MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015183	GGGA	2	8	11287	11294	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015183	CTGC	2	8	41309	41316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015183	GCCT	2	8	48299	48306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015183	TCCT	2	8	56773	56780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015183	GAAC	2	8	57270	57277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015183	GTGA	2	8	57613	57620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015183	TCTT	2	8	58907	58914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015183	TGAT	2	8	59022	59029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015183	AGGA	2	8	59602	59609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015183	GCGA	2	8	60166	60173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015183	AGTT	2	8	60559	60566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015183	CGTC	2	8	60864	60871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015183	AAAG	2	8	60987	60994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015183	AGGG	2	8	61650	61657	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015183	AACC	2	8	62551	62558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015183	TCGA	2	8	62658	62665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015183	CGCC	2	8	66678	66685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015183	ATTT	2	8	66809	66816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015183	TCCG	2	8	70677	70684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015183	CGGG	2	8	71023	71030	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015183	GGAA	2	8	71037	71044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015183	TGCG	2	8	71065	71072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015183	CTTC	2	8	71560	71567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015183	TTTC	2	8	79900	79907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015183	ACCG	2	8	81905	81912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015183	TGAA	2	8	81986	81993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015183	CTCC	2	8	82078	82085	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_015183	TTGT	2	8	86295	86302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015183	AACG	2	8	86326	86333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015183	GAGC	2	8	88374	88381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015183	CATC	2	8	91214	91221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015183	GTCA	2	8	94428	94435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015183	TCTG	2	8	105301	105308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015183	AATT	2	8	106086	106093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015183	GTTG	2	8	106230	106237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015183	TGCC	2	8	106300	106307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015183	TTTG	2	8	109610	109617	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015183	GGAA	2	8	109719	109726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015183	AAAG	2	8	111963	111970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015183	TGCG	2	8	115868	115875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015183	GGCC	2	8	121594	121601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015183	AAGG	2	8	123725	123732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015183	CTGT	2	8	127894	127901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015183	CCTT	2	8	138835	138842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015183	TACT	2	8	157054	157061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015183	TCCG	2	8	159177	159184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015183	AAAT	2	8	162649	162656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015183	AGGA	2	8	165334	165341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015183	GGTC	2	8	166097	166104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015183	CAGC	2	8	170586	170593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015183	ATGA	2	8	184597	184604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015183	TCAC	2	8	186209	186216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015183	TGAC	2	8	186252	186259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015183	CCGC	3	12	186283	186294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015183	TGTT	2	8	189055	189062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015183	GCTT	2	8	190956	190963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015183	GCTG	2	8	204853	204860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015183	AACA	2	8	205619	205626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015183	CGCC	2	8	206756	206763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015183	GCTG	2	8	209723	209730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015183	TGCG	2	8	210936	210943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015183	TGAA	2	8	212433	212440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015183	TGCC	2	8	213708	213715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015183	GGGC	2	8	218108	218115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015183	CCTT	2	8	220138	220145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015183	TCCG	2	8	220178	220185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015183	TTAC	2	8	226897	226904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015183	TAAA	2	8	227325	227332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015183	TTCA	2	8	227529	227536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015183	TGGC	2	8	228059	228066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015183	GGGC	2	8	231742	231749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015183	GGAC	2	8	232745	232752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015183	GCCT	2	8	234571	234578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015183	AACG	2	8	235185	235192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015183	AGGA	2	8	260610	260617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015183	AGGC	2	8	265333	265340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015183	CTCG	2	8	270216	270223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015183	CCTG	2	8	273817	273824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015183	GATT	2	8	281372	281379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015183	ACGA	2	8	283736	283743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015183	CGTT	2	8	285550	285557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015183	CGTT	2	8	285808	285815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015183	GATT	2	8	289715	289722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015183	CCGG	2	8	290923	290930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015183	CCGG	2	8	291105	291112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015183	TCAA	2	8	307666	307673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015183	GTCT	2	8	310184	310191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015183	GCCC	2	8	312098	312105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_015183	GGGA	2	8	313115	313122	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015183	CAGG	2	8	314889	314896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015183	CAAC	2	8	318798	318805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015183	TTTG	2	8	319514	319521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015183	ATGC	2	8	326294	326301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015183	TGCG	2	8	343481	343488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015183	GCGG	2	8	362586	362593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015183	TGAA	3	12	370558	370569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015183	GGCT	2	8	374495	374502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015183	GTTT	2	8	376634	376641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015183	GCAC	2	8	378433	378440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015183	GCCA	2	8	385031	385038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015183	GCCA	2	8	391180	391187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015183	TGGC	2	8	391193	391200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015183	CGAT	2	8	391205	391212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015183	CCTG	2	8	392233	392240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015183	TTCC	2	8	394945	394952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015183	CGAA	2	8	406643	406650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015183	AGCA	2	8	406655	406662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015183	TGCC	2	8	407790	407797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015183	TAAA	2	8	412661	412668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015183	CATC	2	8	413939	413946	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015183	CCGG	2	8	417763	417770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015183	ATGA	2	8	424453	424460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015183	GCCA	2	8	427248	427255	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015183	AGGC	2	8	433020	433027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015183	TGTT	2	8	440376	440383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015183	TCGA	2	8	441100	441107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015183	GAAG	2	8	446819	446826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015183	TCTG	2	8	448709	448716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015183	ATTT	2	8	452958	452965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015183	CTGA	2	8	459139	459146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015183	CGCC	2	8	459329	459336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_015183	CAAG	2	8	466418	466425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015183	GTTC	2	8	466586	466593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015183	CCTT	2	8	474555	474562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015183	ATGA	2	8	474643	474650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015183	CATC	2	8	484475	484482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015183	GCCC	2	8	485753	485760	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_015183	GGCA	2	8	485782	485789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015183	GCTT	2	8	494316	494323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015183	TTTA	2	8	495871	495878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015183	TGCG	2	8	495887	495894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015183	AACA	2	8	497650	497657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015183	GCCT	2	8	501811	501818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015183	CTGC	2	8	511402	511409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015183	GTTG	2	8	514601	514608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015183	CCGG	2	8	514700	514707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015183	GGGC	2	8	514815	514822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015183	ATTC	2	8	520852	520859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015183	TTGA	2	8	529935	529942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015183	TTTG	2	8	532367	532374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015183	GCGG	2	8	532419	532426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015183	TTGC	2	8	534241	534248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015183	TAAG	2	8	536363	536370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015183	AGGG	2	8	537972	537979	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015183	GGCT	2	8	544995	545002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015183	TTGG	2	8	555536	555543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015183	AACA	2	8	556997	557004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015183	CGGC	2	8	559833	559840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015183	TGAA	2	8	568820	568827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015183	TCCT	2	8	574415	574422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015183	ATAC	2	8	584477	584484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_015183	TGCA	2	8	1510479	1510486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_015183	CTAT	2	8	1560187	1560194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_015183	AACG	2	8	1561618	1561625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_015183	TCAT	2	8	1562531	1562538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_015183	CTTT	2	8	1562582	1562589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_015183	TATT	2	8	1564677	1564684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015183	CTTT	2	8	1567460	1567467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_015183	GCCA	2	8	1574095	1574102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_015183	CCCG	2	8	1587194	1587201	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_015183	ATTG	2	8	1587247	1587254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_015183	CGAG	2	8	1594175	1594182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015183	AATC	2	8	1595438	1595445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_015183	CAAG	2	8	1595464	1595471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_015183	AACC	2	8	1595525	1595532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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