MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV5

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015180	CAGA	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	325168243
2	NC_015180	CCGG	2	8	191	198	0 %	0 %	50 %	50 %	325168243
3	NC_015180	CCGA	2	8	261	268	25 %	0 %	25 %	50 %	325168243
4	NC_015180	CCGT	2	8	916	923	0 %	25 %	25 %	50 %	325168243
5	NC_015180	ATCG	2	8	953	960	25 %	25 %	25 %	25 %	325168243
6	NC_015180	CGAC	2	8	995	1002	25 %	0 %	25 %	50 %	325168243
7	NC_015180	TCCC	2	8	1047	1054	0 %	25 %	0 %	75 %	325168243
8	NC_015180	GCCT	2	8	1132	1139	0 %	25 %	25 %	50 %	325168243
9	NC_015180	GACG	2	8	1974	1981	25 %	0 %	50 %	25 %	325168244
10	NC_015180	GCGG	2	8	2380	2387	0 %	0 %	75 %	25 %	325168245
11	NC_015180	CCAG	2	8	2551	2558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015180	CAGG	2	8	2581	2588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015180	GCTG	2	8	2906	2913	0 %	25 %	50 %	25 %	325168246
14	NC_015180	CGGG	3	12	3990	4001	0 %	0 %	75 %	25 %	325168249
15	NC_015180	TGGG	2	8	4354	4361	0 %	25 %	75 %	0 %	325168249
16	NC_015180	TGGC	2	8	4691	4698	0 %	25 %	50 %	25 %	325168249
17	NC_015180	GTCC	2	8	4737	4744	0 %	25 %	25 %	50 %	325168249
18	NC_015180	GCGA	2	8	4800	4807	25 %	0 %	50 %	25 %	325168249
19	NC_015180	CGAT	2	8	4815	4822	25 %	25 %	25 %	25 %	325168249
20	NC_015180	GACC	2	8	4838	4845	25 %	0 %	25 %	50 %	325168249
21	NC_015180	GCCG	2	8	4862	4869	0 %	0 %	50 %	50 %	325168249
22	NC_015180	GGGC	2	8	4984	4991	0 %	0 %	75 %	25 %	325168249
23	NC_015180	GATC	2	8	5105	5112	25 %	25 %	25 %	25 %	325168249
24	NC_015180	AACC	2	8	5371	5378	50 %	0 %	0 %	50 %	325168249
25	NC_015180	GATC	2	8	5993	6000	25 %	25 %	25 %	25 %	325168249
26	NC_015180	AATC	2	8	6220	6227	50 %	25 %	0 %	25 %	325168250
27	NC_015180	CGGC	2	8	6484	6491	0 %	0 %	50 %	50 %	325168250
28	NC_015180	CGTC	2	8	6934	6941	0 %	25 %	25 %	50 %	325168251
29	NC_015180	CCGC	2	8	7862	7869	0 %	0 %	25 %	75 %	325168251
30	NC_015180	CCCT	2	8	7959	7966	0 %	25 %	0 %	75 %	325168252
31	NC_015180	CCCG	2	8	8076	8083	0 %	0 %	25 %	75 %	325168252
32	NC_015180	GAAG	2	8	8347	8354	50 %	0 %	50 %	0 %	325168252
33	NC_015180	GCTC	2	8	8359	8366	0 %	25 %	25 %	50 %	325168252
34	NC_015180	TATG	2	8	8836	8843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015180	GCTG	2	8	9082	9089	0 %	25 %	50 %	25 %	325168254
36	NC_015180	TTGG	2	8	9660	9667	0 %	50 %	50 %	0 %	325168255
37	NC_015180	GCCC	2	8	9886	9893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_015180	TGAT	2	8	10426	10433	25 %	50 %	25 %	0 %	325168256
39	NC_015180	GACC	2	8	10697	10704	25 %	0 %	25 %	50 %	325168256
40	NC_015180	TAGC	2	8	10886	10893	25 %	25 %	25 %	25 %	325168256
41	NC_015180	CGAC	2	8	11317	11324	25 %	0 %	25 %	50 %	325168257
42	NC_015180	GTCA	2	8	11619	11626	25 %	25 %	25 %	25 %	325168257
43	NC_015180	CCTG	2	8	12055	12062	0 %	25 %	25 %	50 %	325168258
44	NC_015180	TTCC	2	8	12100	12107	0 %	50 %	0 %	50 %	325168258
45	NC_015180	CGGC	2	8	12801	12808	0 %	0 %	50 %	50 %	325168259
46	NC_015180	GTTG	2	8	13192	13199	0 %	50 %	50 %	0 %	325168259
47	NC_015180	TCAT	2	8	13224	13231	25 %	50 %	0 %	25 %	325168259
48	NC_015180	AGAC	2	8	13606	13613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015180	GGTG	2	8	13683	13690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015180	CTCG	2	8	13696	13703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015180	GGAC	2	8	13783	13790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015180	CAAG	2	8	13892	13899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.