MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV5

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015180	CGG	2	6	114	119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168243
2	NC_015180	GGC	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168243
3	NC_015180	GGC	2	6	165	170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168243
4	NC_015180	GTT	2	6	219	224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168243
5	NC_015180	GCC	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168243
6	NC_015180	TCG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168243
7	NC_015180	GAG	2	6	514	519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168243
8	NC_015180	CGG	2	6	535	540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168243
9	NC_015180	CGA	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168243
10	NC_015180	GCC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168243
11	NC_015180	CGA	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168243
12	NC_015180	GAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168243
13	NC_015180	CGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168243
14	NC_015180	AGG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168243
15	NC_015180	CCA	2	6	816	821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168243
16	NC_015180	GCC	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168243
17	NC_015180	CCG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168243
18	NC_015180	GAG	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168244
19	NC_015180	GCC	2	6	1633	1638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168244
20	NC_015180	TTG	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168244
21	NC_015180	GCG	2	6	1707	1712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168244
22	NC_015180	CGG	2	6	1713	1718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168244
23	NC_015180	GGC	2	6	1908	1913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168244
24	NC_015180	TGA	2	6	1946	1951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168244
25	NC_015180	CCA	3	9	1960	1968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168244
26	NC_015180	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168244
27	NC_015180	GCA	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168244
28	NC_015180	GGC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168244
29	NC_015180	CAG	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168245
30	NC_015180	AGG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168245
31	NC_015180	CAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168245
32	NC_015180	GCC	2	6	2933	2938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168246
33	NC_015180	GAC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168246
34	NC_015180	CGA	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168246
35	NC_015180	CAT	2	6	3138	3143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168246
36	NC_015180	GCC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168247
37	NC_015180	GCG	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168248
38	NC_015180	GGC	2	6	3741	3746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168248
39	NC_015180	GGC	2	6	3780	3785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168248
40	NC_015180	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168248
41	NC_015180	CGC	2	6	3881	3886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168248
42	NC_015180	GTT	2	6	3901	3906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168248
43	NC_015180	CCG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
44	NC_015180	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
45	NC_015180	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
46	NC_015180	GCC	2	6	4096	4101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
47	NC_015180	GAT	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168249
48	NC_015180	GGC	2	6	4214	4219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
49	NC_015180	ATC	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168249
50	NC_015180	TGG	3	9	4285	4293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168249
51	NC_015180	CCG	2	6	4299	4304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
52	NC_015180	AGC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168249
53	NC_015180	GGC	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
54	NC_015180	TTC	2	6	4473	4478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168249
55	NC_015180	GGC	2	6	4505	4510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
56	NC_015180	GCG	2	6	4587	4592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
57	NC_015180	GGC	2	6	4712	4717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
58	NC_015180	TGA	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168249
59	NC_015180	GCG	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
60	NC_015180	TGT	2	6	4961	4966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168249
61	NC_015180	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
62	NC_015180	CGC	2	6	5060	5065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
63	NC_015180	CGG	2	6	5169	5174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
64	NC_015180	CCG	2	6	5214	5219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168249
65	NC_015180	AGC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168249
66	NC_015180	TGA	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168249
67	NC_015180	GGC	2	6	5401	5406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
68	NC_015180	AGG	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168249
69	NC_015180	GGC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
70	NC_015180	TCG	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168249
71	NC_015180	GAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168249
72	NC_015180	CTG	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168249
73	NC_015180	GGC	2	6	5588	5593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168249
74	NC_015180	ATG	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168249
75	NC_015180	GCA	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168249
76	NC_015180	ACC	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168250
77	NC_015180	CAT	2	6	6433	6438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168250
78	NC_015180	CTC	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168250
79	NC_015180	CAT	2	6	6584	6589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168251
80	NC_015180	TTC	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168251
81	NC_015180	CTC	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168251
82	NC_015180	GAC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168251
83	NC_015180	CGA	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168251
84	NC_015180	CTT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168251
85	NC_015180	CAC	2	6	6921	6926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168251
86	NC_015180	GCC	2	6	6954	6959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168251
87	NC_015180	CAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168251
88	NC_015180	GTC	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168251
89	NC_015180	GAT	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168251
90	NC_015180	CGC	3	9	7155	7163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168251
91	NC_015180	CTT	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168251
92	NC_015180	CGA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168251
93	NC_015180	GAG	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168251
94	NC_015180	CCG	2	6	7327	7332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168251
95	NC_015180	CGA	2	6	7337	7342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168251
96	NC_015180	GGA	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168251
97	NC_015180	CGC	2	6	7425	7430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168251
98	NC_015180	ATG	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168251
99	NC_015180	CGC	2	6	7482	7487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168251
100	NC_015180	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168251
101	NC_015180	AAT	2	6	7779	7784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168251
102	NC_015180	GTT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168251
103	NC_015180	AGG	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168251
104	NC_015180	GCC	2	6	8005	8010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168252
105	NC_015180	ACC	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168252
106	NC_015180	GAG	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168252
107	NC_015180	GCT	2	6	8181	8186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168252
108	NC_015180	CCA	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168252
109	NC_015180	GGC	2	6	8215	8220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168252
110	NC_015180	CGT	2	6	8319	8324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168252
111	NC_015180	CAA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168253
112	NC_015180	CGG	2	6	8514	8519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168253
113	NC_015180	CTT	2	6	8646	8651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168253
114	NC_015180	AGC	2	6	8738	8743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168253
115	NC_015180	GCG	2	6	8968	8973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168254
116	NC_015180	GCC	2	6	9015	9020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168254
117	NC_015180	CGC	2	6	9139	9144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168254
118	NC_015180	CGG	2	6	9190	9195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168254
119	NC_015180	CGA	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168255
120	NC_015180	AAG	2	6	9479	9484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168255
121	NC_015180	CAT	3	9	9498	9506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168255
122	NC_015180	CTG	2	6	9619	9624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168255
123	NC_015180	AGA	2	6	9636	9641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168255
124	NC_015180	TGC	3	9	9677	9685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168255
125	NC_015180	GCC	3	9	9707	9715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168255
126	NC_015180	GTG	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168255
127	NC_015180	ATC	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168256
128	NC_015180	TCA	2	6	10388	10393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168256
129	NC_015180	GTA	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168256
130	NC_015180	ATT	2	6	10470	10475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168256
131	NC_015180	TCC	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168256
132	NC_015180	GGA	2	6	10507	10512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168256
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.