MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV3

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015179	CGGAC	2	10	92	101	20 %	0 %	40 %	40 %	325113278
2	NC_015179	CGCGG	2	10	753	762	0 %	0 %	60 %	40 %	325113278
3	NC_015179	GGCCT	2	10	1083	1092	0 %	20 %	40 %	40 %	325113278
4	NC_015179	GGCGA	2	10	4142	4151	20 %	0 %	60 %	20 %	325113282
5	NC_015179	GCGGT	2	10	4535	4544	0 %	20 %	60 %	20 %	325113283
6	NC_015179	CCGGA	2	10	6107	6116	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015179	GAATA	2	10	7544	7553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015179	AAATC	2	10	8082	8091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015179	GCGCC	2	10	10106	10115	0 %	0 %	40 %	60 %	325113288
10	NC_015179	TCAGG	2	10	10711	10720	20 %	20 %	40 %	20 %	325113289
11	NC_015179	TCGGC	2	10	10882	10891	0 %	20 %	40 %	40 %	325113289
12	NC_015179	GCGCG	2	10	11356	11365	0 %	0 %	60 %	40 %	325113290
13	NC_015179	GATCA	2	10	11638	11647	40 %	20 %	20 %	20 %	325113290
14	NC_015179	GCCGG	2	10	12243	12252	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015179	CGAGG	2	10	14198	14207	20 %	0 %	60 %	20 %	325113292
16	NC_015179	CACAT	2	10	14810	14819	40 %	20 %	0 %	40 %	325113293
17	NC_015179	GTAGC	2	10	16153	16162	20 %	20 %	40 %	20 %	325113293
18	NC_015179	TCTGA	2	10	17316	17325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015179	CCAGG	2	10	17841	17850	20 %	0 %	40 %	40 %	325113297
20	NC_015179	CGGTG	2	10	21179	21188	0 %	20 %	60 %	20 %	325113302
21	NC_015179	GGACG	2	10	21230	21239	20 %	0 %	60 %	20 %	325113302
22	NC_015179	GCGGT	2	10	22380	22389	0 %	20 %	60 %	20 %	325113302
23	NC_015179	TGACC	2	10	22556	22565	20 %	20 %	20 %	40 %	325113302
24	NC_015179	TCCGG	2	10	23053	23062	0 %	20 %	40 %	40 %	325113302
25	NC_015179	GGCGG	2	10	23615	23624	0 %	0 %	80 %	20 %	325113302
26	NC_015179	CGAGG	2	10	24754	24763	20 %	0 %	60 %	20 %	325113304
27	NC_015179	CGAAC	2	10	25092	25101	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015179	TCTGA	2	10	25170	25179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015179	TCCAG	2	10	26097	26106	20 %	20 %	20 %	40 %	325113305
30	NC_015179	TTGAT	2	10	27682	27691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015179	CGGCT	2	10	29441	29450	0 %	20 %	40 %	40 %	325113308
32	NC_015179	CTACC	2	10	30062	30071	20 %	20 %	0 %	60 %	325113308
33	NC_015179	TGCCA	2	10	30293	30302	20 %	20 %	20 %	40 %	325113308
34	NC_015179	ACCGC	2	10	31629	31638	20 %	0 %	20 %	60 %	325113310
35	NC_015179	AACGG	2	10	33173	33182	40 %	0 %	40 %	20 %	325113311
36	NC_015179	GCAAG	2	10	33443	33452	40 %	0 %	40 %	20 %	325113312
37	NC_015179	TGCGG	2	10	38329	38338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015179	TGCGG	2	10	38342	38351	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015179	TGACA	2	10	39042	39051	40 %	20 %	20 %	20 %	325113318
40	NC_015179	ACATT	2	10	41066	41075	40 %	40 %	0 %	20 %	325113321
41	NC_015179	GCGAT	2	10	41203	41212	20 %	20 %	40 %	20 %	325113321
42	NC_015179	GCCGG	2	10	45866	45875	0 %	0 %	60 %	40 %	325113327
43	NC_015179	GAATT	2	10	45893	45902	40 %	40 %	20 %	0 %	325113327
44	NC_015179	AGGCA	2	10	46926	46935	40 %	0 %	40 %	20 %	325113328
45	NC_015179	CGCTC	2	10	47924	47933	0 %	20 %	20 %	60 %	325113330
46	NC_015179	AGCTG	2	10	48133	48142	20 %	20 %	40 %	20 %	325113330
47	NC_015179	TGGCG	2	10	49415	49424	0 %	20 %	60 %	20 %	325113333
48	NC_015179	CGATC	2	10	50805	50814	20 %	20 %	20 %	40 %	325113335
49	NC_015179	TGCCC	2	10	51608	51617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_015179	CGGGT	2	10	52669	52678	0 %	20 %	60 %	20 %	325113336
51	NC_015179	CGGTC	2	10	52729	52738	0 %	20 %	40 %	40 %	325113336
52	NC_015179	AATCG	2	10	53633	53642	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.