20 %	325168282
5	NC_015184	GCGGG	2	10	3585	3594	0 %	0 %	80 %	20 %	325168282
6	NC_015184	AGCGC	2	10	5058	5067	20 %	0 %	40 %	40 %	325168283
7	NC_015184	GATCG	2	10	5720	5729	20 %	20 %	40 %	20 %	325168283
8	NC_015184	TAGCG	2	10	8319	8328	20 %	20 %	40 %	20 %	325168284
9	NC_015184	CAATA	2	10	8389	8398	60 %	20 %	0 %	20 %	325168284
10	NC_015184	AGGGT	2	10	9998	10007	20 %	20 %	60 %	0 %	325168286
11	NC_015184	GCCGA	2	10	10368	10377	20 %	0 %	40 %	40 %	325168286
12	NC_015184	CCGGC	2	10	10536	10545	0 %	0 %	40 %	60 %	325168286
13	NC_015184	GCTTC	2	10	18015	18024	0 %	40 %	20 %	40 %	325168297
14	NC_015184	GAAAA	2	10	18919	18928	80 %	0 %	20 %	0 %	325168299
15	NC_015184	TTCCA	2	10	19711	19720	20 %	40 %	0 %	40 %	325168299
16	NC_015184	GCGCC	2	10	27873	27882	0 %	0 %	40 %	60 %	325168311
17	NC_015184	GAGGG	2	10	28607	28616	20 %	0 %	80 %	0 %	325168312
18	NC_015184	CAGGG	2	10	29105	29114	20 %	0 %	60 %	20 %	325168312
19	NC_015184	AGGGG	2	10	29968	29977	20 %	0 %	80 %	0 %	325168313
20	NC_015184	CAACG	2	10	30064	30073	40 %	0 %	20 %	40 %	325168313
21	NC_015184	ACGGA	2	10	34266	34275	40 %	0 %	40 %	20 %	325168317
22	NC_015184	TTGCG	2	10	37284	37293	0 %	40 %	40 %	20 %	325168320
23	NC_015184	AGAAA	2	10	40653	40662	80 %	0 %	20 %	0 %	325168322
24	NC_015184	ATCTT	2	10	40834	40843	20 %	60 %	0 %	20 %	325168322
25	NC_015184	CCGCC	2	10	41772	41781	0 %	0 %	20 %	80 %	325168323
26	NC_015184	GGAAC	2	10	45495	45504	40 %	0 %	40 %	20 %	325168326
27	NC_015184	TCTCT	2	10	45755	45764	0 %	60 %	0 %	40 %	325168326
28	NC_015184	TCACC	2	10	45797	45806	20 %	20 %	0 %	60 %	325168326
29	NC_015184	GCTGG	2	10	46832	46841	0 %	20 %	60 %	20 %	325168327
30	NC_015184	GAACT	2	10	46875	46884	40 %	20 %	20 %	20 %	325168327
31	NC_015184	TGGTG	2	10	48185	48194	0 %	40 %	60 %	0 %	325168329
32	NC_015184	GCTGC	2	10	49527	49536	0 %	20 %	40 %	40 %	325168331
33	NC_015184	GGGAA	2	10	49625	49634	40 %	0 %	60 %	0 %	325168331
34	NC_015184	CTTAT	2	10	53291	53300	20 %	60 %	0 %	20 %	325168335
35	NC_015184	CATGA	2	10	53317	53326	40 %	20 %	20 %	20 %	325168335
36	NC_015184	CCGAG	2	10	56410	56419	20 %	0 %	40 %	40 %	325168340
37	NC_015184	CGGCA	2	10	62176	62185	20 %	0 %	40 %	40 %	325168346
38	NC_015184	CCTTG	2	10	64691	64700	0 %	40 %	20 %	40 %	325168349
39	NC_015184	ATCCG	2	10	64838	64847	20 %	20 %	20 %	40 %	325168349
40	NC_015184	GCCGA	2	10	68955	68964	20 %	0 %	40 %	40 %	325168353
41	NC_015184	AGCCC	2	10	71057	71066	20 %	0 %	20 %	60 %	325168354
42	NC_015184	TTTCG	2	10	71829	71838	0 %	60 %	20 %	20 %	325168355
43	NC_015184	GCGAA	2	10	72560	72569	40 %	0 %	40 %	20 %	325168356
44	NC_015184	TCCTG	2	10	74650	74659	0 %	40 %	20 %	40 %	325168357
45	NC_015184	GGGGC	2	10	75306	75315	0 %	0 %	80 %	20 %	325168358
46	NC_015184	CGCAT	2	10	77131	77140	20 %	20 %	20 %	40 %	325168360
47	NC_015184	CAAAC	2	10	77473	77482	60 %	0 %	0 %	40 %	325168360
48	NC_015184	TGGCG	2	10	79466	79475	0 %	20 %	60 %	20 %	325168362
49	NC_015184	AACTG	2	10	79589	79598	40 %	20 %	20 %	20 %	325168362
50	NC_015184	CGGAG	2	10	80782	80791	20 %	0 %	60 %	20 %	325168364
51	NC_015184	GGGGA	2	10	81930	81939	20 %	0 %	80 %	0 %	325168367
52	NC_015184	AACCG	2	10	83344	83353	40 %	0 %	20 %	40 %	325168368
53	NC_015184	TGTCC	2	10	85980	85989	0 %	40 %	20 %	40 %	325168371
54	NC_015184	CGATG	2	10	87143	87152	20 %	20 %	40 %	20 %	325168373
55	NC_015184	ATTAC	2	10	88892	88901	40 %	40 %	0 %	20 %	325168374
56	NC_015184	TTGGC	2	10	89348	89357	0 %	40 %	40 %	20 %	325168375
57	NC_015184	CCAGC	2	10	92119	92128	20 %	0 %	20 %	60 %	325168377
58	NC_015184	GCGGT	2	10	94367	94376	0 %	20 %	60 %	20 %	325168379
59	NC_015184	GCAGG	2	10	96838	96847	20 %	0 %	60 %	20 %	325168382
60	NC_015184	TCGCC	2	10	101938	101947	0 %	20 %	20 %	60 %	325168386
61	NC_015184	ACAAA	2	10	104352	104361	80 %	0 %	0 %	20 %	325168389
62	NC_015184	AGGGA	2	10	106445	106454	40 %	0 %	60 %	0 %	325168392
63	NC_015184	GCGCG	2	10	106503	106512	0 %	0 %	60 %	40 %	325168392
64	NC_015184	CGTCA	2	10	107739	107748	20 %	20 %	20 %	40 %	325168394
65	NC_015184	TAGCC	2	10	112099	112108	20 %	20 %	20 %	40 %	325168400
66	NC_015184	CTGAT	2	10	112915	112924	20 %	40 %	20 %	20 %	325168400
67	NC_015184	GCGTT	2	10	114276	114285	0 %	40 %	40 %	20 %	325168400
68	NC_015184	GCGCG	2	10	114687	114696	0 %	0 %	60 %	40 %	325168400
69	NC_015184	AGCCG	2	10	114909	114918	20 %	0 %	40 %	40 %	325168400
70	NC_015184	GGACG	2	10	115554	115563	20 %	0 %	60 %	20 %	325168401
71	NC_015184	GGAAT	2	10	116162	116171	40 %	20 %	40 %	0 %	325168401
72	NC_015184	GCACG	2	10	117673	117682	20 %	0 %	40 %	40 %	325168403
73	NC_015184	CGCGC	2	10	122883	122892	0 %	0 %	40 %	60 %	325168409
74	NC_015184	GCTGT	2	10	122910	122919	0 %	40 %	40 %	20 %	325168409
75	NC_015184	ATCCG	2	10	128580	128589	20 %	20 %	20 %	40 %	325168414
76	NC_015184	GATGT	2	10	132167	132176	20 %	40 %	40 %	0 %	325168418
77	NC_015184	TGCGA	2	10	133545	133554	20 %	20 %	40 %	20 %	325168420
78	NC_015184	GGTAT	2	10	133671	133680	20 %	40 %	40 %	0 %	325168420
79	NC_015184	TCTGG	2	10	138183	138192	0 %	40 %	40 %	20 %	325168425
80	NC_015184	TCCGA	2	10	141349	141358	20 %	20 %	20 %	40 %	325168429
81	NC_015184	ACGTC	2	10	141643	141652	20 %	20 %	20 %	40 %	325168429
82	NC_015184	GATCC	2	10	141861	141870	20 %	20 %	20 %	40 %	325168429
83	NC_015184	AACCA	2	10	145257	145266	60 %	0 %	0 %	40 %	325168434
84	NC_015184	GATCG	2	10	145452	145461	20 %	20 %	40 %	20 %	325168435
85	NC_015184	GTCGC	2	10	146123	146132	0 %	20 %	40 %	40 %	325168436
86	NC_015184	GAACG	2	10	146982	146991	40 %	0 %	40 %	20 %	325168438
87	NC_015184	AGCAC	2	10	151054	151063	40 %	0 %	20 %	40 %	325168443
88	NC_015184	AGCCG	2	10	151730	151739	20 %	0 %	40 %	40 %	325168444
89	NC_015184	GCGCC	2	10	153485	153494	0 %	0 %	40 %	60 %	325168447
90	NC_015184	TCAGC	2	10	159398	159407	20 %	20 %	20 %	40 %	325168453
91	NC_015184	GGCCT	2	10	159420	159429	0 %	20 %	40 %	40 %	325168453
92	NC_015184	ATTGG	2	10	160338	160347	20 %	40 %	40 %	0 %	325168454
93	NC_015184	GGTGA	2	10	160934	160943	20 %	20 %	60 %	0 %	325168454
94	NC_015184	CCGCG	2	10	162284	162293	0 %	0 %	40 %	60 %	325168456
95	NC_015184	CCGGC	2	10	168685	168694	0 %	0 %	40 %	60 %	325168465
96	NC_015184	GCGCT	2	10	172275	172284	0 %	20 %	40 %	40 %	325168469
97	NC_015184	GCCGC	2	10	172515	172524	0 %	0 %	40 %	60 %	325168470
98	NC_015184	TGGCA	2	10	172963	172972	20 %	20 %	40 %	20 %	325168472
99	NC_015184	CGGAC	2	10	174048	174057	20 %	0 %	40 %	40 %	325168472
100	NC_015184	TGATC	2	10	174224	174233	20 %	40 %	20 %	20 %	325168473
101	NC_015184	TGGCA	2	10	177390	177399	20 %	20 %	40 %	20 %	325168476
102	NC_015184	CGTCT	2	10	184762	184771	0 %	40 %	20 %	40 %	325168486
103	NC_015184	CGGGG	2	10	185795	185804	0 %	0 %	80 %	20 %	325168488
104	NC_015184	GCGTC	2	10	186791	186800	0 %	20 %	40 %	40 %	325168489
105	NC_015184	GCCAT	2	10	192367	192376	20 %	20 %	20 %	40 %	325168496
106	NC_015184	GGATC	2	10	195950	195959	20 %	20 %	40 %	20 %	325168501
107	NC_015184	CGAAG	2	10	196088	196097	40 %	0 %	40 %	20 %	325168501
108	NC_015184	CAGCG	2	10	196818	196827	20 %	0 %	40 %	40 %	325168502
109	NC_015184	GACGC	2	10	197817	197826	20 %	0 %	40 %	40 %	325168504
110	NC_015184	CTGGA	2	10	198597	198606	20 %	20 %	40 %	20 %	325168504
111	NC_015184	CATGC	2	10	199650	199659	20 %	20 %	20 %	40 %	325168504
112	NC_015184	GATGC	2	10	202043	202052	20 %	20 %	40 %	20 %	325168507
113	NC_015184	GATCC	2	10	202210	202219	20 %	20 %	20 %	40 %	325168507
114	NC_015184	GCGCG	2	10	203985	203994	0 %	0 %	60 %	40 %	325168508
115	NC_015184	TCCGT	2	10	208908	208917	0 %	40 %	20 %	40 %	325168517
116	NC_015184	ATGCG	2	10	211830	211839	20 %	20 %	40 %	20 %	325168523
117	NC_015184	GATGG	2	10	212331	212340	20 %	20 %	60 %	0 %	325168524
118	NC_015184	TCCAA	2	10	212793	212802	40 %	20 %	0 %	40 %	325168524
119	NC_015184	GGCCA	2	10	215245	215254	20 %	0 %	40 %	40 %	325168527
120	NC_015184	GAGTC	2	10	215529	215538	20 %	20 %	40 %	20 %	325168528
121	NC_015184	CCGAG	2	10	216117	216126	20 %	0 %	40 %	40 %	325168528
122	NC_015184	ATGCC	2	10	219743	219752	20 %	20 %	20 %	40 %	325168533
123	NC_015184	ACCCG	2	10	220742	220751	20 %	0 %	20 %	60 %	325168533
124	NC_015184	AGGGT	2	10	220928	220937	20 %	20 %	60 %	0 %	325168533
125	NC_015184	GCTCA	2	10	225106	225115	20 %	20 %	20 %	40 %	325168539
126	NC_015184	CCCAG	2	10	227586	227595	20 %	0 %	20 %	60 %	325168542
127	NC_015184	TTGCT	2	10	228888	228897	0 %	60 %	20 %	20 %	325168544
128	NC_015184	CGCGC	2	10	229107	229116	0 %	0 %	40 %	60 %	325168544
129	NC_015184	TCGCC	2	10	232353	232362	0 %	20 %	20 %	60 %	325168548
130	NC_015184	CGTCC	2	10	233432	233441	0 %	20 %	20 %	60 %	325168551
131	NC_015184	GCGCC	2	10	234411	234420	0 %	0 %	40 %	60 %	325168553
132	NC_015184	ACGTC	2	10	235179	235188	20 %	20 %	20 %	40 %	325168554
133	NC_015184	GTGAG	2	10	236697	236706	20 %	20 %	60 %	0 %	325168555
134	NC_015184	GCTTT	2	10	238043	238052	0 %	60 %	20 %	20 %	325168558
135	NC_015184	ATGTC	2	10	238388	238397	20 %	40 %	20 %	20 %	325168561
136	NC_015184	GAGAA	2	10	244191	244200	60 %	0 %	40 %	0 %	325168567
137	NC_015184	AGCGA	2	10	244418	244427	40 %	0 %	40 %	20 %	325168567
138	NC_015184	AGGCG	2	10	246561	246570	20 %	0 %	60 %	20 %	325168569
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141	NC_015184	CTGGT	2	10	251540	251549	0 %	40 %	40 %	20 %	325168574
142	NC_015184	CAATC	2	10	252600	252609	40 %	20 %	0 %	40 %	325168576
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149	NC_015184	CAGGG	2	10	263218	263227	20 %	0 %	60 %	20 %	325168586
150	NC_015184	TCATC	2	10	263835	263844	20 %	40 %	0 %	40 %	325168586
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152	NC_015184	GAAAA	2	10	267512	267521	80 %	0 %	20 %	0 %	325168590
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157	NC_015184	GCCGA	2	10	272117	272126	20 %	0 %	40 %	40 %	325168593
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161	NC_015184	CGGCG	2	10	281967	281976	0 %	0 %	60 %	40 %	325168601
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174	NC_015184	GCCAG	2	10	313002	313011	20 %	0 %	40 %	40 %	325168640
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176	NC_015184	AGCAA	2	10	316284	316293	60 %	0 %	20 %	20 %	325168642
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244	NC_015184	TCGGA	2	10	404967	404976	20 %	20 %	40 %	20 %	325168737
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247	NC_015184	GCACA	2	10	408312	408321	40 %	0 %	20 %	40 %	325168740
248	NC_015184	GGCCT	2	10	408706	408715	0 %	20 %	40 %	40 %	325168741
249	NC_015184	CGGGC	2	10	410634	410643	0 %	0 %	60 %	40 %	325168744
250	NC_015184	ACGCC	2	10	412378	412387	20 %	0 %	20 %	60 %	325168746
251	NC_015184	CGACC	2	10	414913	414922	20 %	0 %	20 %	60 %	325168750
252	NC_015184	CAGGC	2	10	417787	417796	20 %	0 %	40 %	40 %	325168754
253	NC_015184	CTTTG	2	10	422294	422303	0 %	60 %	20 %	20 %	325168760
254	NC_015184	CGATG	2	10	426039	426048	20 %	20 %	40 %	20 %	325168765
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256	NC_015184	AACGG	2	10	429106	429115	40 %	0 %	40 %	20 %	325168768
257	NC_015184	AGGCG	2	10	429931	429940	20 %	0 %	60 %	20 %	325168770
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259	NC_015184	TCGGG	2	10	432760	432769	0 %	20 %	60 %	20 %	325168773
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261	NC_015184	CGCGG	2	10	435138	435147	0 %	0 %	60 %	40 %	325168774
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.