MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015184	G	6	6	6731	6736	0 %	0 %	100 %	0 %	325168283
2	NC_015184	G	6	6	12022	12027	0 %	0 %	100 %	0 %	325168289
3	NC_015184	T	6	6	13864	13869	0 %	100 %	0 %	0 %	325168293
4	NC_015184	C	6	6	18760	18765	0 %	0 %	0 %	100 %	325168299
5	NC_015184	T	6	6	21715	21720	0 %	100 %	0 %	0 %	325168303
6	NC_015184	T	7	7	23422	23428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015184	T	6	6	24792	24797	0 %	100 %	0 %	0 %	325168306
8	NC_015184	C	6	6	25396	25401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_015184	A	6	6	26392	26397	100 %	0 %	0 %	0 %	325168308
10	NC_015184	T	6	6	26772	26777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015184	A	6	6	33230	33235	100 %	0 %	0 %	0 %	325168316
12	NC_015184	G	6	6	33894	33899	0 %	0 %	100 %	0 %	325168317
13	NC_015184	T	6	6	34403	34408	0 %	100 %	0 %	0 %	325168317
14	NC_015184	A	6	6	39077	39082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015184	C	6	6	41459	41464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_015184	T	6	6	51732	51737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015184	A	6	6	59192	59197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015184	A	8	8	62469	62476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015184	G	6	6	66876	66881	0 %	0 %	100 %	0 %	325168351
20	NC_015184	A	6	6	67240	67245	100 %	0 %	0 %	0 %	325168351
21	NC_015184	T	6	6	67768	67773	0 %	100 %	0 %	0 %	325168352
22	NC_015184	C	6	6	70420	70425	0 %	0 %	0 %	100 %	325168354
23	NC_015184	A	7	7	71116	71122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015184	T	6	6	73503	73508	0 %	100 %	0 %	0 %	325168356
25	NC_015184	G	6	6	74263	74268	0 %	0 %	100 %	0 %	325168357
26	NC_015184	C	6	6	75833	75838	0 %	0 %	0 %	100 %	325168358
27	NC_015184	A	6	6	82271	82276	100 %	0 %	0 %	0 %	325168367
28	NC_015184	T	6	6	84917	84922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015184	T	7	7	85789	85795	0 %	100 %	0 %	0 %	325168370
30	NC_015184	T	6	6	86656	86661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015184	T	6	6	89252	89257	0 %	100 %	0 %	0 %	325168375
32	NC_015184	A	6	6	95658	95663	100 %	0 %	0 %	0 %	325168380
33	NC_015184	T	6	6	96590	96595	0 %	100 %	0 %	0 %	325168382
34	NC_015184	T	6	6	98467	98472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015184	A	6	6	98648	98653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015184	A	6	6	98948	98953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015184	T	6	6	104195	104200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015184	G	7	7	104510	104516	0 %	0 %	100 %	0 %	325168389
39	NC_015184	A	7	7	110107	110113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015184	A	6	6	110118	110123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015184	T	6	6	122807	122812	0 %	100 %	0 %	0 %	325168409
42	NC_015184	G	6	6	123157	123162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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44	NC_015184	T	7	7	124502	124508	0 %	100 %	0 %	0 %	325168411
45	NC_015184	A	6	6	126181	126186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015184	T	6	6	129827	129832	0 %	100 %	0 %	0 %	325168416
47	NC_015184	G	6	6	131941	131946	0 %	0 %	100 %	0 %	325168418
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49	NC_015184	A	6	6	133899	133904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015184	T	6	6	136949	136954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015184	T	6	6	142504	142509	0 %	100 %	0 %	0 %	325168430
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53	NC_015184	G	6	6	148473	148478	0 %	0 %	100 %	0 %	325168440
54	NC_015184	C	6	6	149677	149682	0 %	0 %	0 %	100 %	325168441
55	NC_015184	C	7	7	152813	152819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_015184	T	6	6	159264	159269	0 %	100 %	0 %	0 %	325168453
57	NC_015184	C	6	6	172065	172070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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62	NC_015184	T	7	7	178385	178391	0 %	100 %	0 %	0 %	325168478
63	NC_015184	A	6	6	180082	180087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_015184	A	6	6	185621	185626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_015184	G	6	6	197653	197658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_015184	G	6	6	205512	205517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_015184	A	8	8	295397	295404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_015184	A	6	6	299667	299672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_015184	G	6	6	313959	313964	0 %	0 %	100 %	0 %	325168641
112	NC_015184	A	6	6	317162	317167	100 %	0 %	0 %	0 %	325168643
113	NC_015184	A	6	6	317562	317567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_015184	T	6	6	337111	337116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.