MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 5206

< Previous1234567891011Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015183	GC	3	6	2701841	2701846	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5002	NC_015183	GC	3	6	2703028	2703033	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5003	NC_015183	CG	3	6	2703365	2703370	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5004	NC_015183	CG	3	6	2704414	2704419	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5005	NC_015183	GC	3	6	2704633	2704638	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5006	NC_015183	CG	4	8	2705383	2705390	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5007	NC_015183	GC	3	6	2705822	2705827	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5008	NC_015183	CG	3	6	2705973	2705978	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5009	NC_015183	GC	3	6	2706730	2706735	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5010	NC_015183	GC	3	6	2706737	2706742	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5011	NC_015183	CG	3	6	2706976	2706981	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5012	NC_015183	CG	3	6	2707926	2707931	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5013	NC_015183	CG	3	6	2708530	2708535	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5014	NC_015183	CG	3	6	2708845	2708850	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5015	NC_015183	CG	3	6	2708897	2708902	0 %	0 %	50 %	50 %	325294102
5016	NC_015183	TG	3	6	2709111	2709116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015183	CG	3	6	2709705	2709710	0 %	0 %	50 %	50 %	325294103
5018	NC_015183	AC	3	6	2709871	2709876	50 %	0 %	0 %	50 %	325294103
5019	NC_015183	CG	3	6	2710606	2710611	0 %	0 %	50 %	50 %	325294103
5020	NC_015183	TC	3	6	2710873	2710878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_015183	CT	3	6	2711474	2711479	0 %	50 %	0 %	50 %	325294104
5022	NC_015183	GC	3	6	2712622	2712627	0 %	0 %	50 %	50 %	325294105
5023	NC_015183	GC	3	6	2713064	2713069	0 %	0 %	50 %	50 %	325294105
5024	NC_015183	GC	3	6	2713234	2713239	0 %	0 %	50 %	50 %	325294105
5025	NC_015183	GA	3	6	2713850	2713855	50 %	0 %	50 %	0 %	325294106
5026	NC_015183	CA	3	6	2713901	2713906	50 %	0 %	0 %	50 %	325294106
5027	NC_015183	CG	3	6	2714389	2714394	0 %	0 %	50 %	50 %	325294106
5028	NC_015183	CG	3	6	2715760	2715765	0 %	0 %	50 %	50 %	325294107
5029	NC_015183	GC	3	6	2716175	2716180	0 %	0 %	50 %	50 %	325294108
5030	NC_015183	CG	3	6	2716710	2716715	0 %	0 %	50 %	50 %	325294108
5031	NC_015183	GC	4	8	2716907	2716914	0 %	0 %	50 %	50 %	325294108
5032	NC_015183	GC	3	6	2717698	2717703	0 %	0 %	50 %	50 %	325294109
5033	NC_015183	AT	4	8	2719756	2719763	50 %	50 %	0 %	0 %	325294111
5034	NC_015183	GC	3	6	2719991	2719996	0 %	0 %	50 %	50 %	325294111
5035	NC_015183	CG	3	6	2720134	2720139	0 %	0 %	50 %	50 %	325294111
5036	NC_015183	CT	3	6	2721597	2721602	0 %	50 %	0 %	50 %	325294113
5037	NC_015183	GC	3	6	2722380	2722385	0 %	0 %	50 %	50 %	325294113
5038	NC_015183	GC	3	6	2724082	2724087	0 %	0 %	50 %	50 %	325294115
5039	NC_015183	CG	3	6	2724826	2724831	0 %	0 %	50 %	50 %	325294115
5040	NC_015183	CG	3	6	2726704	2726709	0 %	0 %	50 %	50 %	325294116
5041	NC_015183	GA	3	6	2727572	2727577	50 %	0 %	50 %	0 %	325294117
5042	NC_015183	CG	3	6	2727949	2727954	0 %	0 %	50 %	50 %	325294118
5043	NC_015183	GC	3	6	2728044	2728049	0 %	0 %	50 %	50 %	325294118
5044	NC_015183	GC	5	10	2728055	2728064	0 %	0 %	50 %	50 %	325294118
5045	NC_015183	GC	3	6	2728396	2728401	0 %	0 %	50 %	50 %	325294118
5046	NC_015183	AG	3	6	2728677	2728682	50 %	0 %	50 %	0 %	325294118
5047	NC_015183	TC	3	6	2728743	2728748	0 %	50 %	0 %	50 %	325294118
5048	NC_015183	CT	3	6	2729088	2729093	0 %	50 %	0 %	50 %	325294118
5049	NC_015183	CG	4	8	2730353	2730360	0 %	0 %	50 %	50 %	325294118
5050	NC_015183	GA	3	6	2730598	2730603	50 %	0 %	50 %	0 %	325294119
5051	NC_015183	CG	3	6	2730879	2730884	0 %	0 %	50 %	50 %	325294119
5052	NC_015183	GC	3	6	2731823	2731828	0 %	0 %	50 %	50 %	325294120
5053	NC_015183	CA	3	6	2732361	2732366	50 %	0 %	0 %	50 %	325294121
5054	NC_015183	CG	3	6	2732781	2732786	0 %	0 %	50 %	50 %	325294122
5055	NC_015183	GC	3	6	2733941	2733946	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5056	NC_015183	GC	3	6	2734301	2734306	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5057	NC_015183	CG	3	6	2734365	2734370	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5058	NC_015183	CG	3	6	2734425	2734430	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5059	NC_015183	CG	3	6	2734538	2734543	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5060	NC_015183	TC	4	8	2734719	2734726	0 %	50 %	0 %	50 %	325294123
5061	NC_015183	GT	3	6	2734834	2734839	0 %	50 %	50 %	0 %	325294123
5062	NC_015183	TC	3	6	2734920	2734925	0 %	50 %	0 %	50 %	325294123
5063	NC_015183	GC	3	6	2735061	2735066	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5064	NC_015183	GC	3	6	2735571	2735576	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5065	NC_015183	CG	3	6	2735907	2735912	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5066	NC_015183	GC	3	6	2735994	2735999	0 %	0 %	50 %	50 %	325294123
5067	NC_015183	GA	3	6	2736858	2736863	50 %	0 %	50 %	0 %	325294124
5068	NC_015183	CA	3	6	2737475	2737480	50 %	0 %	0 %	50 %	325294124
5069	NC_015183	TC	3	6	2738545	2738550	0 %	50 %	0 %	50 %	325294125
5070	NC_015183	TA	3	6	2738897	2738902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015183	CT	3	6	2741421	2741426	0 %	50 %	0 %	50 %	325294128
5072	NC_015183	CG	3	6	2741558	2741563	0 %	0 %	50 %	50 %	325294128
5073	NC_015183	GC	3	6	2741827	2741832	0 %	0 %	50 %	50 %	325294128
5074	NC_015183	TC	3	6	2741965	2741970	0 %	50 %	0 %	50 %	325294128
5075	NC_015183	CG	3	6	2742330	2742335	0 %	0 %	50 %	50 %	325294128
5076	NC_015183	GC	3	6	2742383	2742388	0 %	0 %	50 %	50 %	325294128
5077	NC_015183	AC	3	6	2743835	2743840	50 %	0 %	0 %	50 %	325294130
5078	NC_015183	CG	3	6	2744021	2744026	0 %	0 %	50 %	50 %	325294130
5079	NC_015183	CG	3	6	2747693	2747698	0 %	0 %	50 %	50 %	325294135
5080	NC_015183	AC	3	6	2748254	2748259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_015183	CA	3	6	2748351	2748356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_015183	GC	3	6	2749295	2749300	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5083	NC_015183	CG	3	6	2749786	2749791	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5084	NC_015183	CG	3	6	2749930	2749935	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5085	NC_015183	GC	3	6	2750633	2750638	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5086	NC_015183	GC	3	6	2751063	2751068	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5087	NC_015183	CG	4	8	2751494	2751501	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5088	NC_015183	GC	3	6	2752016	2752021	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5089	NC_015183	GC	3	6	2752348	2752353	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5090	NC_015183	CG	3	6	2753147	2753152	0 %	0 %	50 %	50 %	325294136
5091	NC_015183	GC	4	8	2753796	2753803	0 %	0 %	50 %	50 %	325294137
5092	NC_015183	GC	3	6	2754716	2754721	0 %	0 %	50 %	50 %	325294137
5093	NC_015183	CA	3	6	2754837	2754842	50 %	0 %	0 %	50 %	325294137
5094	NC_015183	GA	3	6	2754930	2754935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015183	GC	3	6	2755002	2755007	0 %	0 %	50 %	50 %	325294138
5096	NC_015183	CG	3	6	2755605	2755610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_015183	GC	3	6	2755821	2755826	0 %	0 %	50 %	50 %	325294139
5098	NC_015183	GC	3	6	2755910	2755915	0 %	0 %	50 %	50 %	325294139
5099	NC_015183	GC	3	6	2756069	2756074	0 %	0 %	50 %	50 %	325294139
5100	NC_015183	GC	3	6	2756607	2756612	0 %	0 %	50 %	50 %	325294139
5101	NC_015183	CG	3	6	2757733	2757738	0 %	0 %	50 %	50 %	325294140
5102	NC_015183	CG	3	6	2758673	2758678	0 %	0 %	50 %	50 %	325294142
5103	NC_015183	CG	3	6	2758945	2758950	0 %	0 %	50 %	50 %	325294143
5104	NC_015183	GC	3	6	2759428	2759433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_015183	CG	3	6	2759610	2759615	0 %	0 %	50 %	50 %	325294144
5106	NC_015183	GC	3	6	2761048	2761053	0 %	0 %	50 %	50 %	325294145
5107	NC_015183	CG	3	6	2761121	2761126	0 %	0 %	50 %	50 %	325294145
5108	NC_015183	CG	3	6	2761493	2761498	0 %	0 %	50 %	50 %	325294145
5109	NC_015183	GC	3	6	2761680	2761685	0 %	0 %	50 %	50 %	325294145
5110	NC_015183	CG	3	6	2763350	2763355	0 %	0 %	50 %	50 %	325294146
5111	NC_015183	CG	3	6	2763974	2763979	0 %	0 %	50 %	50 %	325294147
5112	NC_015183	CA	4	8	2764183	2764190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_015183	GA	3	6	2764526	2764531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015183	GC	3	6	2766105	2766110	0 %	0 %	50 %	50 %	325294150
5115	NC_015183	GC	3	6	2766270	2766275	0 %	0 %	50 %	50 %	325294150
5116	NC_015183	CG	4	8	2766874	2766881	0 %	0 %	50 %	50 %	325294151
5117	NC_015183	CG	3	6	2767492	2767497	0 %	0 %	50 %	50 %	325294151
5118	NC_015183	GC	3	6	2767970	2767975	0 %	0 %	50 %	50 %	325294152
5119	NC_015183	GC	3	6	2768271	2768276	0 %	0 %	50 %	50 %	325294152
5120	NC_015183	CG	5	10	2768384	2768393	0 %	0 %	50 %	50 %	325294152
5121	NC_015183	AC	3	6	2769252	2769257	50 %	0 %	0 %	50 %	325294153
5122	NC_015183	GC	3	6	2770004	2770009	0 %	0 %	50 %	50 %	325294154
5123	NC_015183	CG	3	6	2770814	2770819	0 %	0 %	50 %	50 %	325294156
5124	NC_015183	AT	3	6	2772257	2772262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015183	AC	3	6	2773219	2773224	50 %	0 %	0 %	50 %	325294159
5126	NC_015183	TC	3	6	2773465	2773470	0 %	50 %	0 %	50 %	325294159
5127	NC_015183	CG	3	6	2774539	2774544	0 %	0 %	50 %	50 %	325294161
5128	NC_015183	GC	3	6	2774946	2774951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_015183	TG	3	6	2776808	2776813	0 %	50 %	50 %	0 %	325294163
5130	NC_015183	GA	4	8	2777059	2777066	50 %	0 %	50 %	0 %	325294163
5131	NC_015183	CG	3	6	2777091	2777096	0 %	0 %	50 %	50 %	325294163
5132	NC_015183	TA	3	6	2777350	2777355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_015183	GC	3	6	2779107	2779112	0 %	0 %	50 %	50 %	325294165
5134	NC_015183	TC	3	6	2779748	2779753	0 %	50 %	0 %	50 %	325294166
5135	NC_015183	GC	4	8	2780186	2780193	0 %	0 %	50 %	50 %	325294166
5136	NC_015183	CG	3	6	2780534	2780539	0 %	0 %	50 %	50 %	325294166
5137	NC_015183	CG	3	6	2781490	2781495	0 %	0 %	50 %	50 %	325294168
5138	NC_015183	CG	3	6	2781937	2781942	0 %	0 %	50 %	50 %	325294169
5139	NC_015183	GC	4	8	2782612	2782619	0 %	0 %	50 %	50 %	325294169
5140	NC_015183	GC	3	6	2782919	2782924	0 %	0 %	50 %	50 %	325294169
5141	NC_015183	CG	4	8	2783654	2783661	0 %	0 %	50 %	50 %	325294170
5142	NC_015183	GC	3	6	2784134	2784139	0 %	0 %	50 %	50 %	325294171
5143	NC_015183	CG	3	6	2784343	2784348	0 %	0 %	50 %	50 %	325294171
5144	NC_015183	GC	3	6	2785313	2785318	0 %	0 %	50 %	50 %	325294172
5145	NC_015183	GC	3	6	2786275	2786280	0 %	0 %	50 %	50 %	325294174
5146	NC_015183	GA	3	6	2786298	2786303	50 %	0 %	50 %	0 %	325294174
5147	NC_015183	TG	3	6	2786367	2786372	0 %	50 %	50 %	0 %	325294174
5148	NC_015183	GC	4	8	2786556	2786563	0 %	0 %	50 %	50 %	325294174
5149	NC_015183	CT	4	8	2786694	2786701	0 %	50 %	0 %	50 %	325294174
5150	NC_015183	CG	3	6	2786840	2786845	0 %	0 %	50 %	50 %	325294174
5151	NC_015183	CT	3	6	2787020	2787025	0 %	50 %	0 %	50 %	325294174
5152	NC_015183	CG	3	6	2787669	2787674	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5153	NC_015183	CG	5	10	2787758	2787767	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5154	NC_015183	CG	3	6	2787770	2787775	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5155	NC_015183	CG	4	8	2788572	2788579	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5156	NC_015183	CG	3	6	2789820	2789825	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5157	NC_015183	GA	3	6	2790054	2790059	50 %	0 %	50 %	0 %	325294175
5158	NC_015183	TC	4	8	2790377	2790384	0 %	50 %	0 %	50 %	325294175
5159	NC_015183	GC	3	6	2790591	2790596	0 %	0 %	50 %	50 %	325294175
5160	NC_015183	GC	3	6	2791315	2791320	0 %	0 %	50 %	50 %	325294176
5161	NC_015183	TC	3	6	2791787	2791792	0 %	50 %	0 %	50 %	325294177
5162	NC_015183	GC	3	6	2791817	2791822	0 %	0 %	50 %	50 %	325294177
5163	NC_015183	GC	3	6	2791897	2791902	0 %	0 %	50 %	50 %	325294177
5164	NC_015183	CG	3	6	2793455	2793460	0 %	0 %	50 %	50 %	325294179
5165	NC_015183	GC	3	6	2795755	2795760	0 %	0 %	50 %	50 %	325294181
5166	NC_015183	CG	3	6	2796054	2796059	0 %	0 %	50 %	50 %	325294181
5167	NC_015183	GC	5	10	2799250	2799259	0 %	0 %	50 %	50 %	325294184
5168	NC_015183	GT	3	6	2799493	2799498	0 %	50 %	50 %	0 %	325294184
5169	NC_015183	GC	3	6	2800071	2800076	0 %	0 %	50 %	50 %	325294185
5170	NC_015183	GC	3	6	2800885	2800890	0 %	0 %	50 %	50 %	325294186
5171	NC_015183	GC	4	8	2801471	2801478	0 %	0 %	50 %	50 %	325294187
5172	NC_015183	GC	3	6	2802445	2802450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5173	NC_015183	GC	3	6	2802733	2802738	0 %	0 %	50 %	50 %	325294188
5174	NC_015183	CG	3	6	2804060	2804065	0 %	0 %	50 %	50 %	325294189
5175	NC_015183	CG	3	6	2804753	2804758	0 %	0 %	50 %	50 %	325294190
5176	NC_015183	CG	3	6	2804780	2804785	0 %	0 %	50 %	50 %	325294190
5177	NC_015183	AC	3	6	2805224	2805229	50 %	0 %	0 %	50 %	325294190
5178	NC_015183	CG	3	6	2806034	2806039	0 %	0 %	50 %	50 %	325294190
5179	NC_015183	GC	4	8	2806643	2806650	0 %	0 %	50 %	50 %	325294191
5180	NC_015183	CG	3	6	2806756	2806761	0 %	0 %	50 %	50 %	325294191
5181	NC_015183	AC	3	6	2807348	2807353	50 %	0 %	0 %	50 %	325294192
5182	NC_015183	GC	3	6	2807596	2807601	0 %	0 %	50 %	50 %	325294192
5183	NC_015183	GC	3	6	2809199	2809204	0 %	0 %	50 %	50 %	325294193
5184	NC_015183	GC	4	8	2809398	2809405	0 %	0 %	50 %	50 %	325294193
5185	NC_015183	GA	3	6	2809991	2809996	50 %	0 %	50 %	0 %	325294193
5186	NC_015183	GC	3	6	2811817	2811822	0 %	0 %	50 %	50 %	325294194
5187	NC_015183	CA	4	8	2812096	2812103	50 %	0 %	0 %	50 %	325294194
5188	NC_015183	GA	3	6	2812124	2812129	50 %	0 %	50 %	0 %	325294194
5189	NC_015183	GC	3	6	2813395	2813400	0 %	0 %	50 %	50 %	325294195
5190	NC_015183	GC	3	6	2813443	2813448	0 %	0 %	50 %	50 %	325294195
5191	NC_015183	GA	3	6	2814389	2814394	50 %	0 %	50 %	0 %	325294196
5192	NC_015183	TA	3	6	2814680	2814685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5193	NC_015183	GC	5	10	2815294	2815303	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
5194	NC_015183	CG	3	6	2815589	2815594	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
5195	NC_015183	GC	3	6	2815785	2815790	0 %	0 %	50 %	50 %	325294198
5196	NC_015183	CT	4	8	2815935	2815942	0 %	50 %	0 %	50 %	325294199
5197	NC_015183	TC	3	6	2816075	2816080	0 %	50 %	0 %	50 %	325294199
5198	NC_015183	AT	3	6	2816906	2816911	50 %	50 %	0 %	0 %	325294200
5199	NC_015183	GA	3	6	2817514	2817519	50 %	0 %	50 %	0 %	325294201
5200	NC_015183	TG	3	6	2818332	2818337	0 %	50 %	50 %	0 %	325294201
5201	NC_015183	TC	3	6	2819126	2819131	0 %	50 %	0 %	50 %	325294201
5202	NC_015183	TC	3	6	2819539	2819544	0 %	50 %	0 %	50 %	325294202
5203	NC_015183	CG	3	6	2820281	2820286	0 %	0 %	50 %	50 %	325294202
5204	NC_015183	AG	3	6	2821705	2821710	50 %	0 %	50 %	0 %	325294203
5205	NC_015183	GC	3	6	2823056	2823061	0 %	0 %	50 %	50 %	325294205
5206	NC_015183	TA	3	6	2823924	2823929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous1234567891011Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.