MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015184	TAAG	2	8	2340	2347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015184	TTCC	2	8	3845	3852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015184	CGAT	2	8	17253	17260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015184	TGGG	2	8	25269	25276	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015184	GAGC	2	8	26128	26135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015184	CTTG	2	8	31159	31166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015184	CGAG	2	8	31195	31202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015184	TCAG	2	8	31232	31239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015184	ACGA	2	8	31257	31264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015184	TTGT	2	8	33341	33348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015184	AGCG	2	8	36585	36592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015184	CGCC	2	8	36633	36640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_015184	GAGT	2	8	36667	36674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015184	CCAA	2	8	38719	38726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015184	TTGA	2	8	44188	44195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015184	AGAT	2	8	44201	44208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015184	CGTC	2	8	51483	51490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015184	GACC	2	8	52629	52636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015184	GATT	2	8	58447	58454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015184	CCGA	2	8	74938	74945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015184	GTCC	2	8	76986	76993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015184	GGAA	2	8	78876	78883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015184	CCGG	2	8	81032	81039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015184	GTCG	2	8	84117	84124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015184	ATCA	2	8	84837	84844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015184	CCTT	2	8	84852	84859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015184	CAAG	2	8	99017	99024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015184	CTGA	2	8	99076	99083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015184	GTGC	2	8	99433	99440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015184	TTCG	2	8	102696	102703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015184	GCTT	2	8	108424	108431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015184	TGAT	2	8	109583	109590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015184	TCCT	2	8	110050	110057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015184	TTCG	2	8	115196	115203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015184	CTGG	2	8	115247	115254	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015184	ATCA	2	8	126993	127000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015184	CAAC	2	8	133115	133122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015184	TCCT	2	8	133194	133201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015184	CAGT	2	8	133796	133803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015184	TCGA	2	8	136941	136948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015184	GCGG	2	8	139351	139358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015184	TCGA	2	8	140211	140218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015184	ATCA	2	8	145535	145542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015184	TGTC	2	8	146494	146501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015184	GCAT	2	8	151449	151456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015184	CGAA	2	8	152091	152098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015184	GCGA	2	8	152151	152158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015184	TTCT	2	8	152609	152616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015184	AACC	2	8	152617	152624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015184	CGAC	3	12	154804	154815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015184	GACC	2	8	156092	156099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015184	TTAA	2	8	159766	159773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015184	ATTA	2	8	159796	159803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015184	GTTT	2	8	162562	162569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015184	ATGG	2	8	162586	162593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015184	ATCA	2	8	166560	166567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015184	AGCC	2	8	170356	170363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015184	GGCG	2	8	171094	171101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015184	GGCT	2	8	171232	171239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015184	CGAT	2	8	171893	171900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015184	CGAT	2	8	175663	175670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015184	AATG	2	8	176702	176709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015184	ATGT	2	8	182071	182078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015184	ATTG	2	8	184938	184945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015184	GGCG	2	8	185599	185606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015184	GCCC	2	8	185705	185712	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_015184	TTTG	2	8	185733	185740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015184	GACC	2	8	188417	188424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015184	ACTG	2	8	188437	188444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015184	ATGG	2	8	188458	188465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015184	ATCC	2	8	188597	188604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015184	CAGC	2	8	189706	189713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015184	GAGG	2	8	192729	192736	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015184	TGCG	2	8	192756	192763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015184	TCAG	2	8	195554	195561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015184	GCCC	2	8	202461	202468	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015184	ACAA	2	8	204506	204513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015184	ATTT	2	8	204594	204601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015184	AGCG	2	8	205562	205569	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015184	TATT	2	8	209396	209403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015184	TGGA	2	8	209548	209555	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015184	ATGA	2	8	210757	210764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015184	CTTC	2	8	211141	211148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015184	TGTC	2	8	213066	213073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015184	AACG	2	8	216318	216325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015184	CGTT	2	8	216356	216363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015184	ACGG	2	8	216687	216694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015184	GGCT	2	8	216827	216834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015184	CCTG	2	8	219361	219368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015184	TGGG	2	8	221211	221218	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015184	GATC	2	8	222439	222446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015184	TTCT	2	8	223317	223324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015184	AACC	2	8	223325	223332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015184	GTAA	2	8	224763	224770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015184	GACT	2	8	225729	225736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015184	ATAC	2	8	233986	233993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015184	CGGG	2	8	234945	234952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015184	CTTT	2	8	237393	237400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015184	AGGC	2	8	242348	242355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015184	ATTG	2	8	243597	243604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015184	GTCC	2	8	245679	245686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015184	CGCT	2	8	245741	245748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015184	ATTC	2	8	247688	247695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015184	GACG	2	8	259843	259850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015184	AACA	2	8	259972	259979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015184	GCCT	2	8	266349	266356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015184	CATC	2	8	267078	267085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015184	GGCC	2	8	268333	268340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015184	GCCC	2	8	273396	273403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_015184	AGCA	2	8	275720	275727	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015184	CGAT	2	8	275826	275833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015184	GGCC	2	8	276901	276908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015184	GATT	2	8	288825	288832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015184	GCTG	2	8	295425	295432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015184	CCCG	2	8	298889	298896	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_015184	TCGG	2	8	299473	299480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015184	ATCC	2	8	303820	303827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015184	TTCC	2	8	308168	308175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015184	ATGC	2	8	310656	310663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015184	GGGA	2	8	311959	311966	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015184	CCTT	2	8	327325	327332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015184	TGCA	2	8	330922	330929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015184	TCGC	2	8	331029	331036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015184	GGAA	2	8	341111	341118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015184	TTTG	2	8	343265	343272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015184	CTTT	2	8	346849	346856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015184	GACC	2	8	347537	347544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015184	GCCT	2	8	347662	347669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015184	GAAC	2	8	347728	347735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015184	CTAT	2	8	348231	348238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015184	GCCA	2	8	358742	358749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015184	CCAT	2	8	358766	358773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015184	ATTG	2	8	359109	359116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015184	TTCA	2	8	360757	360764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015184	CCAA	2	8	360826	360833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015184	GCTT	2	8	362390	362397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015184	TCGC	2	8	366089	366096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015184	GTCG	2	8	367320	367327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015184	GCCA	2	8	367576	367583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015184	TTGT	2	8	374115	374122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015184	GCTG	2	8	377034	377041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015184	ATGG	2	8	396100	396107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015184	GCCG	2	8	408997	409004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015184	AGAA	2	8	414307	414314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015184	CATC	2	8	423018	423025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015184	GCCG	2	8	431352	431359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015184	CGAA	2	8	431903	431910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015184	AGAA	2	8	432059	432066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015184	ATCA	2	8	443709	443716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015184	CTTG	2	8	443742	443749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015184	AGGG	2	8	449362	449369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015184	GAAA	2	8	598960	598967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015184	CGAT	2	8	601194	601201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.