MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 1542

< Previous1234Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015184	CCGG	2	8	581819	581826	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
1502	NC_015184	CGTC	2	8	581955	581962	0 %	25 %	25 %	50 %	325168919
1503	NC_015184	CTGC	2	8	582932	582939	0 %	25 %	25 %	50 %	325168919
1504	NC_015184	GGCG	2	8	583195	583202	0 %	0 %	75 %	25 %	325168919
1505	NC_015184	GTCG	2	8	583969	583976	0 %	25 %	50 %	25 %	325168919
1506	NC_015184	AGCG	2	8	584224	584231	25 %	0 %	50 %	25 %	325168919
1507	NC_015184	GGAT	2	8	585007	585014	25 %	25 %	50 %	0 %	325168920
1508	NC_015184	CAGT	2	8	585473	585480	25 %	25 %	25 %	25 %	325168920
1509	NC_015184	AGCG	2	8	585555	585562	25 %	0 %	50 %	25 %	325168920
1510	NC_015184	GTGC	2	8	586394	586401	0 %	25 %	50 %	25 %	325168921
1511	NC_015184	GCCG	2	8	586654	586661	0 %	0 %	50 %	50 %	325168921
1512	NC_015184	AATG	2	8	587358	587365	50 %	25 %	25 %	0 %	325168921
1513	NC_015184	TCCT	2	8	587842	587849	0 %	50 %	0 %	50 %	325168921
1514	NC_015184	GCGG	2	8	588468	588475	0 %	0 %	75 %	25 %	325168922
1515	NC_015184	GGAT	2	8	588612	588619	25 %	25 %	50 %	0 %	325168922
1516	NC_015184	ATCG	2	8	588731	588738	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
1517	NC_015184	TCGA	2	8	588981	588988	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
1518	NC_015184	CCGG	2	8	589569	589576	0 %	0 %	50 %	50 %	325168922
1519	NC_015184	AGGT	2	8	589995	590002	25 %	25 %	50 %	0 %	325168922
1520	NC_015184	GCCA	2	8	590940	590947	25 %	0 %	25 %	50 %	325168923
1521	NC_015184	CCAG	2	8	591065	591072	25 %	0 %	25 %	50 %	325168923
1522	NC_015184	CCAT	2	8	591115	591122	25 %	25 %	0 %	50 %	325168923
1523	NC_015184	AAGC	2	8	591428	591435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_015184	GGCC	2	8	591850	591857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_015184	TGAC	2	8	592100	592107	25 %	25 %	25 %	25 %	325168924
1526	NC_015184	GAGC	2	8	592115	592122	25 %	0 %	50 %	25 %	325168924
1527	NC_015184	CTTT	2	8	592131	592138	0 %	75 %	0 %	25 %	325168924
1528	NC_015184	CAAC	2	8	592183	592190	50 %	0 %	0 %	50 %	325168924
1529	NC_015184	CTGC	2	8	592426	592433	0 %	25 %	25 %	50 %	325168924
1530	NC_015184	CAAA	2	8	593277	593284	75 %	0 %	0 %	25 %	325168924
1531	NC_015184	GTGC	2	8	593606	593613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_015184	TGCG	2	8	593868	593875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_015184	GCCG	2	8	594494	594501	0 %	0 %	50 %	50 %	325168925
1534	NC_015184	AGAA	2	8	594627	594634	75 %	0 %	25 %	0 %	325168925
1535	NC_015184	AGCG	2	8	596222	596229	25 %	0 %	50 %	25 %	325168926
1536	NC_015184	TCAA	2	8	596379	596386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_015184	GCTG	2	8	596432	596439	0 %	25 %	50 %	25 %	325168927
1538	NC_015184	GAAA	2	8	598960	598967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015184	GGCA	2	8	600348	600355	25 %	0 %	50 %	25 %	325168930
1540	NC_015184	GTGC	2	8	600729	600736	0 %	25 %	50 %	25 %	325168930
1541	NC_015184	CGAT	2	8	601194	601201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_015184	CGAC	2	8	601372	601379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

< Previous1234Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.